人類獲得了高度進化的情報技術“瑪那”，憑藉這魔法般的力量，地球終於迎來了和平與自由的理想鄉。米斯爾奇皇國的第一公主安琪莉潔，深受民眾的祝福與愛戴，在“洗禮儀式”上她突然被揭發是“諾瑪”的事實。“諾瑪”是無法使用瑪那之力的非正規者，是反社會且無法稱其為人的“物品”。一無所有的她被隔離到偏僻的島嶼“阿爾澤納爾”，受盡凌辱後她將如何生存……

安琪被分配到帕拉梅爾（Para-mail）第一中隊，見到了隊長佐拉，副隊長薩莉亞，突擊兵希爾達、薇薇安、羅薩利等人。安琪還是不願承認自己諾瑪的身份，在基地內與同伴發生衝突。薩莉亞負責訓練安琪，安琪對戰機非凡的操控能力讓所有人對她刮目相看。安琪不滿基地的生活，仍舊幻想著回到皇國，佐拉企圖侵犯安琪，這時警報響起……

大批龍入侵，安琪等人被派去迎敵。看到身邊的伙伴被龍生吞，安琪陷入極度恐慌，失去理智的她害死了作戰中的佐拉。面對希爾達她們的指責，安琪毫無愧疚，並說“諾瑪又不是人”。吉爾告訴安琪米斯爾奇皇國已經不存在的事實，安琪心灰意冷一心求死，駕駛Villkiss前往戰場卻在戰鬥中找到活下去的勇氣。安琪斬斷長發，斬斷了過去的一切，她將作為一名諾瑪生存。

吉爾和薩莉亞等人謀劃著自由之戰，安琪和她所駕駛的機體“Villkiss”是他們計劃的核心。安琪雖然戰鬥力極強，但是她害死了新兵和佐拉，因此遭人怨恨。羅薩利想盡辦法捉弄安琪，安琪對此毫不在乎，堅持獨善其身的原則。安琪出戰對抗龍，她的機體突然起火，與龍一同被捲入漩渦之中……

安琪曾經的首席侍女桃香闖入阿爾澤納爾基地，只為留在安琪身邊照顧她。桃香仍舊把安琪當做“安琪莉潔大人”，安琪對此十分反感，兩人間充滿隔閡。安琪從希爾達那裡聽說，知道基地秘密的桃香只要回國，就會被立馬處死。安琪勸說桃香離開，但桃香執意留下。安琪下定決心，無論如何她都要保護桃香。

安琪依舊我行我素，這使得她所在中隊的團隊默契完全崩壞。身為隊長的薩莉亞對安琪的行為十分不滿，她承受的壓力越來越多。無奈之下，薩莉亞按照以往的“美少女Cosplay法”緩解自身壓力，卻沒想到被碰巧出現的安琪看到了這一幕。情緒失控的薩莉亞在浴室找到安琪，兩人扭打成一團。此時未知的大型龍來襲，薩莉亞等人陷入危機……

安琪由於妹妹西爾維婭的求救通訊，使得她打算與過去訣別的心意產生動搖。此時正值一年一度的美人魚慶典，安琪等人穿上比基尼上街遊玩。羅森布爾姆國的皇女米斯提·羅森布姆來到阿爾澤納爾進行探訪活動，想要見到安琪。安琪威脅米斯提作為人質，準備回國拯救西爾維婭，此時她遇到了同樣打算逃走的希爾達……

安琪與希爾達順利逃脫，安琪一路闖入米斯爾奇皇國，前去拯救妹妹西爾維婭。在另一邊，希爾達終於回到家鄉，與思念已久的母親重逢。但是背負著諾瑪之名的兩人，卻不被親人所接受。妹妹西爾維婭對安琪刀劍相向，並率軍隊圍困她；希爾達遭到母親呵斥，家裡早已沒有她的容身之處了。

