Zatímco Pride bojuje o život na JIP, tým prohledává město a hledá ženu, která se ho pokusila zavraždit.

Při hledání bývalého výrobce bomb pro IRA, který byl propašován do města, se k týmu připojuje speciální agentka Hannah Khouryová, náhrada za Pridea po dobu jeho zotavování z postřelení. Pride také zvažuje novou pozici v agentuře.

Zatímco NCIS vyšetřuje vraždu námořního zpravodajského důstojníka zabitého během konference pro zahraniční diplomaty, klíčový svědek se zmocňuje Sebastiana. Pride má potíže s přizpůsobením se své nové pozici v agentuře.

Poté, co je pod lodí na lov krevet nalezen zavražděný poddůstojník, vyšetřování NCIS odhalí spiknutí v těsně spojené místní rybářské komunitě. Lasalle očekává konečné výsledky vyšetřování daňových podvodů v rodinné společnosti.

Poté, co Prideův asistent Ginny Young uprchl únoscům, tým NCIS nalézá důkazy o podezřelém, který odebírá orgány mnoha obětem. Pride se obrací na svého přítele, velitele Calvina Atkinsona, M. D., kvůli lékařskému a psychologickému vedení, když bojuje s důsledky svého nedávného zranění.

Po smrtící explozi auta ve francouzské čtvrti vyslýchá tým NCIS profesora a bývalého člena studentské protestní organizace. Tammy odhaluje tajemství osobního života Hannah.

Tým NCIS umístí Mateo Diaze, informátora a člena středoškolského gangu, do ochranné vazby, zatímco vyšetřuje vraždu instruktora výcvikového sboru mladších záložních důstojníků. Pride potřebuje pomoc svého bratra Jimmyho Boyda, aby získal Mateovu důvěru.

Tým NCIS vyšetřuje vraždu námořního dodavatele, který, aniž by o tom někdo věděl, žil po dvě desetiletí dva životy se dvěma manželkami, rodinami a kariérou.

Při joggingu za východu slunce, je Pride polapen dvěma maskovanými muži, kteří mu nařídí vykonat řadu úkolů, aby zachránil Wadeovou a svého otce, Cassiusa Pridea, kteří jsou drženi v zajetí.

Pride a tým NCIS doufají, že svrhnou tajnou a smrtící skupinu bývalých zpravodajských agentů a pomstí smrt někoho, kdo je jim blízký.

Gregoriová se v utajení připojí ke společenskému klubu pro vojenské manželky poté, co je jedna z členek kontaktována bývalým přítelem ze seznamu Nejvíce hledaných FBI .

NCIS vyšetřuje zmizení entomologa námořnictva po smrtící střelbě ve výzkumné laboratoři. Nero z Námořního zpravodajství se připojuje k vyšetřování, když tým zjistí, že byl ukraden vzácný a smrtící virus.

Pride a tým se znovu setkávají se spikleneckým novinářem Oliverem Craneem poté, co byl zavražděn zdroj jeho posledního příběhu. Bývalý partner Hannah, Liam Somers, ji překvapí v New Orleans a sdílí šokující odhalení o starém případu.

Tým vyšetřuje několik vražd spojených se stavební společností vyvíjející experimentální chemikálii posilující mořské stěny. Důkazy z předchozí mise Hannah v Ománu jsou proti ní používány pro vydírání.

Poté co se objeví nepolapitelný terorista s osobní vendetou proti Hannah, je spolu se svou rodinou umístěna do ochranné vazby a tým NCIS se mezitím pokouší teroristu najít.

Po reorganizaci úkolů již Pride není zvláštním agentem pro jihovýchod a vrací se, během vyšetřování zmizelého poddůstojníka, do kanceláře NCIS v New Orleans.

Tým NCIS vyšetřuje vraždu Pattonova přítele, bývalého člena Navy Seal, který byl zastřelen při střelbě z projíždějícího auta, zatímco Patton vraždu bezmocně sledoval.

Poté, co námořní poručík, z New Orleánské zámožné rodiny s dobrými kontakty, fatálně spadl ze schodů na charitativním gala večírku, tým NCIS vyšetřuje, zda jeho smrt byla nehoda nebo vražda.

Když je „dcera“ Elvise Bertranda spojována s případem vraždy, požádá Bertrand Pridea, aby prokázala její nevinu.

Tammy je přesvědčena, že vraždu doktora námořnictva, i když důkazy ukazují jinak, spáchal podvodník. Ryan Porter, manžel Hannah, přichází bez jejího vědomí za Pridem s novými informacemi o Apollyonu, podzemní špionážní sítí zodpovědné za vraždu jeho otce.

Tým NCIS vyšetřuje smrtící bombový útok na akci ve vojenském muzeu, které se účastní více než 1000 lidí.

Pride a Lasalle cestují do válkou postižené Jižní Osetie v Rusku, aby našli zvláštního agenta FBI Raymonda Islera, který byl unesen během neúspěšné mise na zatčení vůdce Apollyonu, podzemní špionážní sítě zodpovědné za vraždu Prideova otce.

Při sledování Apollyonu, smrtící podzemní špionážní sítě, ve válce postižené Jižní Osetii, je Pride oddělen od týmu a čelí vážnému nebezpečí. Aby bylo možné zachránit Pridea, musí tým NCIS najít krtka, který pokračuje v dodávání informací Apollyonu.