Dix ans après qu'on a guéri les animaux au prix de la stérilisation des humains, Jackson retrouve l'équipe dans la foulée de nouvelles attaques mystérieuses.

Un lien émerge entre les attaques des hybrides. Mitch rencontre une femme qui dit être sa fille. Les recherches d'Abraham sur la stérilité prennent un tour dangereux.

Abe et Dariela envisagent des mesures radicales pour protéger leur famille, pendant que Jamie et Clementine effectuent une intervention chirurgicale risquée sur Mitch.

Tandis que les hybrides se rapprochent de New York, Abe et Dariela retrouvent l'équipe en vue de découvrir quelle force attire les créatures.

Derrière les barreaux, Jamie trouve comment amener Mitch et Logan à traquer les mystérieux Bergers. Jackson révèle le sort de sa famille à Tessa au Mexique.

Pendant que Mitch tente de délivrer Clementine de ses ravisseurs, un bref retour dans le passé montre ce qui relie Abigail aux hybrides.

L'équipe tente de sauver le fils d'Abe et Dariela, ainsi que d'autres enfants disparus. Mitch et Jamie croisent la route d'une personne familière du passé.

Pour faire avancer son plan secret, Abigail prend Jackson en otage et l'interroge. L'avion de l'équipe subit des défaillances en plein vol.

Après avoir retrouvé Mitch à Copenhague, l'équipe rencontre son alter ego, M. Duncan. Logan part pour la Corée pour enquêter sur un nid d'hybrides.

Pendant qu'Abigail s'accroche à la vie, Jackson demande l'aide d'Abe. De son côté, Jamie propose un marché à M. Duncan.

L'équipe reste coincée dans l'avion en raison de spores toxiques. Clementine est sur le point d'accoucher, mais elle vit des complications.

Quand l'équipe reste coincée dans la zone hybride après une crise soudaine, Tessa et Dariela organisent une mission de sauvetage.

Jackson et l'équipe cherchent vite à éliminer la dernière balise, alors que les hybrides veulent percer le mur. Abigail tente de mettre la main sur le bébé de Clementine.