John ritorna dalla guerra. Tornato a Salem scopre che è iniziata la cosiddetta caccia alle streghe. Cottor Mather arriva a Salem per far parte del consiglio che deciderà la sorte di chi è sospettato di aver fatto un patto col demonio. Arrivato in città, però, Cottor si innamora di una prostituta, Gloriana. Mary, insieme a Tituba, è pronta a incolpare gli innocenti di stregoneria per poter compiere un rituale di notevole importanza. John cerca di andarsene da Salem, ma Isaac lo ferma, facendogli vedere, in un angolo remoto della foresta, streghe e stregoni.

Dopo la prima morte del Gran Rito, Mary intende sacrificare un altro innocente prima della prossima luna piena sotto forma di un segno. Nel frattempo, John lavora con Cotton Mather e Issac Walton al fine di individuare e fermare le streghe.

Quando il Magistrato Hale scopre che è stato Isaac a rompere il cerchio delle streghe, tocca a John salvarlo. Emerge una lotta di potere che costringe Mary ad affermare la sua autorità con conseguenze potenzialmente mortali.

Un volto dal passato di John arriva a Salem, ed i piani di Mary quasi si dissolvono quando lei perde il controllo di Mercy Lewis. Altrove, l'alleato più fidato di Maria, Tituba, è costretto a trarre in inganno John al fine di eliminare una minaccia che mette in pericolo la sua padrona.

Mary ha una discussione con la congrega delle streghe, mentre Alden e Cotton vengono a conoscenza di una preziosa reliquia, il malem.

Alden e Cotton si trovano finalmente faccia a faccia con una vera strega. Intanto Mary cerca una soluzione ai problemi interni alla congrega.

L'arrivo del padre di Cotton sconvolge la cittadina. Allo stesso tempo il controllo che Mary ha su George viene compromesso.

Mary ha difficoltà ad assoggettare nuovamente George alla sua volontà, mentre il potere di Mercy non fa che aumentare e lei non ha remore a dimostrarlo.

Anne sta indagando su un mistero ma si ritrova in pericolo e necessita dell'aiuto di Alden.

Nuove accuse piovono su Alden mentre Anne scopre la verità su suo padre.

Le alleanze presenti vanno in frantumi e il fato di Salem è messo alla prova quando il processo di Alden comincia.

Alden scopre il più grande segreto di Mary con pesanti conseguenze. Salem è ormai in prossimità del Grande Rito.