Mary inizia il secondo atto del Grand Rite sperando di potersi riunire con suo figlio per sempre. Nel frattempo John Alden torna a Salem. Intanto l’epidemia di peste continua a fare vittime.

Mary riceve l'aiuto di un ex nemico affinché Salem resti sotto il controllo delle streghe. John fa la sua prima mossa per il compito che dovrà affrontare. Anne e Cotton scoprono di condividere qualcosa.

Mary cerca il colpevole degli attacchi contro di lei. Anne esplora il suo lato soprannaturale; al suo ritorno a Salem, Cotton incontra il dottor Wainwright. John Alden continua a fare sentire la sua presenza in città.

Mary si confronta finalmente faccia a faccia con il suo aguzzino, la Contessa Marburg. Nel frattempo, John Alden cerca risposte sui libri di Cotton.

La contessa Marburg arriva a Salem. La donna è decisa a prendere il controllo della città e attaccare la roccaforte di Mary. John segue Anne ma per farlo deve usare un incantesimo che lo indebolisce.

Mary e la Contessa Marburg mantengono le apparenze, pur continuando la loro battaglia segreta per Salem. Wainwright torna a Salem con delle informazioni che possono far luce sul ceppo di peste che ha colpito la città.

Mary prova a scoprire il tallone d'Achille della Contessa Marburg. Nel frattempo Anna Hale comincia a conoscere alcuni dei segreti più nascosti del padre. Tituba cerca di trovare un accordo con chi ha catturato John Alden. Wainwright capisce che la scienza non ha tutte le risposte.

Mary e Wainwright si avvicinano e allo stesso tempo, la cometa Starry Messenger si avvicina alla Terra; Anna continua nella lettura dagli scritti del padre mentre mentre una faida covata per molto tempo raggiunge un punto di non ritorno.

John Alden affronta il suo primo test di paternità dopo aver unito le forze con Mary. La Contessa di Marburg si prepara per l'arrivo del suo amante. Cotton Mather affronta la sua imminente morte.

Mary soffre sotto il giogo dell'oppressione puritana derivante da un'alleanza tra i Marburg e un altro dei suoi potenti nemici. John Alden e Cotton lavorano insieme per salvare l'anima del ragazzo.

Il conto alla rovescia per la consacrazione inizia. Mary fa un ultimo disperato tentativo per fermare il piano della Contessa Marburg mentre le alleanze cambiano dopo che alcune verità sorprendenti sono rivelate.

Mary si rifiuta di credere che suo figlio è ancora vivo, mentre la Contessa fa tutto il possibile per impressionare il ragazzo. Anna cerca di convincere Cotton che lei usa i suoi poteri a fin di bene e John Alden è in precario equilibrio tra la vita e la morte