安琪遭皇妹西爾維婭鞭刑，並被皇兄朱利奧送上絞刑架，昔日的好友也全都拋棄了她。面對歧視與偏見，安琪對人類的和平世界徹底心灰意冷。關鍵時刻，島上的舊識塔斯克前來相助，安琪與桃香順利逃脫，回到阿爾澤捷納爾。安琪被處罰禁閉一周，在監獄裡她見到了同樣遍體鱗傷的希爾達。

西爾維婭窺得皇兄朱利奧與近衛隊長的秘密而身陷危機。在另一邊，不明機體拉格朗梅爾（Ragna-mail）帶領大批飛龍襲擊阿爾澤納爾的司令部，所有隊員進入戰斗狀態，薩莉亞違抗吉爾的命令駕駛Villkiss迎敵。此時桃香趁亂救出安琪和希爾達，安琪在希爾達的幫助下奪回機體，與神秘歌之少女展開激烈對戰。

朱利奧對安琪懷恨在心，在創世主恩布利歐的默許下，打算徹底消滅諾瑪。上次的襲擊使司令部遭到重創，在安琪的追問下，吉爾將自由聖戰的秘密告訴了她，而吉爾竟然是史上第一位皇室諾瑪！就在此時，薇薇安突然驚變龍，不明真相的隊員們對薇薇安展開攻擊，只有安琪發現了端倪……

朱利奧帶領所謂的諾瑪國際救助艦隊來到阿爾澤納爾，吉爾帶領隊員們與其對抗，自由聖戰計劃Libertas開始。朱利奧的目標是俘獲安琪和Villkiss，安琪遇到了恩布利歐，並從他那裡得知了朱利奧的醜惡罪行，安琪決定駕駛Villkiss討伐自己的皇兄。然而就在安琪要手刃親哥哥的時候，駕駛黑色Ragna-mail的恩布利歐卻出現了……

安琪和塔斯克墜落到莫名其妙的孤島，薇薇安又變回飛龍，無奈之下他們只有先調查此地。然而安琪意外發現，這片廢墟竟是她的故鄉米斯爾奇皇國，這讓她困惑不已。此時突然出現的智能機器人在四處搜索倖存者，安琪與塔斯克跟隨機器人，進入首都防衛機構，終於明白了世界的真相。

安琪和塔斯克被龍族帶到了大女巫面前，面對龍族等人的質問，安琪試圖反抗。此時，安琪再次見到了命運中的少女，弗雷亞一族的公主、近衛中將薩拉曼蒂妮。薩拉曼蒂妮請求留安琪一命，並親自招待了他們二人。原來龍族也是人類，而龍族所在的星球竟是另一個被拋棄的地球……

安琪了解了龍族的秘密，她與塔斯克暫時被軟禁在龍族，恢復了龍族身份的薇薇安與親生母親重逢。薩拉曼蒂妮向安琪發起挑戰，以戰鬥的名義決定安琪與塔斯克的去留。薩拉曼蒂妮與安琪在體育館的比試不分上下，不打不相識的兩人漸漸生出了情誼。此時異變突起，龍族突然遭遇不明襲擊，安琪駕駛Villkiss出戰！

龍族聽聞奧拉在米斯爾奇秘密基地下的情報，為了奪回始祖之龍“奧拉”，決定集結所有兵力對米斯爾奇展開大規模攻擊。面對一觸即發的戰爭，安琪徘徊在虛假與真實之間，煩惱著怎麼做才是正確的選擇。看著為了生存掙扎的龍族，安琪決定回到原來的世界，而薇薇安在母親的理解下，與安琪一同踏上歸途。和龍大軍穿越奇點的安琪，出現在他們面前的卻是3台黑色的Ragna-mail……

安琪一行人與希爾達等人重逢，並在空母Aurora上跟眾人會合。安琪提出與龍聯手的作戰策略，但吉爾卻堅持只有殺死恩布利歐才能徹底解放諾瑪。面對吉爾的偏激理論，安琪產生了反感。最終吉爾決定聽取安琪的建議，但吉爾並不是真心與龍合作，而是要把龍當做炮灰利用？！

