Er is een aanslag op een militair konvooi gepleegd op de New Orleans-brug. Pride en zijn team bedenken een gevaarlijke undercoveroperatie om een gestolen raket terug te halen en een aanval op een VS-marineschip te voorkomen.

Het NCIS-team onderzoekt de moord op een blogger die zich erop heeft toegelegd om corruptie en doofpotaffaires van bestuursleden aan het licht te brengen. Het team ontdekt dat een Navy SEAL en een humanitaire missie van de CIA een duister geheim verbergen.

Een gevechtspiloot komt om het leven als haar vliegtuig crasht tijdens een vliegshow. Het NCIS-team moet uitzoeken of het ongeluk te wijten is aan een fout van de piloot, of aan het nieuwe gevechtsvliegtuig.

Het NCIS-team moet achterhalen waarom een dronepiloot een drone van de zwarte markt gebruikte voor zijn militaire surveillance. Ook moeten ze vaststellen of de beelden die door de drone zijn vastgelegd, met zijn dood te maken hebben.

Pride moet samenwerken met de Australische agent Naomi Parsons, nadat een luitenant-ter-zee in New Orleans is vermoord. Hij speelde een belangrijke rol bij internationale onderhandelingen over nucleaire wapens.

Het team neemt deel aan een hardloopwedstrijd voor een goed doel. Ze kunnen de wedstrijd niet uitlopen, omdat een onderofficier dood is aangetroffen in het Franse kwartier. Hij blijkt overleden te zijn aan een overdosis drugs.

Het leven van een geniale programmeur hangt aan een zijden draadje als blijkt dat het donorhart dat voor hem was bestemd, verdwenen is. In een race tegen de klok probeert het NCIS-team het gestolen hart te vinden.

Pride en Sonja lopen in een hinderlaag, terwijl ze de kroongetuige Marc Maslow naar Texas begeleiden. Marc is getuige in een zaak tegen een beruchte wapenhandelaar die door Pride is gearresteerd.

New Orleans krijgt te maken met een stroomstoring waar het politieapparaat en de hulpdiensten veel hinder van ondervinden. Pride zweert de moord op de verloofde van een vriendin van zijn dochter op te lossen.

De moord op een marinier levert nieuwe aanwijzingen op voor de eerste zaak waar Pride en LaSalle samen aan werkten. Dat was vlak voordat orkaan Katrina al het bewijsmateriaal wegspoelde. Het team viert Thanksgiving in Prides bar.

Als een serie inbraken tijdens de kerst op een moord uitdraait, leidt al het bewijsmateriaal naar Dr. Wades geadopteerde zoon, Danny.

Pride en zijn team doen onderzoek naar een Russische spion die contacten onderhield met Abby's broer. Sebastian vliegt naar Washington om Abby te helpen bij het forensisch onderzoek. Bishop rijdt 's nachts naar New Orleans om een pakket af te leveren.

Pride en zijn team doen onderzoek naar de moord op een geïmmigreerde onderofficier. De moord was geënsceneerd als een zelfdoding. Ondertussen maakt het team in het geheim een datingprofiel aan voor Pride.

Pride opent zijn bar voor het publiek met een groot feest. Tijdens de Mardi Gras-festiviteiten worden Pride en burgemeester Hamilton ontvoerd en gevangengenomen door een onbekend persoon.

Het leven van een luitenant wordt gered door een mysterieuze man die zich daarna meteen uit de voeten maakt. Het forensisch onderzoek wijst uit dat het om een soldaat gaat die in Afghanistan gevangengenomen is en nooit is teruggevonden.

Het team ontdekt gestolen explosieven in een pakhuis waar cocaïne wordt opgeslagen. Pride en zijn team komen erachter dat een plaatselijke drugsbende zijn eigen cocaïne produceert onder leiding van een jeugdvriendin van Sonja.

Het team onderzoekt de moord op een marinekapitein die werd aangevallen tijdens een live-uitzending van een radio-dj. De dj wordt door het team beschermd, omdat hij is bedreigd. Prides dochter neemt een verrassende beslissing over haar toekomst.

Brody is ervan overtuigd dat het ongeval waarbij een matroos in het Franse kwartier door een bus is doodgereden, verband houdt met de dood van haar zus. Het NCIS-team heeft namelijk overeenkomsten ontdekt.

Prides dochter, Laurel, is aangevallen op de campus en wordt voor haar eigen veiligheid in hechtenis genomen. Het NCIS-team ontdekt dat Prides doen en laten van minuut tot minuut is gefotografeerd.

Het team onderzoekt de moord op een luitenant in het Franse kwartier tijdens een begrafenisparade van een marine-reservist. Pride denkt dat de dood van de reservist en de moord met elkaar te maken hebben.

Pride en zijn team krijgen het verzoek om het standaardprotocol te omzeilen in een moordzaak. Het gaat om de dood van een luitenant die vermoedelijk een relatie had met een generaal.

Het NCIS-team onderzoekt een explosie waarbij een culinair specialist van de marine het doelwit was. Zij bracht een bezoek aan het 100 jaar oude restaurant van haar familie in het Franse kwartier.

Het NCIS-team werkt samen met de binnenlandse veiligheidsdienst, nadat de moord op een meester-duiker van de marine wordt gelinkt aan het complot om een terroristische aanslag in New Orleans te plegen.

Het NCIS-team ontmaskert een mol, terwijl ze samenwerken met de binnenlandse veiligheidsdienst. Er ontbreekt een enorme lading explosieven die een groot gevaar vormt voor New Orleans.