Corre el siglo XI y Julián está escondido en Filipinas donde le hace una promesa a un soldado malherido por la que se verá involucrado en una peligrosa situación.

Salvador le encomienda a Alonso la misión de salvar a Julián que sigue atrapado en el sitio de Baler en Filipinas.

Un cuadro de Velázquez se vende en una subasta de 2016, pero esa pintura se quemó en el incendio del Alcázar de Madrid de 1734. El equipo viaja para investigarlo.

Durante una visita al Ministerio, rediseñado para parecer una oficina más, un experto en fenómenos paranormales se salta una barrera y se cuela por una de las puertas.

La boda entre Ortigosa y Natalia se complica por un portal oculto y una leyenda romántica del siglo XIII.

Felipe II quiere una gran victoria de la Armada española en 1588. Su viaje en el tiempo ha ampliado sus miras y ahora solo piensa en el año 2016.

En 1943, los nazis capturan a una espía española en Francia poniendo en peligro la Operación Mincemeat, clave para la victoria aliada en la Segunda Guerra Mundial.

La patrulla viaja a la Valladolid de 1605 tras el intento de envenenamiento de un enviado británico que amenaza el tratado de paz entre España e Inglaterra.

Unos moriscos del año 1609 se refugian en el Ministerio. Alonso y Pacino deben detener un complot de asesinato contra Simón Bolívar en la Bogotá de 1828.

Salvador envía a la patrulla a 1976 cuando se entera de que Adolfo Suárez no está entre los candidatos para ser presidente de España.

El debut en 1966 de una serie sobre el Ministerio del Tiempo pone en peligro el estreno de "Historias para no dormir" de Chicho Ibáñez Serrador.

Tres años después de su última misión, llegó la hora de que la patrulla vuelva a reunirse. ¿El motivo? El descubrimiento en un NODO de 1943 de que el nuevo galán del cine español, Eulogio Romero, es idéntico a Julián, al que todos creían muerto.

Una concursante del "Un, dos, tres... responda otra vez" que ha llegado a 1648 transforma la corte hasta el punto de que Felipe IV pretende casarse con ella. Buscando la puerta por la que la joven cruzó, los agentes se encuentran con otra misión.

Desesperado por la pérdida de Lola, Pacino decide cambiar el pasado para rescatarla de su última misión. Pero cambiar el pasado puede ser algo muy peligroso.