Los movimientos de Cuatro por llevar a cabo su plan y, por otro lado, los de la tripulación de la Raza decidiendo si luchan sólo por su supervivencia, o si se dedican a ayudar a los más débiles en la guerra, impulsan buena parte de la tercera temporada. Muchos de los asuntos introducidos en las dos primeras se retoman y profundizan, y sus protagonistas están ante el mayor desafío que han asumido hasta ahora. Dark Matter también tiene por delante un interesante reto, el de dar un paso adelante y culminar el viaje que sus protagonistas iniciaron al despertarse amnésicos en el primer capítulo. ¿Pueden sobrevivir en ese mundo sin recurrir a sus viejas y sanguinarias tácticas? ¿Es posible que salgan adelante dejando completamente atrás sus pasados? ¿Y es beneficioso o dañino