Cabe-et a Nemzetbiztonság új vezetője, Adriana Molina (Alana De Garza) visszahívja régi munkakörébe, és egyúttal új megbízást ad a Skorpió csapatnak. Cabe azonnal felkeresi Waltert, aki emiatt önkényesen abbahagyja baleset utáni rehabilitációját, bár még nem épült fel teljesen.

A csapat új feladata megakadályozni a keringési pályájáról eltérített, nukleáris meghajtású orosz műhold lezuhanását és felrobbanását Dél-Kaliforniában, miközben velük párhuzamosan a Rakétarepülést Irányító Központ is megpróbálja elterelni a gyakorlatilag atombombává változott műholdat. Walter és Paige között érezhető feszültség van az egymás iránti érzelmeik tisztázatlansága miatt, ezért többször is kínos helyzetbe kerülnek a többiek előtt. Nehezíti a munkát, hogy Walter rosszullétei miatt még nem tud száz százalékosan teljesíteni, ezt azonban csak Paige és Cabe veszi észre...

Walter nem akarja elismerni a bíróságon, hogy korábbi balesete felfokozott érzelmi állapota miatt következett be, pedig ez enyhítő körülmény lenne a számára. Ügyvédje Paige-re bízza, hogy győzze meg őt a nap folyamán.

A garázsba egy fiatal nő állít be, akit gyermekként Cabe mentett meg a délszláv háborúban és most Cabe segítségét kéri abban, hogy a családja haláláért felelős háborús bűnöst Kubában elkaphassák és nemzetközi bíróság elé állíthassák. Cabe bevonja az ügybe Molinát is, aki a háttérből segít a Kubába utazó csapatnak. Paige és Walter között feszültség van korábbi megállapodásuk betartása miatt...

Ralphot zaklatják az iskolában, ezért Paige beszélni akar az igazgatóval, ám Ralph a saját kezébe veszi a probléma megoldását. A csapat speciális feladatot kap, három szövetségi bíró életét kell megmenteniük egy japán bűnbandától úgy, hogy megfejtik a banda főnökének börtönben írt kódolt feljegyzéseit, bennük a bírók nevével. A kódfejtés miatt Sylvester a legalkalmasabb a feladatra, ezért fogában egy mikrofonnal bevonul egy szövetségi börtönbe. Az élete azonban veszélybe kerül, és a mikrofonját is elveszíti, mert összetűzésbe kerül egy másik rabbal. Walter Rayt is bevonja a munkába, Paige társaságában ügyvédként jelenik meg a börtönben...

Happy még mindig találkozgat a furcsa bajszú Chet-tel, ezért Toby féltékeny dühében bokszolni kezd, melyhez Cabe-től kap aktív segítséget.

Adriana Molina helyébe egy igazi hivatalnok, Katherine Cooper lép, aki első intézkedéseként Ray kiebrudalását kéri a garázsból, melybe Walter beleegyezik.

A csapat aktuális feladata egy olyan adathalász-eszköz kielemzése, melyet egy Kalifornia partjainál hajózó tengeralattjáró kommunikációs kábeléhez csatlakoztattak. Walter, Cabe és Happy a fedélzeten vannak, amikor az eszköz felrobban és ettől a tengeralattjáró súlyosan megsérül...

Megan új kezelésének időpontját váratlanul előbbre hozzák, ezért Sylvester személyes okokra hivatkozva nem megy a csapattal új küldetésükre. A munka egy régi kazahsztáni katonai bázisra szólítja őket, ahol egy szervezett bűnbanda egy 70-es évekből származó szovjet nukleáris rakétát akar eladni.

A csapat a helyszínen filmes stábnak adja ki magát, a kamerában azonban olyan detektor van, mellyel a rakétát keresik. Őrökkel a nyomukban kapóra jön egy Super Fun Guy film forgatása, így szuperhős jelmezekbe bújva álcázzák magukat...

Miután Walter nem jelenik meg a garázsban, Paige és Cabe keresni kezdik őt. Egy hotelszobában találják meg másnaposan, és nem emlékszik semmire az előző éjszakából. Sietniük kell, mert a többiek már várják őket Richard Elia okos irodaházának átadásán, melynek biztonsági rendszerét a Skorpió csapat készítette.

Az átadás után azonban váratlanul problémák lépnek fel az épület működésében, amelynek oka, hogy ismeretlenek Walter gépének feltörésével vírust juttattak be a rendszerbe...

