내셔널 시티에서 언론재벌 캣 그랜트의 비서로 일하며 평범한 삶에 적응해가는 카라 조엘. 그러나 크립톤인의 비밀스러운 슈퍼파워를 계속 외면할 수는 없다.

카라는 슈퍼파워를 사용해 보려고 하지만 생각만큼 잘 되지 않는다. 슈퍼걸에 대해 의구심이 생긴 캣은 특종을 따내라며 제임스를 압박한다.

슈퍼맨의 가장 강한 적수 중 하나인 리액트론에 맞서 모든 슈퍼파워를 발휘해야 하는 슈퍼걸. 한편 슈퍼걸의 정체를 의심하는 캣은 폭로 기사를 준비한다.

추수감사절을 맞아 카라의 양어머니가 내셔널 시티를 찾은 가운데, 캣코 직원이 사고로 악당 라이브와이어로 변하면서 다사다난한 연휴가 이어진다.

카라가 캣의 아들을 돌보게 된 날, 내셔널 시티에 폭탄 공격이 쏟아지면서 슈퍼걸이 나서야 하는 상황이 된다. 한편 제임스의 전 여자친구가 찾아온다.

샘 레인 장군이 지시한 훈련 중에 분노를 자제하지 못하는 카라. 알렉스는 윈에게 아버지의 죽음을 조사해달라고 부탁한다.

지진으로 내셔널 시티가 마비되었지만 카라는 슈퍼파워 없이 버텨내야 한다. 한편 DEO에서는 행크에 대한 알렉스의 의심이 한계를 넘어선다.

한때 사랑했던 아스트라 이모가 어머니에 대한 믿음을 뒤흔들어 놓자 상처받는 카라. 한편 캣은 이메일 파문 때문에 사장 자리에서 쫓겨날 위기에 처한다.

온순한 비서 카라가 슈퍼걸이라고 확신하는 캣. 게다가 아스트라와 논까지 카라를 위협하자 카라는 양면 작전을 펼쳐야 한다.

맥스웰 로드의 비밀 계획을 밝혀달라고 행크에게 부탁하는 알렉스. 캣이 루시에게 일자리를 제안하면서 루시와 제임스의 관계가 꼬이고, 윈의 아버지는 탈옥을 감행한다.

외계인에 반대하던 정치인이 백색 화성인에게 납치된 가운데, 행크는 카라의 도움으로 과거와 마주한다. 카라는 캣과 소원해진 큰아들의 만남을 주선한다.

자신을 노리는 사악한 도플갱어에 맞서 싸우는 슈퍼걸. 한편 캣의 큰아들 애덤과 카라 사이에 호감이 싹트기 시작한다.

기생 동물에게 공격당한 카라는 크립톤이 여전히 존재한다는 환각에서 헤어나지 못한다. 한편, 행크와 알렉스는 슈퍼걸이 없는 상태에서 논의 공격을 막아내야 한다.

캣코에 새로 온 교활한 비서 때문에 골치가 아픈 카라. 슈퍼걸은 마스터 제일러와 맞서고, 제임스가 DEO의 방식에 의문을 제기하면서 제임스와 카라의 관계가 불편해진다.

인터넷 여행자 인디고를 어떻게 물리칠지 고민하던 카라는 슈퍼맨의 기지인 고독의 요새에서 정보를 얻는다. 한편 제임스와 루시는 둘의 관계에 대해 다시 생각해 본다.

레드 크립토나이트 때문에 악당으로 변한 카라는 캣코와 DEO에서 옷차림과 행동이 180도 달라진다. 한편 알렉스와 로드는 불안한 동맹을 맺는다.

행크가 DEO에 어떻게 오게 되었고 아버지와 어떤 관계인지 알게 되는 알렉스와 카라. 악당 슈퍼걸이 남긴 여파를 수습해야 하는 카라는 닥치는 대로 먹어댄다.

'미리어드'라는 세뇌 기술을 이용해 내셔널 시티 주민들을 좀비 같은 군대로 만드려는 논. 이 기술이 통하지 않는 이는 카라와 캣뿐이다.

지구인들을 몰살하려는 논과 인디고. 이들의 계획을 저지하기 위해 슈퍼걸은 사랑하는 사람을 상대로 목숨을 건 싸움을 벌여야 한다.