Ο Ζον προσπαθεί να πείσει την Κάρα ότι το κλίμα απέναντι στους εξωγήινους αλλάζει. Μια νέα δημοσιογράφος έρχεται στην CatCo κι η Λένα επανασυνδέεται με τη μητέρα της.

Μια συγκλονιστική αποκάλυψη προκαλεί θυμό και δυσαρέσκεια ενώ η Μέρσι Γκρέιβς παραμένει ελεύθερη. Η Νία μιλά στον Τζέιμς και η Λ-Κορπ δέχεται επίθεση.

Ένα επεισόδιο αναδρομής που αποκαλύπτει την προέλευση του πράκτορα της Ελευθερίας, ακολουθώντας την σκοτεινή του άνοδο που τροφοδοτείται από την οργή κατά των εξωγήινων.

Με τον αέρα ακόμα να κατακλύζεται από επικίνδυνο κρυπτονίτη, πολλοί ήρωες θέτουν σε κίνδυνο τη ζωή τους. Κατά την αναζήτηση της Φιόνας, ο Ζον βρίσκει έναν σύμμαχο.

Ο πράκτορας της Ελευθερίας αποκτά ένα ανησυχητικό όπλο στον πόλεμό του για να "σώσει" την ανθρωπότητα. Ζον και Κάρα συνεργάζονται για να ανακτήσουν ένα ισχυρό φυλαχτό.

Η Ημέρα των Ευχαριστιών πλησιάζει και ο πράκτορας της Ελευθερίας διαδίδει το μανιφέστο του μίσους, ενώ οι Τζέιμς, Άλεξ και Κάρα αγωνίζονται να αποτρέψουν ένα κύμα βίας.

Η προσπάθεια της Σούπεργκερλ και του Μάντσεστερ Μπλακ για να εντοπίσουν τον πράκτορα της Ελευθερίας παίρνει σκοτεινή τροπή. Η Λένα διεξάγει την πρώτη σειρά δοκιμών.

Η Νία μιλά στην Κάρα και στον Μπρέινι για το προφητικό της όνειρο και την ενθαρρύνουν να ακολουθήσει το πεπρωμένο της. Ο Μάντσεστερ Μπλακ επισκέπτεται τον Μπεν Λόκγουντ.

Η Σούπεργκερλ συνεργάζεται με τους Φλας, Πράσινο Βέλος και Σούπερμαν σε μια αποστολή για να βρουν ένα σημαντικό βιβλίο και να ξαναγράψουν μια αλλοιωμένη πραγματικότητα.

Η Σχης Χέιλι έχει βάλει σκοπό να αποκαλύψει την ταυτότητα της Σούπεργκερλ, αλλά η Άλεξ θέλει να την προστατέψει. Ο Μπρέινι ωθεί τη Νία να αξιοποιήσει τα χαρίσματά της.

Ένα νέο ναρκωτικό που κυκλοφορεί στους δρόμους της Νάσιοναλ Σίτι χαρίζει υπερδυνάμεις σε απλούς ανθρώπους. Η Κάρα συνοδεύει τη Νία σε μια επίσκεψη στην οικογένειά της.

Ο Άγιος Βαλεντίνος πρέπει να περιμένει, καθώς ο Ζον και η Κάρα είναι απασχολημένοι με μια υπόθεση που σχετίζεται με μια έρευνα του ΤΜΑ και με έναν νέο τρομακτικό κακό.

Ο Μάντσεστερ Μπλακ επιστρέφει στη δράση με μια νεοσυσταθείσα ομάδα συμμάχων που είναι γνωστή ως η "Ελίτ". Παράλληλα, η Νία αφοσιώνεται κι άλλο στις προπονήσεις της.

Εξαιτίας της οξύτητας στις σχέσεις ανθρώπων-εξωγήινων, η Σούπεργκερλ αναγκάζεται να επέμβει για τη διατήρηση της ειρήνης. Μια δύσκολη αποστολή κλονίζει την Άλεξ.

Ο Λεξ Λούθορ επισκέπτεται τη Λένα και εκμεταλλεύεται τη συμπόνοια της. Με τη ζωή του Τζέιμς να είναι σε κίνδυνο, ο Ζον και η Κάρα κυνηγούν τον Μάντσεστερ Μπλακ.

Αναδρομές αποκαλύπτουν ότι η επιστροφή του Λεξ Λούθορ ήταν μέρος ενός μεγαλύτερου σχεδίου που περιλάμβανε τη Λένα και την Κάρα, καθώς και έναν πανίσχυρο σωσία.

Ο Λεξ Λούθορ είναι ακόμη ελεύθερος και η Σούπεργκερλ, η Άλεξ και η Λένα κυνηγούν την πιο πιστή ακόλουθή του. Ο αναστατωμένος Ζον καλεί το πνεύμα του πατέρα του.

Η Λένα και η Σούπεργκερλ ψάχνουν το Νησί Στράικερ για στοιχεία που μπορεί να τις οδηγήσουν στον Λεξ. Ο Τζέιμς κάνει ψυχοθεραπεία και ο Μπρέινι έχει μια κρίση συνείδησης.

Η Οραματίστρια αναλαμβάνει να προστατεύσει την πόλη και η Κάρα να ξεσκεπάσει τον Λεξ και να καθαρίσει το όνομα της Σούπεργκερλ. Ο Τζέιμς αντιμετωπίζει ένα βασικό τραύμα.

Η Κάρα έρχεται αντιμέτωπη με την Κόκκινη Κόρη. Παράλληλα, ο Μπρέινι ηγείται μιας αποστολής διάσωσης εξωγήινων και ο Λόκγουντ μαθαίνει την αλήθεια για τον Λεξ.

Ο Λεξ προσκαλεί τη Λένα και τη Λίλιαν στον Λευκό Οίκο και, στη συνέχεια, ετοιμάζεται να πολεμήσει τη Σούπεργκερλ σε μια επική μάχη με επίγειες συνέπειες.