Előző este Toby elvesztette első bokszmérkőzését, de a kiütésnél is jobban bántja, hogy Happy nem volt ott. Paige és Ralph metróval egy múzeum felé tartanak, ám a szerelvény nem áll meg az állomásnál, hanem érezhetően nagyobb sebességgel halad tovább alagútban. Egy bűnbanda tört be a metró központi irányítórendszerébe, és ők irányítják a vonatot, mivel így akarnak bejutni a Los-angelesi repülőtér területén levő szigorúan őrzött raktárba, hogy ellopjanak onnan 50 millió dollárnyi brit aranyat...

Walter rá akar kényszeríteni Meganra egy új, a korábbinál agresszívabb kezelést és szinte követeli Sylvester támogatását ebben. Megan azonban nem akarja alávetni magát egy újabb tortúrának és arra kéri Sylvestert, álljon mellé Walterrel szemben...

Megan állapota egyre romlik, de Walter mindenáron el akarja érni, hogy a lány által elutasított kezelést mégis elvégezzék rajta, ezért bírósági végzést szerez arról, hogy ő dönthet helyette.

A csapat az MI6-el dolgozik együtt New Yorkban, ahová Olivia Cromwell igazgatónő mellett egy Gleason nevű ügynök is velük tart.

A küldetés célja elfogni és így megakadályozni Mr. Madaky buritani nagykövetet (aki valójában fegyverkereskedő) abban, hogy fegyvereket szállítson a lázadó forradalmárokkal harcoló fegyvereseknek. Jó alkalom kínálkozik erre, hogy most felszólal az ENSZ közgyűlésén, mert el tudják választani biztonsági csapatától és elkaphatják őt. A szükséges eszközök becsempészése Paige feladata, a módját azonban Walter találja ki, mellyel először meghökkenti a társaságot.

Megan rosszabbodó állapota miatt szüleik eljönnek hozzá a kórházba, ahová Walter és a csapat is velük tart. Rövid idő múlva egy súlyos gombafertőzés kezd terjedni, és a Járványügyi Központ úgy gondolja, hogy a Stachybotrys nevű gombafaj került be az épületbe. Karantént rendelnek el és megpróbálják kiirtani a feltételezett gombát, de a helyzet nem javul. A bent rekedt Skorpió csapatra hárul megkeresni a fertőzés valódi forrását, amit Toby érdekes helyen talál meg.

Sylvester véletlenül találja meg az ellenanyagot, amiből egy labdányi mintát kijuttat Cabe-nek és Ralphnak, akik nagy mennyiséget kevernek össze belőle, majd Happy egyedi megoldással szétpermetezi az épületben. Eközben Walter és édesapja egy közös szigetelési munka közben kicsit közelebb kerülnek egymáshoz.

A csapat még hat héttel Megan halála után is a szomorú esemény hatása alatt áll, Walter pedig Ray tragédiájába ássa bele magát, hogy ezzel elterelje a figyelmét a saját fájdalmáról. Ralph iskolai feladata egy időkapszula készítése, melyhez Paige a többiektől is különféle tárgyakat kér. Cooper ügynök sürgős munkával keresi meg őket, mivel cyber terroristák egy zsarolóprogrammal betörtek a Szövetségi Bank rendszerébe és negyedmilliárd dollárnak megfelelő bitcoint kérnek 72 órán belül. Ha nem kapják meg, leállítják a szoftver működését, amely a teljes bankrendszer összeomlásával és ennek következtében a világra kiterjedő gazdasági katasztrófával fenyeget...

A garázsban nincs karácsonyi hangulat, és Walter pedig egyre furcsábban viselkedik. Új megbízásuk az Augustine Erőműhöz hívja őket, ahol kritikus helyzet alakult ki a központi épület tetőszerkezetére dőlt fa miatt, és félő, hogy az esővíz betör a transzformátorházba. Zárlat esetén 100 ezer ember maradhat áram nélkül karácsony este az erőműnél fekvő városban. A rendszer helyreállítása és a tető javításának komplikáltsága miatt kérik a csapat segítségét.

Walter a közösségi médiában szélesítené társadalmi kapcsolatait, és lelkesen veti bele magát virtuális barátok megszerzésébe.

