Efter att ha kämpat i de fransk-indianska krigen i sju års tid återvänder John Alden hem till Salem i Massachusetts i syfte att återförenas med sin kärlek Mary.

Eftersom han övertygats om att häxor finns men inte vet tillräckligt mycket om dem, går John Alden i en allians med häxjägaren Cotton Mather.

När pastor Lewis bevittnar en exorcism utförd på hans besatta dotter Mercy, skapar resultatet problem för flocken och ifrågasätter Marys ledarskap.

Efter att ha varnats att John Aldens närvaro i Salem utgör ett stort hot mot deras Stora Riter, planerar häxorna Hale och Rose att försöka tvinga ut kaptenen ur stan.

John och Cotton utnyttjar en ovanlig stjärnformation för att förhöra en infångad häxa. Mary tar en ambitiös Mercy under sina vingar, men alla i flocken är inte nöjda med hennes planer för den blivande häxan.

I syfte att hitta en kraftfull, magisk artefakt som befinner sig i John Ladens ägo, beger sig Mary in i sin före detta älskares drömvärld.

Increase Mathers oväntade ankomst skapar problem för många av Salems invånare, såväl häxor som icke-häxor.

Medan Increase Mathers väntar på att den medvetslöse George Sibley ska vakna och identifiera den häxa som förhäxade honom, behöver Mary hjälp att tysta sin make.

Inrease Mather inleder sitt brutala förhör med Tituba i ett försök att avslöja ledaren för Salems häxförsamling.

Mary använder all sin kraft för att befria John Alden ur Salems fängelse innan Increase Mather ställer honom inför rätta för häxeri. Domare Hale avslöjar en hemlighet för sin dotter.

När John Aldens rättegång för häxeri tar sin början ställs han inför en anklagelse han inte kan motbevisa, vilket får även hans mest trogna allierade att misstro hans oskuld.

Medan John och Mary planerar att befria Salem tillsammans, konspirerar andra i staden att förhindra deras avresa, vilket leder till en oundviklig konfrontation.