O Professor Koro e seus alunos tentam dar uma de cupido no fim da viagem à ilha. O agitado verão da Classe 3-E termina com um pouco de pura diversão de festival.

Kaede tem a ideia de um delicioso plano de ataque, a Classe 3-E joga um intenso jogo de Mocinhos e Bandidos e o Professor Koro é acusado de um crime grave.

O Professor Koro enfrenta de novo o poderoso e cheio de tentáculos Itona e seu representante Shiro, revelando mais de sua filosofia de ensinamento ao mesmo tempo.

Itona consegue a admiração dos garotos da Classe 3-E ao exibir sua criação de assassinato. Os alunos se referem um ao outro por codinomes, o dia todo.

Esquenta a competição entre a Classe A de elite e a menosprezada Classe E no festival de esportes da escola, e Isogai vê sua subsistência ameaçada.

Depois de um acidente, a Classe 3-E acaba estudando de forma muito diferente fora da escola. Mas será que terão a chance de se preparar para as provas intermediárias?

Uma ação bem-intencionada leva a uma desavença co a Professora Bitch. Logo a Classe 3-E se vê enfrentando sozinha um assassino formidável.

Os alunos pensam em suas opções futuras de carreira. Nagisa tem dificuldade para aceitar seu talento; enquanto isso, sua mãe tem planos para ele.

Cada classe da Academia Kunugigaoka compete pelo maior número de vendas totais no festival da escola. Como a Classe 3-E pode achar que tem alguma chance?

É hora de provas de novo, e a Classe A, a elite da escola, é uma ameaça maior do que nunca. O número 1 Asano, no entanto, tem uma carta na manga.

As provas de fim de ano terminam com um problema final extraordinário. O Diretor Asano propõe uma aposta ao Professor Koro que pode mudar muita coisa.

O Diretor Asano recorda sua primeira experiência no mundo da educação. No festival de teatro, a Classe 3-E monta uma peça com alguns reviravoltas inesperadas.

Enquanto a Classe 3-E finaliza tudo depois do festival de drama, descobre que um de seus colegas esconde um grande segredo ligado ao passado do Professor Koro.

Depois de um encontro tenso e aterrador com uma aluna que tem seus próprios motivos para matá-lo, o Professor Koro começa a se abrir quanto a quem ele realmente é.

A Classe 3-E fica abalada depois das revelações do Professor Koro sobre suas ações no passado e sua identidade - informações que podem afetar os planos de assassinato.

Com a classe dividida em duas facções quanto a matar ou tentar salvar o Professor Koro, o próprio professor sugere um modo de resolver a questão.

O destino do Professor Koro depende de um confronto entre os velhos amigos Karma e Nagisa. Um novo obstáculo assustador atrapalha os planos da Classe 3-E.

A Classe 3-E vai longe - ou será alto? - para conseguir informações confidenciais que podem ajudar os alunos a manter o Professor Koro vivo.

Com a proximidade das provas de admissão no colegial, Nagisa se questiona que caminho tomar no futuro. A Classe 3-E recebe o Dia dos Namorados com muito chocolate.

O Professor Koro tem mais um projeto planejado para encerrar o ano com sua querida Classe 3-E, mas os planos do governo ameaçam atrapalhar tudo.

Os alunos brigam para ver seu professor uma última vez. Uma figura do passado do Professor Koro chega com muito ressentimento contra a super criatura.

Um confronto entre as duas super-criaturas ameaça ferir os alunos da Classe 3-E. O Professor Koro vai conseguir protegê-los, enquanto luta pela sua vida?

O tempo está acabando e os alunos da Classe 3-E precisam resolver, de uma vez por todas, se vão matar o professor que mudou tanto as suas vidas no último ano.

Dia de Formatura: um dos capítulos da vida termina e outro começa enquanto os alunos e professores da Classe 3-E partem para abrir seus próprios caminhos pelo mundo.