安琪救走桃香，與薇薇安、塔斯克逃往特異點。此時薩莉亞帶領“鑽石玫瑰騎士團”出現，對安琪等人展開追擊，並開槍擊落了安琪。昏迷的安琪醒來後發現自己身處米斯爾奇皇國，而獲救的薩莉等人成為了恩布利歐的部下。在圖書館，安琪見到了妹妹西爾維婭和恩布利歐。安琪槍擊恩布利歐，恩布利歐卻無窮地複活，而恩布利歐的真實身份竟是時空調律者。恩布利歐試圖催眠安琪，對其凌辱……

安琪的逃走讓吉爾十分憤怒，她把過錯全賴在塔斯克身上，並不打算救援安琪；希爾達察覺到吉爾跟恩布利歐過去有著不尋常的關係。在另一邊，安琪受邀與恩布利歐見面，沒想到恩布利歐竟提出要娶她為妻，躲在一旁聽到此事的薩莉亞醋意十足。恩布利歐想要融合兩個地球創建新世界，安琪趁其不備襲擊了他，卻被恩布利歐施與無窮的痛苦而折磨著。感覺又一次被安琪奪去一切的薩莉亞，決定偷偷地釋放了安琪。

塔斯克和希爾達等人策劃衝入米斯爾奇皇國。此時安琪帶著桃香駕駛Villkiss逃走，遇到了薩拉曼蒂妮的軍隊，而薩拉曼蒂妮的目標正是奧拉。希爾達等人與安琪會合，然而鑽石玫瑰騎士團突然發起攻擊，致使Villkiss墜入大海，所幸安琪和桃香並無大礙。戰鬥仍在繼續，鑽石玫瑰騎士團的克莉絲對過去的朋友羅薩莉和希爾達無情的狂攻。另一方面，恩布利歐對安琪窮追不捨，這時塔斯克出現。

恩布利歐激活Ragna-mail，而放走了安琪的薩莉亞慘遭遺棄。薩拉曼蒂妮和希爾達等人得知安布利歐的計劃後決定結盟，但安琪此時仍下落不明。發現自己被恩布利歐欺騙利用的艾爾莎向Aurora投誠。在另一邊，安琪獨自來到與塔斯克初遇的島上，桃香和塔斯克的死讓她悲痛欲絕。恩布利歐讓所有人都無法使用瑪娜，他的新世界計劃開始了……

在恩布利歐的計劃下，時空融合開始了，而時空融合的中心點正是米斯爾奇的曉之禦柱。為了拯救地球，薩拉曼蒂妮等人決定奪回奧拉。就在大家準備出擊時，意外收到了安琪歸艦的消息。安琪找到吉爾，詢問她殺死恩布利歐的方法。希爾達提議將司令官讓位給安琪，並對安琪告白：“你是我的王子殿下。”安琪的一番感言後，宣布作戰“Last Libertas”開始，大隊向米斯爾奇皇國進發，恩布利歐的Ragna-mail部隊“鑽石玫瑰騎士團”阻攔在她們面前。

為了阻止時空融合的戰鬥持續著，找到了奧拉的薩拉曼蒂妮卻無法打開防護罩，唱起龍之歌的她準備輸出最大的能量。與恩布利歐對峙的塔斯克說起了與安琪親密的事情，這讓恩布利歐惱羞成怒，寡不敵眾的艦隊遇到了危機，而奧拉的子民通過特異點前來援助，緊迫的局勢開始轉變。

恩布利歐將安琪帶到了時空的間隙，這裡是阿爾澤納爾的原型，在這裡時間不會流逝而恩布利歐作為調律者的事情也全都從這裡開始。在奧拉努力製止時空融合的時候安琪遇到了危險，在恩布利歐的強迫下安琪並沒有屈服，安琪的歌聲啟動了Villkiss，為了保護同伴和拯救世界，塔斯克等人立即趕往救援。