Dopo essere stato gravemente ferito da un edificio crollato su di lui, Daredevil si salva grazie al sistema fognario di New York City che lo scarica su una spiaggia. Successivamente un tassista, dopo averlo trovato, lo porta da Padre Lantom che affida Matt alle cure di suor Maggie al Saint Agnes Orphanage, luogo in cui Matt è cresciuto. Mentre si riprende lentamente, Matt ha una crisi di fede per cui afferma che avrebbe preferito mettere la sua vita in pericolo e continuare a combattere come Daredevil che tornare alla sua vita civile.

Nel frattempo gli amici di Matt, Karen Page e Foggy Nelson, ignari di tutto, iniziano a perdere la speranza che il loro amico possa essere ancora vivo.

In prigione, il criminale Wilson Fisk decide di fare un accordo con l'FBI per proteggere il suo amore Vanessa Mariana. Il caso viene assegnato all'agente dell'FBI Ray Nadeem, il quale lotta per risolvere i propri problemi finanziari e per ricevere una promozione.

Le informazioni di Fisk portano all'arresto dei leader sfuggenti del sindacato albanese e Nadeem convince i suoi superiori a lasciarlo continuare a lavorare con Fisk, nonostante i suoi problemi finanziari che potrebbero renderlo un facile bersaglio della corruzione.

La notizia della collaborazione di Fisk con l'FBI si diffonde rapidamente e, per rappresaglia, viene attaccato in prigione da un altro detenuto. Nadeem accetta di spostare Fisk fuori di prigione in detenzione domiciliare, ma il loro convoglio viene attaccato dagli albanesi lungo la strada e la maggior parte degli agenti dell'FBI vengono uccisi. Fisk viene salvato dall'agente "Dex" Poindexter, che ha abilità di tiro incredibilmente accurate.

Matt salva un padre e una figlia da un'aggressione; in seguito rintraccia i tentati rapitori e li picchia, facendoli arrestare. Karen è incaricata di scrivere un articolo sul tentativo di rapimento, che ha coinvolto la nota Neda Kazemi.

Fisk viene condotto nella suite dell'attico di un hotel che l'FBI usa come rifugio. La notizia della sua liberazione dalla prigione diventa pubblica, suscitando proteste fuori dall'hotel e l'interesse dei giornalisti, tra cui Karen, che apprende che l'hotel era appartenuto al padre di Neda, Rostom, che lo vendette a una società rappresentata dall'avvocato di Fisk, Benjamin Donovan.

Foggy si reca presso il procuratore distrettuale Blake Tower per offrire il suo aiuto nel riportare Fisk in prigione, ma Tower è riluttante ad andare contro i desideri dell'FBI, soprattutto perché è in corsa per la rielezione.

Matt indaga sull'albergo e inizia ad ad avere allucinazioni di Fisk come un "diavolo sulla spalla". Matt interroga l'avvocato Donovan e viene a conoscenza dell'accordo di Fisk con l'FBI per la salvaguardia di Vanessa. Giura di fermare Fisk e riportarlo in prigione, rivelando a Foggy che è vivo ma solo per avvertire lui e Karen di stare lontano da Fisk.

I superiori di Dex indagano sulla sua uccisione dei due albanesi durante l'attacco al convoglio del trasferimento di Fisk, che lui sostiene fosse per legittima difesa. Nonostante Fisk lo abbia visto ucciderli a sangue freddo, lo nasconde confermando falsamente la storia di Dex all'FBI.

Foggy, insoddisfatto delle richieste di Matt, dice a Karen che Matt è vivo, ed è poi convinto dalla sua ragazza Marci Stahl a candidarsi come procuratore distrettuale contro Tower per assicurarsi che Fisk sia assicurato alla giustizia e riportato in prigione. Foggy ottiene il sostegno del NYPD, che vede Fisk come un assassino di poliziotti.

Karen continua le sue indagini e scopre che un detenuto, Felix Manning, è stato coinvolto nella società che ha acquistato l'hotel in cui l'FBI ospita Fisk.

Quando Fisk viene a sapere che Matt è sopravvissuto all'incidente col taxi, dice all'FBI che ha pagato una persona per riciclare denaro sporco e manipolare delle prove: un avvocato di nome Matt Murdock.

Karen si confronta con l'effettivo riparatore di Fisk, Manning, ma la minaccia con la sua conoscenza della sua famiglia, compresa la morte di suo fratello.

Nadeem interroga sia Karen che Foggy riguardo Matt, ed entrambi cercano di indirizzarlo verso Fisk e i suoi crimini. Karen rivela a Foggy di aver ucciso James Wesley.

Fisk rivede un file di Manning su Dex e scopre che da bambino ha ucciso il suo allenatore di baseball. Attraverso la terapia gli è stato insegnato ad essere più empatico, così da nascondere le sue tendenze psicopatiche e il suo disturbo borderline della personalità. Quando lavorava per una hotline di prevenzione del suicidio, ha incoraggiato un chiamante a uccidere qualcun altro piuttosto che se stesso.

Foggy assicura a Karen di essere ancora una brava persona anche dopo aver ucciso Wesley per autodifesa.

Dex affronta Fisk, che conferma di esserci lui dietro l'assunzione di Julie in hotel e che aveva intenzione di dimostrare a Dex che la vita con Julie non avrebbe funzionato, dato che lei non avrebbe mai capito Dex. Fisk, tuttavia, gli dice che lui capisce Dex, alla luce dell'omicidio di suo padre da ragazzo.

