In seizoen vijf is de wereld eindelijk aan het herstellen van het dodelijke virus dat de bevolking heeft gedecimeerd, maar de wereldwijde politieke onrust blijft bestaan. Tom Chandler is met pensioen en zijn voormalige bemanning is verspreid. Sasha Cooper, luitenant Danny Green, SBS WO-N Wolf Taylor en sergeant Azima Kandie zijn op een geheime missie in Panama. Als ze ten onrechte de schuld krijgen van een aanslag op de Panamese president, zijn de gevolgen voor de Verenigde Staten verschrikkelijk. De Nathan James moet vechten om een invasie door Latijns-Amerika en de volgende wereldoorlog te voorkomen.

In season five, the world is finally recovering from the deadly virus that decimated the population, but global political unrest still remains. Tom Chandler has retired and his former crew has scattered. Sasha Cooper, Lieutenant Danny Green, SBS WO-N Wolf Taylor and Sergeant Azima Kandie are on a covert mission in Panama. When they are wrongly blamed for an attack on the Panamanian President, the consequences for the United States are dire. The Nathan James must fight to prevent invasion by Latin America and the next world war.

Nella quinta stagione, il mondo si sta finalmente riprendendo dal virus mortale che ha decimato la popolazione, ma i disordini politici globali rimangono ancora. Tom Chandler si è ritirato e il suo ex equipaggio si è sparpagliato. Sasha Cooper, il tenente Danny Green, SBS WO-N Wolf Taylor e il sergente Azima Kandie sono in missione segreta a Panama. Quando sono incolpati per un attacco al presidente panamense, le conseguenze per gli Stati Uniti sono drammatiche. LaNathan James deve combattere per prevenire l'invasione dell'America Latina e la prossima guerra mondiale.