Když se v National City objeví nová hrozba, Kara začne spolupracovat se svým bratrancem Supermanem, aby hrozbu odvrátili. Kara je ráda, že člen její rodiny zavítal do města, ale Alex to moc netěší. Mezitím Hank a Supergirl jsou překvapeni, koho nacházejí v záchranném modulu.

Cadmus vysílá do boje Metalla, vylepšeného člověka, který byl primárně nastaven, aby zničil Karu a Clarka. Oba hrdinové si uvědomí, že na boj s Metallem nestačí, a proto spojí síly s jinými spojenci. Kara poznává svého nového šéfa Snappera Carra.

Prezidentka čelí útoku a Supergirl a DEO jsou nasazeni, aby prezidentku před dalšími útoky ochránili. Alex mezitím spojuje síly s detektivkou Maggie Sawyerovou. Kara pátrá po Mon-Elovi, o kterém si myslí, že by mohl stát za útoky na prezidentku USA.

Mon-El se v DEO děsně nudí a snaží se přijít na to, jak se zabavit. Hank se snaží sblížit s M'gann, ale ta odmítá. Alex kontaktuje Maggie kvůli případu a Kara se nestačí divit, jak se ty dvě doplňují. Vypadá to, že je ve městě nelegální klub rváčů, kde mezi sebou na život a na smrt bojují mimozemšťané.

Kara se snaží přetvořit Mon-Ela v sebe, což se jí moc nedaří. Alex se sbližuje s Maggie. James se rozhodne něco udělat se svým životem, protože chce pomáhat lidem, stejně jako Supergirl. Supergirl je překvapená, když na ni lupiči použijí mimozemskou technologii. Myslí si, že je za tím Cadmus, ale musí to dokázat a technologii stáhnout z ulic.

Výzkumná stanice v Norsku nalezla tělo zmrzlého vlka, který je starý přes 3 000 let. Jenže tělo není studené, nýbrž teplé. Vědci zjišťují důvod, kterým je parazit hledající nového hostitele. Kara se snaží pomoci Mon-Elovi. Alex řeší dilema se svojí orientací a jak to říci své rodině.

Kara není nadšená z nového strážce - Guardiana. Chce ho dostat ze hry. Obzvlášť, když to vypadá, že je to vrah. Hank se zotavuje po transfuzi od M'gann, ale její krev přináší následky. A aby toho nebylo málo, tak Cadmus unesl Mon-Ela. Supergirl se ho vydala zachránit, ale Cadmus od ní něco vyžaduje. Také se zde setkává s novým nepřítelem - Cyborg Supermanem a starým známým.

Je Díkuvzdání a u Kary se kromě její matky a Alex setkají ještě Winn, James a Mon-El. James s Winnem se snaží přijít na to, jak Kaře říct pravdu o Guardianovi a Alex se rozhodla vyjít s pravdou ven o své orientaci. Kara musí pořád přemýšlet nad tím, co jí řekla Elisa o Mon-Elovi a jeho potenciálních citech k ní. Cadmus podnikl kroky a rozhodl se spustit Medusu, plyn vraždící pouze mimozemšťany.

Supergirl se cítí nedoceněná, proto jako Kara vezme případ ztracené dívky, jejíž matka přijde do CatCo. Později zjistí, že není jediná, kdo je pohřešovaná. Alex je v sedmém nebi z nové přítelkyně, za to Winn se cítí jako nula.

Mezi Karou a Mon-Elem panuje trapné napětí. Alex se snaží vymluvit z pozemských narozenin, které slaví každý rok s Karou. A aby toho nebylo málo, tak jsou Hank a M'gann pod útokem White Martianů, kteří se infiltrují mezi členy DEO. Hank se tak musí postavit svému úhlavnímu nepříteli a M'gann zase svému manželovi.

Lena si prochází těžkým obdobím, protože musí svědčit proti své adoptivní matce. Kara se rozhodne ji navštívit a podpořit. Když se Lena zmíní, že se s ní chce Lilian sejít, Kara ji přesvědčí, aby své matce vyšla vstříc. Lilian ale uteče a jako hlavní podezřelá je právě Lena.

Magický skřítek z páté dimenze, Pan Mxyzptlk, se z ničeho nic objeví u Kary v bytě. Vyzná jí lásku a požádá ji o ruku. Kara žádost slušně zamítne. Pan Mxyzptlk se ale odmítá tak snadno vzdát a chce dosáhnout, aby se do něj Kara zamilovala. Alex se těší, že konečně stráví svátek svatého Valentýna s někým, koho miluje. Maggie však svátek nesnáší. Winn tráví Valentýna v baru sám. Když se připlete do konfliktu se dvěma mimozemšťany, zachrání ho pěkná mimozemšťanka Lyra Strayd.

