Juliana Crain se retrouve dans un nouveau monde. Suite à une attaque contre le ministre Tagomi, l'inspecteur en chef Kido lance une répression contre les coupables présumés : les Rebelles communistes noirs. John Smith se rend en Zone neutre pour capturer Wyatt Price et son armée rebelle. La nouvelle indépendance d'Helen Smith est mise à l'épreuve quand John demande à récupérer ses filles.

Les rebelles de Wyatt et les Rebelles communistes noirs s'allient pour attaquer l'élite de Tokyo à la vente aux enchères de Childan. Helen revient dans le Reich afin de protéger ses enfants. Kido reçoit un appel inattendu des Yakuzas. Smith charge un assassin de tuer Juliana.

John et Helen reçoivent Himmler et sa femme à dîner ainsi que le dangereux Obergruppenführer Goertzmann, une nouvelle menace pour John. Juliana retourne dans le monde du Haut Château, dans les ruines du "District de la contamination". Kido est contraint par son général de se retourner contre la princesse héritière. Désormais prisonnier, Hawthorne Abensen partage de nouveaux contes du Haut Château.

John Smith est confronté aux choix qu'il a faits. L'empire tente d'entamer des pourparlers secrets avec les Rebelles. Kido arrête un traitre, menaçant de diviser les Japonais entre eux. Malgré ses protestations, Helen se voit confier une nouvelle garde rapprochée. Juliana rejoint Wyatt pour planifier la chute du Reich américain.

John Smith découvre que l'on peut se perdre sur le chemin qu'on n'a pas pris. Juliana tente de décoder les messages secrets d'Abendsen. Au milieu des dissidences, Bell conçoit une nouvelle stratégie pour les Rebelles. Kido doit décider où va sa loyauté, même si cela doit lui coûter l'Empire.

Les Rebelles lancent un assaut massif dans les États du Pacifique et Kido se retrouve avec le destin de l'Empire entre les mains. Childan est capturé par les Kempetaï. Helen se résigne à épauler son mari en revenant à la vie publique. Juliana et Wyatt arrivent à New York pour planifier une nouvelle stratégie audacieuse contre Smith.

C'est le moment de vérifier si les intuitions de Juliana à propos d'Helen sont vraies. Pendant l'évacuation de San Francisco, Kido part à la recherche de son fils mais se fait capturer. Un courrier va changer pour toujours la vie de Childan et Yukiko. Les Rebelles reçoivent l'aide inattendue des Yakuzas. Abendsen condamne Smith avec sa dernière prédiction.

La loyauté de Smith et d'Helen est durement testée par l'intervention d'un vieil adversaire. Les Rebelles luttent pour maintenir l'ordre dans les États du Pacifique. Kido doit affronter les atrocités qu'il a commises. Des bandes de miliciens errants menacent Childan et Yukiko.

Au bord d'une inévitable invasion nazie, les Rebelles se tiennent prêt. Kido est engagé dans une course contre la montre pour retrouver son fils. Childan offre tout ce qu'il a pour rejoindre Yukiko. Helen doit choisir entre la trahison et la loyauté envers son mari, tandis qu'elle et Smith se rendent au portail par le train rapide. Pendant ce temps, Juliana et Wyatt font le guet.