Una explosión en el puente Crescent City revela que los grupos radicales de los anarquistas se están uniendo cerca de Nueva Orleans y Pride debe ir de incógnito para averiguar quién está detrás de todo.

El equipo de NCIS investiga el asesinato de un bloguero dedicado a exponer la corrupción gubernamental y encubrimientos y descubre que una misión humanitaria con el sello de la marina de guerra y la CIA oculta un oscuro secreto.

Cuando una piloto de combate y héroe de la marina de guerra muere durante una presentación aérea, el equipo NCIS debe investigar si es la culpa del piloto o del nuevo modelo de avión que acaba de ser aprobado para enviarse a las bases a nivel mundial.

El equipo de NCIS debe determinar por qué un piloto de la marina asesinado estaba usando un avión no tripulado de mercado negro para obtener información sobre vigilancia militar, y si la información que recibía el avión está vinculado a su muerte.

El Agente Especial Pride y su equipo reciben la ayuda de un socio enviado por el Servicio de Investigación de la Fuerza de Defensa Australiana para resolver un asesinato con conexiones a las negociaciones internacionales de armas nucleares.

El equipo se suma al maratón anual del vestido rojo de la ciudad, pero debe retirarse cuando una Suboficial es encontrada muerta por sobredosis.

La vida de un genio programador de la Marina empleado por la madre de Brody, Olivia Brody, pende de un hilo tras el robo del corazón destinado para su trasplante. Olivia se une al equipo del NCIS en su carrera para localizar el órgano robado.

Pride y Sonja son emboscados después de viajar a Texas para escoltar a un testigo clave en el juicio de un infame traficante de armas detenido por Pride.

Durante un apagón en toda la ciudad que impide la aplicación de la ley y la respuesta de los equipos de emergencias, Pride se compromete a resolver el asesinato del novio de una amiga de su hija.

El asesinato de un Marine revela nuevas pistas en el primer caso en el que Lasalle y Pride trabajaron juntos después del huracán Katrina. Además, hay una celebración de Acción de Gracias en el bar de Pride.

Cuando una serie de robos de Navidad acaban con muertes, las pruebas dirigen al equipo de NCIS hasta el hijo adoptivo de Wade, Danny. Además, Lasalle y Brody se burlan de Sonja por la elevada apuesta de dibujar a Pride como regalo de "amigo invisible" del equipo.

Sebastian vuela a D.C para trabajar con Abby Sciuto en el departamento de la policía forense dentro del caso que involucra a su hermano, mientras Ellie Bishop llega a Nueva Orleans para entregar un paquete y ayudar a Pride y su equipo en el caso.

El crossover comienza en Navy: Investigación criminal S13E12 Ciudad hermana (parte 1).

El equipo investiga el asesinato de un inmigrante suboficial que se que se llevó a cabo para simular un suicidio y, mientras tanto, el equipo crea un perfil de citas on-line para Pride.

Pride y el alcalde Douglas son secuestrados en sus respectivos "Mardi Gras" y permanecen cautivados por un misterioso asaltante.

El equipo busca a un soldado que supuestamente es un prisionero de guerra en Afganistán cuando se encuentran sus huellas en la escena de un crimen.

El quipo sigue la pista de la dinamita robada a la armada hasta un almacén de cocaína dirigido por un amigo de la infancia de Sonja.

El equipo de NCIS protege a un DJ local de un perpetrador que lo amenaza e investiga el asesinato de un capitán de la Marina que fue atacado mientras estaba en el aire en un programa de radio.

Una furgoneta de vigilancia llena de fotos de Pride documentando cada uno de sus movimientos se descubre después de que su hija sufra un ataque en el campus.

El equipo de NCIS investiga el asesinato de un teniente de la Marina durante un desfile fúnebre en el barrio francés, una tradición de Nueva Orleans que conmemora a los fallecidos recientes con un pasacalles musical.

Tras la muerte de un teniente de la Marina durante la visita clandestina a la habitación de hotel de un general, se pide a la agente especial Pride y al equipo de las CEI romper el protocolo estándar para la investigación del asesinato.

Un especialista culinario de la Marina es el blanco en una explosión durante su visita al restaurante de su familia en el barrio francés. Además, Brody está en DC siguiendo una pista sobre el caso de las filtraciones.

El equipo de NCIS se une al equipo de Seguridad Nacional para investigar la muerte de un buceador profesioal de la marina que está vinculada con un ataque desde fuera a la ciudad.

El equipo de NCIS descubre a un topo en las filas mientras trabaja con el Departamento de Seguridad Nacional para localizar 900 kilos de explosivos desaparecidos que suponen una amenaza inminente para Nueva Orleans.