Kara s Mon-Elem se dali dohromady, a i když se Kara snaží, aby o tom nikdo nevěděl, tak Mon-El je jiného názoru. Do toho se ve hře objeví zase Cadmus. Když to Kara s Hankem letí prověřit, narazí na starou známou tvář.

Cadmus díky seznamu, který Jeremiah ukradl z DEO, unáší všechny mimozemšťany. Alex je naštvaná na svého otce a chce přijít na to, co se opravdu děje a zda může otci věřit či ne. Kara je zase naštvaná na svého šéfa, protože nechce napsat do novin zprávu o úniku seznamu, aby varoval všechny mimozemšťany. Obě sestry tak stojí na hranici a musí se rozhodnout, co je správné a co ne.

Na Zemi přistála cizí loď, která vyžaduje vydání Mon-Ela. Kara jim v tom chce zabránit, ale při jejím ohrožení života se Mon-El sám vydává. Kara se jen tak nechce vzdát a doprovází Mon-Ela na loď, kde oba čekají nečekaná překvapení. Winn má mezitím dva dny na očištění svého jména a najití jeho mimozemské přítelkyně Lyry, aby ho nezavřeli za krádež Van Goghova obrazu.

Poté, co se Kara a Mon-El dali zase dohromady, musí Kara čelit jiným nástrahám. Zjistí se, že na její mrtvé tělo byla vypsaná odměna. Mon-El tuší, kdo by za tím mohl být, jen se to musí dokázat. Maggie potkává svoji bývalou přítelkyni a s ní se na povrch dostávají tajemství, o kterých Alex neměla ani tušení.

Kara nemá jako Supergirl co na práci, proto se jako nezaměstnaná šíleně nudí, dokud za ní do bytu nepřijde Lana s prosbou o pomoc. Potřebuje doprovod na tiskovou konferenci jejího bývalého přítele, s čímž Kara nadšeně souhlasí. Je ale Jack Spheer opravdu ten, za koho se vydává? Winnovi se mezitím podaří přemluvit Jamese, aby mu s bojováním proti zločinu mohla pomáhat Lyra. Je to ale dobrý nápad?

Maggie není nadšená ze Supergirl, která zničila svým zásahem policejní práci a k tomu rozbila pár zdí. Díky tomu se do sebe Maggie s Karou pustí na společné večeři u Alex, jejímž ukončením je odejití Kary s Mon-Elem. Druhý den hledá Maggie Alex, ale marně. Alex je totiž unesená a Kaře hrozí jejím zabitím, pokud nesplní únoscům požadavky. Únosci totiž znají její tajemství. Teď nezbývá Kaře a Maggie nic jiného, než aby spolupracovaly a Alex zachránily. Mezitím se Lena setkává s Rheou, která se snaží, aby L-Corp přijal její nabídku.

James má jako Guardian problémy, protože si uvědomil, že místo toho, aby lidi inspiroval, tak je děsí. Když je na náměstí přítomen útoku mimozemšťana, vydá se po jeho stopě, i když ho DEO z toho vyřadilo. V místě bydliště útočnice najde jejího syna, který se Jamesovi otevře. Ale i syn způsobí napadení, kdy ohrozí všechny lidi v CatCo. Zjistí se, že útoky souvisí s teleportačním portálem, na kterém pracuje Lena s Rheou.

Rhea podnikla invazi na Zemi, ze které chce udělat nový Daxam. Aby si daxamité na novou zemi a její obyvatele zvykli, donutí Mon-Ela a Lenu ke svatbě. Mezitím se Kara potýká s nečekanou návštěvou staré známé, tajemstvím prezidentky USA, a aby tomu nebylo málo, musí spolupracovat se svým nepřítelem - Cadmusem. Podaří se Kaře zachránit Zemi a své dvě blízké osoby?

Supergirl se střetne se Supermanem, kterého ovládá Rhea. Po té, co nad ním zvítězí, oba zjistí jedinou možnost, jak daxamity vyhostit ze Země, a to starodávným obřadem, ve kterém se Supergirl a Rhea utkají. I když všichni Supergirl věří, existuje záložní plán, na kterém pracují Lena s její matkou a Winnem. Podaří se Kaře porazit Rheu, nebo bude muset využít tajné zbraně, která by jí zničila štěstí?