Во время одного из опасных заданий полковник НАТО Ив Бэрд встречает любопытного персонажа — Флинна, Библиотекаря, который носится по странным местам и решает загадки, получая таким образом магические артефакты. После того, как начальник Ив читает в ее отчете о загадочном библиотекаре, он отправляет ее в отпуск. Но долго грустить Ив не приходится – на пороге дома она находит странное письмо о приглашении в Городскую Публичную Библиотеку. Придя туда, полковник Бэрд узнает, что ее избрали хранителем, и теперь она должна защищать Флинна, а также претендентов на должность библиотекарей – Эзекиля, Кассандру и Джейка.

Флинн получает волшебную рану от Экскалибура, и ему остается около суток для того, чтобы вернуть Библиотеку. А это не так легко сделать, особенно учитывая то, что ребята оказались посреди неизвестного леса. Но удача улыбается им, по дороге их встречает Дженкинс и отвозит всех в свой флигель, являющийся мини-версией основной Библиотеки. Флинн, Ив, Джейк и Эзекиль отправляются на поиски камня, из которого извлекли Экскалибур. А в это время Кассандра, узнав получше Ламию и Дюлака, начинает сомневаться в правильности своего решения.

Пока Флинн странствует в поисках Библиотеки, Ив пытается тренировать новоиспеченных библиотекарей, и результаты ее совсем не впечатляют. Но Эзекиль, Джейк и Кассандра мечтают поскорее отправиться на настоящее задание, и вскоре им предоставляется такая возможность. В разных концах страны таинственным образом исчезают молодые люди, и единственное, что связывает жертв – корпорация Голден Экс Фудз. Придя в главное здание компании на разведку, библиотекари и Ив понимают, что это место является настоящим Лабиринтом Минотавра, и сами попадают в ловушку злодеев.

Все, кроме полковника Бэрд, охвачены праздничным настроением и готовятся к Рождеству, но внезапно Дженкинсу поступает тревожный звонок от жены Санта-Клауса. Оказывается, что Рождество отменяется из-за того, что Санту похитили. В ходе расследования библиотекари выясняют, что в похищении виновато Змеиное Братство. Дюлак собирается убить Санту ровно в полночь, чтобы высвободить накопленную за год волшебную энергию и завладеть ею.

По всей планете проходит волна землетрясений, причиной которых являются проснувшиеся драконы. Флинн возвращается к своим подопечным, чтобы встретиться с адвокатом Восточных драконов Дрейком и уладить все проблемы. Но из-за глупой ошибки представителем Библиотеки становится Эзекиль. Поэтому он остается улаживать дипломатические вопросы, а Флинн и команда отправляются искать пропавшую волшебную жемчужину Фей Ланг.

На Чикагской научной выставке СТЭМ случается волшебный апокалипсис, и Дженкинс посылает свою команду разобраться с этой проблемой. Библиотекари притворяются судьями конкурса, чтобы обнаружить эпицентр магической вспышки. Вскоре круг подозреваемых сужается до нескольких человек, но команда еще не знает, что на самом деле за всем происходящим стоит фея Моргана.

Команда попадает в блуждающий дом ужасов, перемещающийся по всему свету в поисках жертв. Последними пострадавшими были друзья девушки Кейти, которую Ив и библиотекари встретили в лесу. Кассандра чувствует себя слабым звеном из-за того, что Ив поручает ей присматривать за Кейти, в то время как Эзекиль и Джейк будут помогать Ив искать маньяка.

Независимый журналист Виктор Финч пропал без вести в окрестностях Коллинс Фолс, куда приехал в поисках НЛО. Расследуя исчезновение Финча, библиотекари начинают подозревать, что с самим городом что-то не так. Джейк и Кассандра знакомятся с городским архивариусом Мейбл Коллинс, чтобы побольше узнать об истории этого поселения. А в это время Эзекиль и Ив исследуют место происшествия, но внезапно... пропадает сама полковник Бэрд!

Флинн приходит к команде с хорошими новостями: он наконец-то нашел способ вернуть Библиотеку. Если соединить эффект от всех добытых магических артефактов, то получится найти дрейфующую меж измерений Библиотеку и связать ее с пристройкой Дженкинса. Благодаря магии артефактов Флинн и Ив оказываются перед прялкой судьбы, но Дюлаку удается добраться до нее первым. Он рассекает ткань истории, изменяя таким образом реальность. Ив начинает путешествовать среди параллельных вселенных, встречая разные версии Библиотекарей. Но как ей вернуться в свою вселенную?