Después de derrotar a Jason y aceptar su mitad ghoul, Kaneki se une al árbol Aogiri para proteger a los que están cerca de él en Anteiku.

Ahora con Kaneki en sus filas,el árbol Aogiri toma la ofensiva contra el CCG, y Amon es presentado a la hija de Mado, Akira, quien es asignada para convertirse en su nueva compañera.

Kaneki y Ayato rescatan a Naki, una de las antiguas cohortes de Jason de la custodia de CCG, y se preparan para irrumpir en la prisión de máxima seguridad para los Ghouls conocidos como "Cochlea". Mientras tanto, Tōka hace una visita a la universidad donde Kaneki solía asistir, donde tiene un encuentro con Hideyoshi.

Aogiri comienza su invasión de Cóclea y libera a la mayoría de los ghouls encarcelados mientras que Amon y Akira visitan la prisión para aprender más sobre el plan de Aogiri de Donato Porpora. En medio de las batallas entre el CCG, la seguridad de Cochlea y los ghouls, Kaneki se encuentra con un ghoul llamado Orca con órdenes de liberarlo, pero es atacado por él.

La batalla en Cochlea se intensifica en varios frentes y cuando Ayato casi muere, es rescatado en el último momento por Kaneki, quien sufre una extraña transformación después de consumir los cuerpos de varios Ghouls muertos para fortalecerse.

La aparición del " Ghoul de un solo ojo", considerado el más peligroso de todos, deja al CCG en estado de alerta mientras Kaneki se retuerce de dolor debido a su nueva condición.

Preocupado por la desaparición de Kaneki, Hinami quiere hacer algo por él, pero no está segura de que hacer, hasta que Kaneki aparece en Anteiku y ella llama a Touka para que lo vea de nuevo.

Durante la visita de Kaneki con Yoshimura, él pide información sobre el búho, y este le cuenta la trágica historia de un joven ghoul llamado Kuzen. Touka hace planes para mudarse de Anteiku. Un día nevado trae consigo negocios rápidos en la cafetería.

A Yoshitoki se le concede permiso para ejecutar la operación para erradicar al búho. Los muchos oficiales de CCG involucrados en la misión toman tiempo de antemano para escribir las últimas palabras que puedan tener, ya que el 20º Distrito está acordonado y sus civiles evacuados.

Suzuya se enfrenta al búho de un solo ojo. El árbol Aogirise une a la batalla contra el CCG, que se sienten abrumados por la gran cantidad de oponentes. Mientras tanto, Kaneki se enfrenta a Amon, que se interpone en su camino a Anteiku.

Después de despertarse en Anteiku, Kaneki escucha decir a alguien decir que "hacer café es difícil". Al momento se revela que ese alguien es Hide. En ese momento Kaneki se da cuenta de que tiene activado su ojo ghoul, Hide le dice "Yo sabía".