A csapatot ma hideg helyre vezényelik, az Antarktiszon levő McMurdo kutatóállomás kell menniük, mert a Pentagon elveszítette a kapcsolatot az egyik földkörüli pályán levő műholdjukkal, amely a katonai drónokat irányítja. Egy katonai csapatot küldtek korábban Darfurba, akik egy falvakat lemészároló hadúrral akarnak leszámolni, de működő műhold nélkül nem találnak vissza a járművükhöz és a nagy túlerővel már nem sokáig bírnak. A Skorpió csapatnak az a feladata, hogy helyreállítsák a kapcsolatot a műholddal.

Walter még mindig szélesítené társadalmi kapcsolatait, így rapidrandira meg Cabe és Toby kíséretében, ám nagy sikert nem aratnak, mindössze Toby szed össze egy kis vírust egy náthás pincértől.

Ma Sylvester rég nem látott apja, Ken, a nyugdíjas ezredes (Jeff Fahey) keresi meg őket, aki szakértőként dolgozik a hadseregnél. Jöttének oka, hogy kiderült, a legendának hitt Napfegyver létezik, és egy észak-afrikai diktátor megtalálta azt az országukban hagyott második világháborús német bunkerben. A fegyver tulajdonképpen egy fémnátrium panelekből álló speciális napelem, mely a napsugarakat egyetlen sugárban gyűjti össze és műholddal összekapcsolva a Föld bármilyen pontját elérheti. A csapatnak még azelőtt meg kell találnia, hogy a diktátor valakivel felújíttatná és tökéletesítené azt.

Sylvester egy televíziós vetélkedőn akar pénzt szerezni ahhoz, hogy Meganról neveztethesse el a kórház új gyermekgyógyászati szárnyát, ezért felkészül a bemutatkozásra.

A csapat új megbízása egyenesen a NASA-tól jön, még fellövés előtt meg kell találniuk a hibaérzékelő által jelzett lehetséges rendszerhibát egy titkos rakétában 3 órán belül. Walter rakétaépítésben meglevő ismereteire van szükség, ezért is keresték meg a csapatot.

Walter a garázsból vizsgálja a rendszert, míg a lehetséges hardverhibák felderítésére Sylvester, Happy és Cabe a NASA-hoz mennek. A garázsba váratlan vendégként Linda, a rapidrandi szervezője érkezik, akit előző este Walter elhívott egy vacsorára. A lány mellkasára egy bomba van erősítve, a kezében pedig egy pendrive van, melyen Waltert arra utasítja egy ismeretlen, hogy szabotálja a rakéta kilövését, különben Linda meghal.

Toby és Walter konfliktuskezelési terápiára ítéltetnek, mert a csapat már nem bírja elviselni a marakodásukat. Az első alkalmat töltik a furcsa dr. Rizzuto-nál, amikor földrengés rázza meg a várost, és az infrastruktúra is megsérül.

Ralph kajakozni szeretne, de Paige csak Sylvesterrel engedi el, így ők éppen a part felé tartanak, amikor a földrengés eléri őket.

Sylvester a csapat lelkes szurkolása mellett részt vesz a The Price is Right vetélkedőn és megnyeri a 100 ezer dolláros fődíjat, így nagy lépést tesz arra, hogy a kórház új szárnyának Megan Dodd legyen a neve.

A garázsba Cabe régi barátja Mick Doherty (Eric Roberts) tér be, kérve a segítségüket csempészbanda megállításában, akik egy közép-amerikai országba, Balio-ba akarnak vinni egy speciális biológiai fegyvert, melyet az országban regnáló diktatúra az őslakosok ellen akar felhasználni. A csempészéshez egy jármű importőr/exportőr céget vesznek igénybe, ezért oda kell először elmenniük.

A csapat saját olimpiát rendez a garázsban, és Walterről kiderül, hogy egyáltalán nem tud célba dobni. Fensőbbségében sértve autóba ül, de egy kisebb balesetet szenved és kórházba kerül, ahol először egy ügyvéd környékezi meg, majd egy kislánnyal, Oliviával találkozik, aki szívátültetésre vár.

Amikor a csapat Walterért aggódva megérkezik, Toby észreveszi, hogy a műtőből éppen kikerülő páciens a Nibori vírus tüneteit mutatja, ami csak a Távol-Keleten található meg. A vírus forrását keresve felfedezik, hogy a Los angeles-i vérbank bárkódgeneráló rendszerét ismeretlenek feltörték és így a zacskókra átkódolt jelölések kerültek, melynek következtében a felhasználható vér közé vírussal fertőzött vércsomagok keveredtek. A fertőzött vér kiszűréséhez meg kell találni az eredeti kódokat, ám ehhez rá kell jönni az átkódolás logikájára, ám addig leállítanak valamennyi műtétet.

