Das NCIS-Team arbeitet mit mehreren Bundesbehörden zusammen, um einen Scharfschützen aufzuspüren, der auf überfüllte Veranstaltungen in der Stadt zielt. Außerdem trifft FBI-Spezialagent Tammy Gregorio ein, um Pride und sein Team zu untersuchen.

Pride sieht sich einer weiteren Gegenreaktion seitens des FBI gegenüber, als er dem ehemaligen Navy-Geheimdienstanalytiker Elvis Bertrand hilft, der der Hauptverdächtige in einem Mehrfachmordfall ist.

Nachdem ein dekorierter Petty Officer tot in einer Sportarena aufgefunden wird, führen Beweise Pride und das NCIS-Team zu einem Entführungsfall eines Petty Officers, der zuletzt in Mexiko gesehen wurde

Das NCIS-Team muss einen der ihren retten, nachdem Sebastian in einem Restaurant mit seiner Mutter, Sylvia Lund, entführt und gezwungen wurde, seine spielerischen Fähigkeiten bei einem Gefängnisausbruch einzusetzen.

Das Team untersucht gemeinsam mit dem FBI einen Flugzeugabsturz in der Bucht, bei dem drei Seeleute ums Leben kamen. In der Zwischenzeit interviewen Sonja und Lasalle Kandidaten für die offene Agentenposition.

Das NCIS-Team überprüft unorthodoxe Trainingsübungen, nachdem ein Kandidat der Navy Seals Wochen vor seinem Abschluss ermordet aufgefunden wurde. Auch eine besorgte Wade wendet sich an Pride, nachdem ihr Adoptivsohn Danny seinen Plan, in die Navy einzutreten, bekannt gegeben hat.

Das NCIS-Team untersucht den Mord an einem Matrosen während einer rauen Motorradrallye in der Stadt. Außerdem wendet sich Lasalle an Gregorio, um Ratschläge zu seinem Privatleben einzuholen.

Nachdem ein Petty Officer und Mitglied der angesehenen United States Navy Band in ihrem Haus ermordet wurde, nimmt Pride vorübergehend den Neffen des Opfers in Gewahrsam, der der einzige Zeuge des Verbrechens ist.

Das Team vermutet ein Foulspiel, wenn ein Marine Corporal und ein Amateur-Rennwagenfahrer in einen tödlichen Unfall verwickelt wird. An anderer Stelle sammelt die US-Staatsanwaltschaft Beweise für eine Berufung vor der Großen Jury im Fall Garcia, die das Kartell aus der Stadt befreien würde.

Pride muss einen geliebten Freund der Familie schützen, der mit dem Hauptverdächtigen in dem laufenden NCIS- und FBI-Kartellfall verlobt ist.

Sebastian wird undercover geschickt und Patton übt seine früheren Glücksspielfähigkeiten aus, während Pride und das Team eine gefährliche Operation versuchen, Garcia in die Falle zu locken

Nachdem Pride für eine Morduntersuchung zu einer Tiefsee-Ölplattform reist, deckt das Team ein Gasleck auf, das kurz davor steht, eine katastrophale Explosion auszulösen. Außerdem beginnt Sebastian sein NCIS-Spezialagententraining bei FLETEC.

Nachdem Tausende von geheimen Regierungsakten gestohlen wurden, sucht das NCIS-Team nach einer Untergrundgruppe von Hackern

Die NCIS-Agenten McGee und Torres reisen nach New Orleans, um gemeinsam mit Pride und seinem Team nach einem vermissten theoretischen Terror-Drehbuch von Homeland Security zu suchen. Überschneidung mit NCIS Staffel 14 Folge 15

in grausamer Nachahmungsmord in einer Straßenbahn macht einen früheren Fall von Wade wieder auf und weckt schmerzhafte Erinnerungen an ihre Vergangenheit.

Die langjährige Freundin von Pride, die Staats- und Militäranwältin Rita Devereaux, bittet den NCIS, das Verschwinden eines JAG-Anwalts zu untersuchen, der auf klassifizierte Fälle und Freiwillige an einer privaten Militärakademie spezialisiert ist.

Ein hoch qualifizierter und erfahrener Marine der Spezialeinheit schickt Pride und das NCIS-Team auf eine stadtweite Fahndung, nachdem er sechs Männer in einer Bar angegriffen hat.

Tammy ist wieder mit ihrem Ex-Mann Ethan McKinley vereint, der verschwunden ist, nachdem er 80 Millionen Dollar an Katrina-Hilfsgeldern veruntreut hatte, nachdem er mit dem Mord an dem Sohn eines Verbrecherbosses in Verbindung gebracht wurde.

Während der Untersuchung eines tödlichen Unfalls auf einem Marinestützpunkt entdeckt der NCIS, dass eine Einheit der Seabees mit einem ansteckenden Supervirus vergiftet wurde

Nachdem das NCIS-Team eine Verbindung zwischen einem internationalen Drogenring und dem New Orleans Police Department aufgedeckt hat, muss Lasalle gegen seinen ehemaligen Partner in der Sittenpolizei ermitteln.

Nachdem der Belle Chase Navy Chaplain und Pastor des Clearwater Baptist ermordet wurde, glaubt Pride, eine Verbindung zwischen Bürgermeister Hamilton und den illegalen Aktivitäten in der Stadt Clearwater gefunden zu haben.

Nachdem Pride bei der Verfolgung eines Komplizen von Bürgermeister Hamilton gesichtet wurde, eröffnet der Verdächtige auf einer überfüllten Straße das Feuer, bevor er verschwindet.

Unable to trust anyone in New Orleans, the NCIS team calls in FBI Assistant Director Isler to help expose and stop the sinister scheme Mayor Hamilton has planned for the residents of Clearwater. Season Finale.