Après avoir tenté d’alerter des enfants du danger dans un square, Ronald Belasko est violemment percuté par un taxi et décède sur le coup. Un peu plus tard, Théo, un petit garçon âgé de 5 ans, est enlevé devant chez lui. L’enquête mène Meredith et Billy dans une agence d’adoption employant des méthodes très contestables… Jake rentre une semaine plus tôt de son congé maladie, mais le capitaine Santiani ne semble pas décidé à lui céder la place, ni maintenant, ni plus tard… Laura et lui se démènent pour retrouver le petit garçon diabétique au plus vite car il risque de tomber dans un coma qui peut lui être fatal…

Le corps sans vie d'une jeune femme est découvert à Soho. Atteinte d'un cancer, elle aurait mis fin à ses jours en avalant de la ciguë. Mais dans l'appartement, Laura relève certains détails qui ne collent pas. Et Reynaldo lui confirme que la victime n'était pas malade. Pour pouvoir enquêter sur cette étrange simulation, Laura doit convaincre l'intraitable capitaine Santiani...

Zac Romero, un milliardaire âgé de 22 ans, prodige de la nanotechnologie, est retrouvé assassiné chez lui, dans un immeuble pourtant réputé pour être aussi sûr qu’un coffre-fort. Quand Laura apprend que Zac est allé au restaurant le soir de sa mort, alors que les caméras de surveillance de l’immeuble ne l’ont pas filmé sortant de chez lui, les enquêteurs tentent de comprendre comment il s’y est pris. Ils découvrent que le jeune homme passait par une entrée cachée au fond d’une épicerie pour éviter les paparazzi, mais que personne n’a pu le suivre et emprunter le même chemin le soir en question. L’équipe soupçonne d’abord un homme avec qui Zac s’est disputé peu de temps avant de perdre la vie, et Shane Allen, l’associé de Romero, qui est sur le point de vendre un projet sur lequel Zac travaillait. Les deux suspects ayant d’excellents alibis, les enquêteurs cherchent alors des informations dans le téléphone portable de la victime. Ils découvrent que Zac ne lisait ni ses e-mails, ni ses SMS et qu’il n’écoutait jamais ses messages vocaux.

Une jeune femme alerte les secours car une personne tente de précipiter sa voiture dans l’Hudson. L’agresseur parvient, semble-t-il, à ses fins puisque la voiture tombe dans le fleuve et le corps de sa conductrice ne réapparaît pas. Le mari de la victime, un homme très aisé, propriétaire d’un magazine new-yorkais, oriente Laura et Jake sur la piste de motards qu’il a provoqués dans un article...

L’équipe enquête sur la mort de Matthew Burke, le propriétaire d’un club de sport, retrouvé mort dans son sauna. Laura et Jake interrogent Julie McKenna, une membre du club qui s’entraîne avec son mari pour le jeu télévisé American Ninja Warrior. La scientifique ayant découvert dans le véhicule de la victime des fibres de couleur orange, similaires au filet de protection du parcours d’obstacles des McKenna, l’équipe retourne voir le couple. Les enquêteurs découvrent alors que les McKenna ont vidé les lieux et ont brûlé des documents, dont des photos de plans de bâtiments sur lesquels Cecilia Burke, l’épouse de la victime, travaille. La scientifique trouve sur place des résidus de RDX, un des composants du C4. Laura demande donc l’aide de Cecilia pour découvrir quelle peut être la cible des McKenna. L’équipe pense que le couple veut cambrioler une banque à l’aide d’explosifs...

Une femme enceinte est trouvée morte dans un caniveau. Son bébé est sauvé in extremis. Elle faisait partie d’un réseau de contrebande de pierres précieuses, en provenance du Nigeria. L’enquête mène Laura dans une maternité clandestine pour de riches étrangères.

Un policier infiltré a été abattu par un gang de voleurs de voitures de luxe. Le meurtrier est arrêté, mais il reste à découvrir qui a révélé la véritable identité du policier infiltré. Meredith mène l’enquête dans le système informatique de la police et découvre que la victime et tout le Poste Deux sont la cible du même hacker.

Deux hommes participant à une chasse au trésor découvrent le corps d’un homme dans une église. Laura et Jake pensent que la victime participait probablement à cette chasse et qu’un concurrent l’a éliminée pour se retrouver en tête et remporter le prix de 100 000 dollars. Jake décide donc de se lancer dans la course afin de prendre le tueur à son propre jeu. Mais le gagnant de la chasse au trésor prouve aux enquêteurs qu’il n’a pas commis le meurtre, bien qu’il ait dérobé l’appareil photo de la victime.

