Een zaak wordt persoonlijk voor Pride als het lichaam van een onderofficier wordt geïdentificeerd als een voormalig bendelid dat hij ooit heeft begeleid.

Tony DiNozzo assisteert het New Orleans team als een luitenant sterft aan de builenpest. Het team haast zich om alle mariniers te vinden en te controleren op een mogelijke uitbraak.

Het team onderzoekt de crash van een gepantserde transportbus. Vier gedetineerden weten te ontsnappen, waaronder een makelaar welke een grote bedreiging voor de veiligheid van het land vormt.

Een Navy SEAL wordt vermoord in een studentenhuis, het NCIS-team onderzoekt of het betrekking had op een van zijn missies of dat het overlijden het gevolg was van smerig spel van collega’s.

Het NCIS-team krijgt een deadline van 22 uur als het onderzoek naar de moord op een adjudant-chef gespecialiseerd in contraspionage onthult dat zijn vrouw ontvoerd is en vastgehouden wordt voor losgeld. Fornell reist naar New Orleans om te helpen met de zaak.

Met New Orleans volledig versierd voor Halloween onderzoekt het team de moord op een JAG advocaat die gekleed in een Victoriaans kostuum met wonden zoals van een vampierenbeet in haar nek gevonden werd op een kerkhof.

Een marine-officier met toegang van topgeheim van het hoogste niveau wordt vermoord nadat hij onlangs als technisch liaison toegewezen was aan een privé-ontwikkelaar.

Een onderofficier wordt dood gevonden in een drijvende Mardi Gras opslagplaats met een verlovingsring in zijn hand. Het onderzoek neemt een mysterieuze wending als het team zijn veronderstelde vriendin niet kan vinden.

Nadat een gestolen geweer uitgegeven door de marine gelinkt wordt aan een 2e klas officier die 40 jaar geleden gestorven is, heropent het NCIS -team de cold case die Wade persoonlijk jaren had onderzocht.

Het NCIS-team onderzoekt de moord op een gepensioneerde SEAL die mensen opspoorde die zich voordeden als militair personeel. De zaak neemt echter een mysterieuze wending als de hoofdverdachte gevonden wordt met de marine vest van een officier waarvan gedacht werd dat hij gedood was in een gevecht in Afganistan.

Het team onderzoekt een dodelijke explosie tijdens een gala van de korps mariniers en ontdekken dat het doel van de explosie was om Pride om te brengen.

Als de dochter van een admiraal de hoofdverdachte is van een dubbele moord aan boord van een onderzoekschip werkt het NCIS-team samen met de CGIS. Ondertussen gaat Lasalle opzoek naar zijn vervreemde broer.

Een luitenant-commandant van de marine met een smetteloze staat van dienst, roept de hulp in van Pride en zijn team om zijn onvermijdelijke moordenaar op te sporen als ontdekt wordt dat hij vergiftigd is met een dodelijke dosis radioactief gif.

Als een NCIS-agent wordt gedood tijdens het beschermen van de vice- president van de marine, onderzoekt het team of het een aanslag is op de president of op een van henzelf.

Als er een onderofficier dood wordt gevonden tijdens de festiviteiten van Mardi Grass moet het team onderzoeken welke parades en feestje tot zijn dood hebben geleid.

Nadat een recruiter voor de marine het slachtoffer is van een dodelijke aanrijding onderzoekt het team of de aanrijding kwam vanwege haar werk of haar rol als stiefmoeder van twee broers. Lasalle wordt steeds bezorgder over het welzijn van zijn broer nadat hij hem in huis heeft genomen.

Nadat een matroos vermoord is in de champagne kamer van een stripclub, linkt het NCIS-team het moordwapen aan twee andere onopgeloste zaken en ontdekt dat de namen van de drie slachtoffers verschijnen op een muurschildering in een vervallen deel van de stad.

Tijdens een autopsie op een onderofficier, van wie men denkt dat hij is overleden door een natuurlijke oorzaak, komt er een gewapende man het mortuarium binnen en gijzelt Wade, Sebastian en Danny.

Als de auto van een marine-commandant gestolen wordt, moet het NCIS-team uitzoeken of het om een willekeurige diefstal gaat of om een gerichte ontvoering.

Zonder geheugen van de nacht ervoor roept Lasalle's broer de hulp in van NCIS als hij het lichaam van zijn vriendin in de kofferbak van zijn auto vind. Ondanks een berg van bewijs dat hij betrokken is, is Lasalle vastbesloten de onschuld van zijn broer te bewijzen.

Om een boodschap naar Pride te versturen vermoord Baitfish iemand die dicht bij het team staat. Wat ervoor zorgt dat er een grote zoektocht wordt gestart naar de ongrijpbare crimineel.

Pride vermoed dat er een mol binnen NCIS en de lokale politie is.