Sechs Fremde erwachen in den Stasiskammern eines Raumschiffs, können sich jedoch nicht daran erinnern, wer sie sind oder was sie dort machen. Nur langsam enthüllen sich ihre Spezialgebiete und Fähigkeiten während sie sowohl dem Zielort als auch dem Zweck ihrer Mission immer näher kommen.

Dabei werden die Fragen, wer sie sind und was sie auf diesem Schiff machen, nur langsam und stückweise beantwortet und die Wahrheit, die ihnen der Schiffsandroid offenbart, ist schockierender als sie es für möglich halten.

Im direkten Anschluss an den ersten Teil der Pilotepisode versucht die sechsköpfige Crew inklusive der Schiffsandroidin, die schockierenden Informationen über ihre Identitäten zu verarbeiten.

Piraterie, Diebstahl und Mord. Diese Dinge hat fast die gesamte Crew gemeinsam, denn sie alle scheinen nicht die Sorte von Umgang zu sein, die ein aufrechter Bürger pflegen würde. Als Söldner von einem Großkonzern angeheuert, um die Arbeiter eines kleinen Minenplaneten auszulöschen, müssen sie sich entscheiden, ob sie ihren Auftrag ausführen. Schließlich wäre es keine gute Idee, sich einen neuen mächtigen Feind zu schaffen.

Als Five bei ihrer Erkundung des Schiffs die Leiche eines Jungen entdeckt, sorgt dieser Fund des jüngsten Crewmitglieds für weiteres Unbehagen und Misstrauen innerhalb der Gruppe, da möglicherweise einer von ihnen für die tödliche Schusswunde verantwortlich ist.

Außerdem kommt ihr Wissen über die Manipulation der Stasiskammern ans Licht - und die Tatsache, dass sie die Erinnerungen der anderen träumt, die womöglich in ihr Unterbewusstsein transferiert wurden. Damit einher geht auch die Erkenntnis, dass der Gedächtnisverlust sehr wahrscheinlich absichtlich von einem Crewmitglied hervorgerufen wurde.

Doch all das gerät in den Hintergrund, als das Schiff einen unverhergesehen Stopp macht, hinter dem die Crew Sabotage vermutet.

Auftanken, Schäden am Schiff reparieren, die Waffen verkaufen und die Vorräte um ein paar Luxusgüter wie gutes Essen aufstocken. Das klingt grundsätzlich nach einem soliden Plan, allerdings gestaltet sich ihr Vorhaben in der Praxis als wesentlich schwieriger, als die Crew aus Dark Matter es antizipiert hatte.

Nacheinander haben alle mit nicht unwesentlichen Komplikationen zu kämpfen. One und Three haben die Aufgabe, die Waffenladung auf dem Schwarzmarkt zu verhökern und dürfen dabei auch ihre Fähigkeiten als Team ein wenig ausbauen, denn sie machen gemeinsam die unangenehme Bekanntschaft mit Ones Doppelgänger Jace Corso.

Um verlassen wirkende Raumschiffe mit „Horizon“ im Namen sollte man anscheinend eher einen Bogen machen. Um sich mit ihrem ehemaligen Auftraggeber wieder gut zu stellen, nimmt die Crew der Raza eine Bergungsmission an, die sie auf den ramponierten Frachter Far Horizon führt.

An Bord des Schiffes erwarten sie zu ihrer Überraschung die hungrigen und aggressiven Crewmitglieder des unheimlichen Kreuzers, die offensichtlich aufgrund eines Virus' in das Lager der „vermindert Lebenden“ hinübergewechselt sind.

Über verschiedene Wege sollen die dunklen Geheimnisse offengelegt werden, die tief in den Erinnerungen von Fünf begraben liegen. Dies gelingt tatsächlich und so erfährt Fünf von der finsteren Wahrheit bezüglich Vier und Sechs. Außerdem bringt sie in Erfahrung, wie sie auf dem Raumschiff gelandet ist. Erinnerungen an einen geheimnisvollen kleinen Jungen stellen sie dann jedoch vor einige Fragen.

Eine Erinnerung von Five, ausgelöst durch ihren Trip aus der letzten Episode, kommt an die Oberfläche. Dadurch fällt ihr das Passwort für den Tresorraum des Schiffs wieder ein, woraufhin sich die Crew versammelt, um den Inhalt des Raums genauestens unter die Lupe zu nehmen.

Dabei entdecken sie nicht nur eine Kiste mit Waffen und eine nicht unerhebliche Menge Geld, mit dem sie dringend benötigte Vorräte einkaufen und Reparaturen an der Raza finanzieren können. Sie finden zusätzlich eine Frau in einer Stasiskammer und eine brandneue Androidin

Während der Rest der Crew auf der Raumstation damit beschäftigt ist, sich beim gemeinsamen Essen und Trinken zu amüsieren, nutzt Six die Technologie von „Transfer Transit 2.0“, um seinen Klon auf die Reise zu schicken und mehr über den Aufenthaltsort des „General“ in Erfahrung zu bringen.

Als Five davon Wind bekommt und es den anderen mitteilt, versuchen sie, herauszufinden, was Six vorhat. Kurz darauf werden One und Four auserkoren, ebenfalls als Tempklone die Verfolgung aufzunehmen.

Four verlässt das Schiff, um sich auf eine riskante Mission zu begeben, da er eine alte Rechnung zu begleichen hat. Anstelle seines Bruders trifft er allerdings auf seinen alten Mentor Akita, welcher ihm eine Falle gestellt hat.

Die Crew diskutiert derweil, ob sie ihn unterstützen und retten oder den schweigsamen Schwertschwinger seinem Schicksal überlassen sollen. In der Zwischenzeit lassen One und Three die Fäuste fliegen, da One die Anwesenheit des Mannes, von dem er glaubt, er habe seine Ehefrau auf dem Gewissen, nur schwer ertragen kann.

Unter der Leitung von Two versucht das Schiff, dem Angriff der Ferrous Corp Zerstörer mit einem waghalsigen Manöver zu entkommen, was zunächst auch glückt. Bevor die nächste Salve abgefeuert werden kann, erhalten sie Unterstützung von Commander Delaney Truffault und ihrer Flotte, welche die feindlichen Schiffe in die Flucht schlägt.

Als Gegenleistung erwartet diese allerdings, die Söldnercrew für einen Raubzug engagieren zu können. Diese willigen nach kurzer Diskussion auch ein, denn Verbündete sind aktuell rar. Dafür müssen sie jedoch mit einer anderen Crew kooperieren, welche von Sölndner Wexler angeführt wird.

Die Crew setzt alles daran, ihr Schiff von den Söldnern zurückzugewinnen, die sie wiederum an die Galactic Auhtority ausliefern wollen.

Der Kontaktmann des Teams schickt die Crew auf eine neue Mission, bei der ein gefangener Wissenschaftler befreit werden soll.

Die Crewmitglieder werden zu Zielpersonen, was deren Paranoia auf der Suche nach den Tätern auf die Spitze treibt.

Die für die Gedächtnisauslöschung zuständige Person macht indes einen weiteren Schachzug.