Matt visita Karen per chiedere il suo aiuto nella ricerca di Evans che si offre di testimoniare contro Fisk. Foggy organizza un incontro tra Nadeem e Karen al New York Bulletin, dove intervisterà Evans a proposito dei piani di Fisk. In cambio Nadeem, considerando la testimonianza di Evans, assolverà Matt da tutte le accuse.

Daredevil è attaccato dal pubblico e dai media e Karen non è in grado di convincere Nadeem che quello non era il vero Daredevil o che c'era Fisk dietro l'attacco. Quando cerca di fare lo stesso con il suo capo, Mitchell Ellison, le ordina di rivelare chi è Daredevil o di licenziarsi. Karen in seguito chiede a suo padre se può passare un po' di tempo a casa con lui, ma lui dice che non è il momento adatto.

Foggy crede di aver capito cosa sta pianificando Fisk. Matt, arrabbiato per aver messo in pericolo i suoi amici e preoccupato per l'abilità del finto Daredevil, visita Melvin Potter, l'uomo che ha creato l'abito di Daredevil. Potter conferma che Fisk lo ha costretto a creare una copia della tuta e rivela che il pretendente era un agente dell'FBI. Potter quindi cerca di incastrare Matt come il Daredevil che ha attaccato il Bullettin, ma Matt riesce a sfuggire agli agenti dell'FBI in arrivo.

Nadeem si rende conto che Dex è l'attaccante. Dex tenta di riconciliarsi con Julie, credendo di aver bisogno di lei per sostituire la sua terapeuta, morta quando era più giovane. Con riluttanza Julie accetta di iniziare a parlare con lui, ma in seguito Fisk la uccide per scatenare la rabbia di Dex. Credendo che Julie lo abbia abbandonato, Dex continua a deteriorarsi mentalmente.

Matt e Nadeem irrompono nell'appartamento di Dex, ma non riescono a trovare prove del fatto che fosse l'attaccante, solo alcune registrazioni delle sue sessioni di terapia che rivelano le sue tendenze psicopatiche. Dex arriva a casa e li cattura, ferendo Nadeem, ma i due riescono a fuggire.

Lottando con il fatto che sia suor Maggie che padre Lantom gli stessero nascondendo la verità, Matt va in un club di boxe abbandonato dove suo padre era solito combattere.

Manning minaccia la famiglia di Foggy, a meno che non si scusi pubblicamente per aver parlato contro Fisk al dibattito. Karen decide di fuggire da Fisk, e suor Maggie si offre di aiutarla a nascondersi.

Nadeem racconta ai suoi superiori, Tammy Hattley e Winn, della cospirazione dell'FBI che coinvolge Fisk e Dex. In una serie di eventi, Hattley uccide Winn con la pistola di Nadeem, rivelando che lavora per Fisk. Quindi produce prove con le quali può incastrare Nadeem per l'omicidio di Winn, ricattandolo per lavorare per Fisk con l'aiuto di Manning.

Nel flashback, una giovane Karen rimanda il college perché sa che suo padre e suo fratello Kevin non sarebbero in grado di gestire il ristorante di famiglia dopo la morte di sua madre per cancro. Si annoia della sua vita in una piccola città e inizia a usare e vendere droghe con il suo ragazzo Todd. Un giorno Kevin rivela a Karen di averla iscritta nuovamente al college, così Paxton, il padre, decide di festeggiare con una cena in famiglia, ma questo porta a una discussione e Karen scappa con Todd. Dopo essersi ubriacati e drogati insieme, tornano alla roulotte dove vive Todd per scoprire che Kevin la sta bruciando. Todd attacca Kevin e Karen ferisce Todd con la sua pistola per fermarlo. Lei e Kevin partono in macchina ma durante una discussione hanno un incidente, si schiantano e Kevin muore. Lo sceriffo locale copre il coinvolgimento di Karen, ma suo padre le chiede di andarsene.

Dex fa assumere a Nadeem il controllo della scena del crimine alla chiesa e l'FBI cerca Matt e Karen. Grazie all'aiuto di Maggie riescono a restare nascosti.

Il Dipartimento di Giustizia lascia cadere tutte le accuse contro Fisk, che annuncia la sua libertà al pubblico con un discorso che proclama Daredevil come nemico pubblico. Con Vanessa sulla via del ritorno a New York City, Fisk va a recuperare il dipinto che gli ha dato quando si sono incontrati per la prima volta: è in possesso di Esther Falb, una sopravvissuta dell'Olocausto la cui famiglia era la proprietaria originale del dipinto. Fisk decide di lasciarglielo tenere.

Fisk si riunisce con Vanessa, che convince Fisk a lasciarla entrare nella parte criminale della sua vita. Senza chiedere a Fisk, Dex recupera il dipinto da Falb e Vanessa nota un po' del suo sangue sulla cornice.

Matt accetta di portare a termine il piano di Foggy, lavorando insieme come avvocati come una volta: assumono Nadeem come cliente e si organizzano con Tower per far testimoniare Nadeem contro Fisk davanti a un grand jury. Foggy in cambio si offre di ritirarsi dalla gara per il procuratore distrettuale, inoltre mettono in salvo la famiglia di Nadeem. Nel frattempo, Karen convoca una conferenza stampa per annunciare cosa sta facendo Nadeem, in modo che il pubblico ne sia consapevole dato che la sua testimonianza sarebbe stata sigillata, e per avvertire la gente che il Daredevil in azione non è quello vero. Matt e Foggy festeggiano dopo l'udienza, Foggy suggerisce che vorrebbe continuare a lavorare con Matt in questo modo.