Pendant que Pride lutte contre la mort à l'hôpital, l'équipe ratisse la ville pour trouver la femme qui a tenté de l'assassiner.

À la recherche d'un ancien terroriste de l'IRA entré clandestinement en ville, l'équipe est rejointe par l'Agent Spécial Agent Hannah Khoury qui remplace Pride pendant son congé médical. Pendant ce temps, Pride envisage de prendre un nouveau poste au NCIS.

Pendant que le NCIS enquête sur le meurtre d'un officier de renseignements de la Navy lors d'une réunion diplomatique, un témoin-clé se rapproche de Sebastian. Pride, lui, doit s'adapter à son nouveau poste.

Le NCIS enquête sur le meurtre d'un quartier maître dont le corps a été retrouvé dans un camion transportant des fruits de mer. Pendant ce temps, Pride prête main forte à LaSalle sur les affaires de son père. L'entreprise de ce dernier étant toujours sous le coup de la loi pour fraude au fisc.

Ginny, l'assistante de Pride, est victime d'une tentative d'enlèvement qui heureusement n'aboutit pas. Le NCIS découvre que le criminel responsable est aussi un trafiquant d'organes. Pour l'enquête, Pride fait appel à un ancien ami, commandant dans la NAVY mais aussi médecin, Calvin Atkins.

Suite à l'explosion d'une camionnette dans le quartier français, l'équipe du NCIS suit la piste d'un groupuscule de protestation étudiant. Pendant ce temps, Tammy découvre des éléments du passé de l'agent Khoury gardés secrets.

Le NCIS place Mateo Diaz, un membre d'un gang devenu indic, en détention pendant qu'ils enquêtent sur le meurtre de son instructrice militaire. Pride demande à son demi-frère de l'aider à gagner la confiance de Mateo.

L'équipe du NCIS enquête sur le meurtre d'un contractant de la Navy qui, à l'insu de tous, a vécu une double vie pendant des décennies, avec deux femmes, deux familles et deux carrières.

Alors que Pride fait son jogging, il est capturé par deux hommes masqués qui l'obligent à faire une série de délits pour sauver la vie de Wade et Cassius qui ont été enlevés.

L'équipe de Pride est chargé de mettre hors d'état de nuire un groupuscule d'agents renégats et venger la mort d'un de leur proches.

Gregorio infiltre un club de femmes de militaires pour retrouver un criminel recherché par le FBI.

Le NCIS enquête sur la disparition d'un entomologiste après une fusillade dans l'un des laboratoires. Le commandant Nero se joint à l'équipe pour retrouver un virus qui a aussi été dérobé.

L'équipe de Pride enquête sur le meurtre d'un informateur d'Oliver Crane. Liam Somers, l'ancien partenaire d'Hannah, revient lui faire une visite pour lui donner des informations importantes sur une ancienne de ses affaires.

L'équipe enquête sur une série de meurtres liées à une compagnie à l'origine de la création d'un procédé révolutionnaire pour la sauvegarde des océans.

Hannah et ses proches sont placés sous protection après la découverte d'une vendetta personnelle d'un terroriste. L'équipe cherche des indices pouvant mener au tueur.

Après les nouvelles assignations des agents, Pride n'est désormais plus agent spécial de la branche sud-est. L'équipe enquête sur la disparition d'un quartier maître dans un village reculé.

L'équipe enquête sur le meurtre d'un ami de Patton, alors que ce dernier a assisté impuissant à la scène.

L'équipe enquête sur la mort d'un lieutenant de la NAVY appartenant à une famille influente de la Nouvelle-Orléans lors d'un gala de charité.

Épisode 20 : Jackpot

Elvis vient demander l'aide de Pride pour innocenter sa fille impliquée dans une affaire de meurtre du NCIS.

Tammy est concaincue de la culpabilité d'un escroc dans le meurtre d'un docteur de la NAVY bien que les preuves montrent le contraire alors que Pride continue sur l'enquête de la mort de son père. Ryan, le mari d'Hannah vient voir Pride pour lui fournir de nouvelles informations sur Appolyon, le groupuscule secret à l'origine de l'assassinat.

Le NCIS enquête sur une tentative d'attentat qui doit se dérouler dans un musée militaire accueillant des milliers de visiteurs.

Pride et Lasalle sont en Russie pour retrouver la trace de l'agent Isler, kidnappé à la suite d'une opération ratée pour arrêter Apollyon.

Pride, séparé de son groupe est mis à rude épreuve. Pour le localiser, le reste de l'équipe cherche la taupe responsable de la fuite des informations qui aide Apollyon.