Una setta segreta del Vaticano scopre una mappa contenente le località delle quattro pietre di fondamenta della Biblioteca di Alessandria. Flynn e gli altri lavorano con un inaspettato alleato per fermarli prima che le pietre siano usate per distruggere la Biblioteca.

Quando la gente comincia a ferirsi nei modi più strani e "sfortunati" possibili, i bibliotecari indagano sul proprietario di un casino che è in possesso di un manufatto in grado di rubare la fortuna delle persone.

Eve, Flynn e Jenkins vanno a una festa organizzata da Santa Claus il quale lascia la sua slitta nella Biblioteca per essere custodita. E' anche il giorno del Thanksthieving, cioè il giorno celebrato da tutti i ladri del mondo e Ezekiel vuole fare un regalo alla sua mamma adottiva che però non sia rubato.

Flynn e Baird sono risucchiati nel film noir preferito di Baird e la gang, per liberarli deve raggiungerli nel magico mondo del cinema dove dovranno imparare a usare il lasso, sparare e dire battute divertenti se vogliono sopravvivere a questa avventura.

Un Bibliotecario del passato lavora con gli attuali Bibliotecari per trovare e battere un antico e potente nemico che si trova nell'era presente. Flynn non sta nella pelle all'idea di incontrare il suo eroe, Darrington Dare, ma lui lascia la gang con un monito inquietante: ci può essere un solo Bibliotecario.

Quando Baird è sulle tracce di Nicole Noone per cercare di riparare il problema con la Biblioteca, finisce per unirsi a lei nel recuperare un pericoloso manufatto prima che cada nelle mani di ladri di tombe russi. Riuscirà Baird a convincere Nicole a perdonare la Biblioteca e tornare a casa con lei?

C'è dissenso e tensione nel team e Baird decide di portarli in un luogo di campeggio vicino a una foresta per indagare su delle misteriose sparizioni. C'è forse un mostro che sta portando via le persone o qualcosa di più sinistro? E riusciranno i Bibliotecari a ritrovare lo spirito di squadra?

Una messa in scena della Guerra Civile in un paesino è piagata da fantasmi veri e i Bibliotecari devono scoprire cosa è successo veramente in questo luogo cento anni fa.

Jenkins è vittima di uno scambio di corpo con quello di un ventottenne scansafatiche di nome Jeff e deve fare di tutto per ritornare alla Biblioteca e correggere l'errore. Per farlo chiederà aiuto agli amici di Jeff, ma riuscirà a farlo prima che lui distrugga la Biblioteca?

La tensione tra il gruppo non fa che aumentare e ognuno è convinto di essere il più indicato per la cerimonia che collegherà Baird alla Biblioteca. La Biblioteca prende in mano la situazione e trasforma i suoi Bibliotecari nelle versioni più primitive di loro stessi e li manda in una dimensione alternativa terrificante per vedere chi riuscirà a sopravvivere.

Dopo che il mondo è stato trasformato in un luogo orribile, grigio, privo di libertà intellettuale, un luogo dove la Biblioteca non è mai esistita, Baird è l'unica ad avere ancora qualche ricordo del passato e deve ritrovare i suoi amici prima che sia troppo tardi.