Murphy hat die nuklearen Sprengköpfe gezündet. Jetzt ist jeder auf sich allein gestellt, und so kommt es, dass die Gruppe sich auf der Suche nach einem geschützten Ort trennt. Citizen Z muss sich mit aufgetauten Zombies herumschlagen und hat keinen Kontakt zu seinem Team. Er beschließt, ein Kopfgeld auf Murphy auszusetzen und fährt mit Roberta, Doc, 10K und Addy nach Wyoming.

Die Helden bekämpfen Zombies und übereifrige Kopfgeldjäger. Murphy gelingt die Flucht, während Vasquez eine Zusammenarbeit mit der Gruppe in Betracht zieht.

Die Helden entdecken einen Zug, der Überlebende der Nuklearexplosion in Sicherheit bringt. Gemeinsam suchen sie nach einem Heilmittel.

Murphy und Cassandra haben auf der Suche nach noch mehr Z-Weed ein Labor in Minnesota gefunden. Dort versucht eine Gruppe Überlebender, in Gewächshäusern „Batch 47“ herzustellen, ein pflanzliches Mittel gegen den Zombie-Virus. Allerdings hat sich in den Labors ein Zombie-Hybrid, halb Pflanze, halb Zombie, breitgemacht. Mit seinen telepathischen Fähigkeiten gelingt es Murphy immerhin, ein Muster von „Batch 47“ zu empfangen. Erste Tests mit einem enthaupteten Zombie sind vielversprechend.

Rechtzeitig bevor Serena niederkommt, trifft die Gruppe in einer Mennoniten-Gemeinde ein. Derweil haben sich 10K und Addy mit dem Milzbranderreger infiziert. Roberta Warren stiehlt den Mennoniten, die sich hilfreich und kooperativ gezeigt haben, deren Antibiotika-Vorräte, um 10K und Addy retten zu können. Kurz nachdem Serena ihre Tochter zur Welt gebracht hat, greift eine Horde Zombies an. Ausgerechnet die junge Mutter wird gebissen.

Murphy setzt sich von der Gruppe ab, weil er Angst hat, dass seine Begleiter ihm das Baby wegnehmen und es töten. Er beauftragt Cassandra, darauf zu achten, dass die Gruppe zusammenbleibt und nicht nach ihm sucht. Als auch Vasquez sich absetzt, nimmt Roberta Warren die Verfolgung auf. Sie findet ihn und erfährt, dass er weg wollte, um den Mann zu suchen, der seine Familie auf dem Gewissen hat

Beim Überqueren des Mississippi kommt es zu einem Bootsunfall und die Gruppe wird auseinandergerissen. 10K gerät an Sketchy und Skeezy, denen es gelingt, ihn in ihre Betrügereien zu verwickeln. Dabei geraten sie an Hector „Escorpion“ Alvarez, den stellvertretenden Boss eines mexikanischen Drogenkartells. Der fackelt nicht lange und verurteilt die drei Männer zum Tode. Roberta Warren sucht derweil mit dem Rest der Gruppe nach 10K.

Während Murphy vom Rest der Gruppe getrennt ist, tappt er in die Falle eines psychopathischen Zombie-Sammlers, der ihn in einer Art Zombie-Museum ausstellen will. Während Murphy festsitzt und ihn die anderen in einer nahen Kleinstadt suchen, rekapituliert er noch einmal, wie er zu dem wurde, was er jetzt ist. 10K gelingt es schließlich, Murphy zu finden. Doch auch er geht dem Sammler in die Falle. Den beiden Gefangenen bleibt nichts anderes übrig, als darauf zu hoffen, vom Rest der Gruppe gefunden zu werden.

Die Gruppe teilt sich auf, nachdem sie auf eine große Zombieherde trifft. Dabei stoßen sie auf einen alten Indianerstamm, deren Angehörige gegeneinander kämpfen.

Die Überlebenden werden in eine ungewöhnliche Situation verwickelt, als sie auf ein paar Bürokraten treffen, die in einem verlassenen Hotel Unterschlupf gesucht haben.

Das Team trifft nach seiner Gefangennahme auf La Reina, Queen of the Zeros. Dr. Kurian bereitet sich unterdessen in Zero auf Menschenversuche mit seinem Z-Impfmittel vor.

Das Chaos bricht aus als sich herausstellt, dass Dr. Kurians Z-Vaccine überhaupt nicht wirkt und jeder, der geimpft wurde nun anfällig für Murphys Gehirnwäsche ist. Unterdessen versucht Warren Vasquez zu befreien nachdem er von La Reina zum Tode verurteilt wurde.

Die Helden erinnern sich bei ihrer Ankunft in Kalifornien an ihre Vergangenheit, inklusive dem Ort, an dem sie waren als die Zombieapokalypse startete.

Die Gruppe erreicht ein mobiles Labor, was sich wenig später als ein altes U-Boot herausstellt. Murphy verabschiedet sich indes von seinen Mitstreitern.