Michael Dunham, parfumeur et P.-D.G. de la parfumerie Belle Rêve, est abattu devant ses locaux, à six heures du matin. Toute l’équipe a passé une nuit blanche au laboratoire pour mettre la dernière main au lancement d’un parfum. Malgré tout, de lourds soupçons pèsent sur son fils, Jon, que Laura refuse d’envisager comme coupable. D’autre part, elle annonce à Jake sa décision de vivre avec Tony.

Soupçonné d’être l’auteur du meurtre de son père, Jon Dunham fait sauter le laboratoire de Belle Rêve et disparaît à cette occasion, pour réapparaître chez Laura qu’il prend en otage en l’absence des enfants. Il affirme être innocent et veut lui faire avouer qu’elle est l’auteure de la machination qui l’a fait accuser...

Laura et Jake enquêtent sur la mort du docteur Aidan Silverman, qui a été poussé devant un bus alors qu’il faisait son jogging. Mimi Silverman, la femme de la victime, leur explique qu'ils allaient partir vivre en Europe, parce que la FIFA venait d'engager son mari en tant que médecin en chef. L’avocate de la victime affirme aux enquêteurs que Kurt Berhenson, le père biologique du fils de Mimi, était contre le départ de leur fils à l’étranger. L’équipe fait alors des recherches sur Berhenson et apprend qu’il fait partie de L'association pour la renaissance des hommes, un groupe d’hommes misogynes estimant que tous leurs problèmes viennent des femmes. N’ayant pas de quoi inculper Kurt, les enquêteurs tentent de savoir s’il suivait Aidan pour le tuer. En réalité, George Vascos, un autre membre de l’association, suivait le docteur Silverman.

Paul est assassiné et sa compagne, enlevée selon le mode opératoire d’un tueur en série, supposément arrêté, puis tué des années auparavant par la police. Dan Hauser, qui avait travaillé sur cette affaire à l’époque, obtient une autorisation exceptionnelle de sortie de prison pour faire avancer l’enquête. Si le prétendu imitateur suit le mode opératoire du tueur en série, Rachelle, la compagne de la victime, n’a plus que quelques heures à vivre avant de finir à Central Park à minuit, pour la Saint-Valentin. Laura n’a pas encore annoncé à Jake sa rupture avec Tony. Alors qu’elle s’apprête à le faire, il emmène dîner Jennifer en tête-à-tête pour la remercier de son aide sur l’affaire…

Dans le cadre de la normalisation des relations entre les Etats-Unis et Cuba, Carlos Hernandez, un haut personnage cubain, arrive à New York avec son épouse et sa suite. Laura et Jake sont chargés de leur sécurité. Mais dès leur arrivée, le chef de la sécurité de la délégation cubaine est assassiné. Laura ne croit pas à une simple agression qui aurait mal tourné. Laura et tout le deuxième district vont devoir redoubler de vigilance pour protéger Carlos, qui doit prononcer un discours très attendu devant l’assemblée générale des Nations Unies.

Laura reçoit un coup de fil anonyme d’un homme l’appelant au secours avant de mourir, abattu. Meredith et Laura trouvent le corps de la victime et découvrent qu’il s’agit de Ian Gendry, le petit ami de Lucy, la demi-sœur de Laura. cette dernière décide donc de localiser Lucy pour comprendre ce qui se passe avant que la police ne l’arrête pour meurtre. Cela vaut à l’enquêtrice de se retrouver coincée au poste, d’autant qu’elle a caché d'importants éléments au lieutenant Harris, l’enquêteur du 82e district chargé de l’affaire d’homicide. Billy apprend que Ian Gendry était impliqué dans un trafic de médicaments contrefaits. Santiani oblige alors Harris à collaborer avec le 2e district, puisque les affaires de meurtre et de trafic de stupéfiants sont étroitement liées. L’équipe découvre que Lucy était impliquée dans le marché noir de produits pharmaceutiques, contrairement à ce qu’elle disait. Laura lui demande donc de l’aider à arrêter Jimmy Chun, le baron de la drogue ayant tué Ian parce qu’il avait essayé de le doubler.

Le capitaine Santiani a été abattu en pleine conférence de presse. Son fils, Justin, a été enlevé. Les soupçons se portent rapidement sur Vince, l’ex-mari du capitaine, qui avait reçu une injonction d’éloignement. Une fois débusqué, il avoue avoir enlevé Justin pour le protéger d’un règlement de comptes…