Sylvester ma találkozik új ügyvédjével, aki furcsább, mint gondolta. Cabe pedig magával hozza új gyakornokát, Tim Armstrongot, aki a hadseregtől került a Nemzetbiztonsághoz.

A mai megbízást Cabe az FBI-tól hozza, akik arra kérik fel a csapatot, hogy működjenek közre egy terroristákat lehallgató rendszer telepítésében az USA Dzsibutiban levő helyi katonai bázisán. Ám ez csak egy fedőtörténet annak érdekében, hogy Cabe és Tim megtaláljanak egy, a makuriai határnál levő kereskedőt, aki antik tárgyakat rabolt el a Közel-Keleti Múzeumból és az eladásukból származó pénzt terroristák kiképzésére, hamis papírok és fejlett robbanószerek vásárlására fordítja. Az akció mentőakcióvá alakul át, amikor Cabe-et elfogják, és vallatni kezdik. Tim és Paige régiségvásárló házaspárnak adja ki magát, így terelve el a kereskedő figyelmét, miközben Toby és Walter Cabe-et próbálják megtalálni. Sylvester és Happy elkészítik egy értékes tál másolatát.

Walter nem áll ki Tim ellen a játékgépen, ezért Tim új rekordot tud felállítani. Linda megjelenik a garázsban, ami nem nagyon tetszik Paige-nek, ráadásul Ralpnak is problémája akad az iskolában, mert az egyik tanára ellopta a hanghullámszoftverét és emiatt a kisfiú most bíróságra akar menni..

A csapat mai munkája Vietnamba szólítja őket, ahol egy gyár építése előtti talajrendezés során a földből előkerül egy 1971-ben eltűnt tengerészgyalogos töltényöve. Fia, John Pandova (Josh Randall) felbéreli a Skorpió csapatot, hogy képalkotó technológia és egy földradar alkalmazásával derítsék fel, tényleg ott vannak-e az édesapja maradványai. Két napjuk van a munkára, de egy rendkívül erős tornádó közeledte ezt mindössze két órára csökkenti. Toby és Happy megtalálják a katona azonosító láncát, amit átadnak a fiának. A tornádó azonban megérkezik, és Walter szárazjéggel el akarja téríteni azt, ám közben ő és Paige közben az útjába kerülnek.

Walter egy hete jár Lindával és most a Botanikus Kertben a titánbuzogányt tekintik meg, bár Linda nem tudja sokáig elviselni a virág kellemetlen szagát.

Ralph beperelte a tanárát szoftverének ellopása miatt és a csapat természetesen ott van a tárgyalóteremben. A bírósági tárgyalás előtt Toby felvilágosítja Waltert, hogy Linda miért van vele valójában és Walter megérti, hogy mit kockáztat ezzel a kapcsolattal.

Visszatérve a garázsba, Ralphnak támad egy ötlete a bíróság által előírt bizonyítékok összegyűjtésére, amivel sokkolja Waltert, aki durván válaszol rá és megbántja a kisfiút.

Happy segíteni próbál Walternak Paige visszaszerzésében, ezért neki ad két belépőjegyet a tahoe-i jazzfesztiválra, hogy vigye el Paige-et. Toby ma részt vesz Mark Collins kompetenciatárgyalásán, melynek célja, hogy megállapítsák kiengedhetik-e a zárt intézetből.

A csapat többi tagja messzire utazik, mert Csernobilban van rájuk szükség, ahol az egykori atomerőmű eltemetett reaktormagja a régi, romló szarkofágon keresztül destabilizálja az új, javított betonszarkofágot. A Globális Energia Tanács részéről Okszana Nasztrova (Kathleen Munroe) kíséri őket a helyszínre...

Előző este Mark elrabolta Tobyt és most fogva tartja egy elhagyatott raktárban, hogy vele zsarolja Waltert.

A csapat keresni kezdi őt, de csak az autót és elhagyott telefonját találják meg. A garázsba visszatérve éri el Waltert Mark hívása, aki azt akarja, hogy Walter adja át neki az agy és agy között kiépített kapcsolatról (BBI) szóló kutatását, mellyel Collins képes lesz egy olyan technológia kifejlesztésére, amely az emberi gondolat olvasását teszi lehetővé.A csapat keresni kezdi a búvóhelyét, ahol eközben Collins fogselyemből labirintusszerű pókhálót készít Toby köré, melynek végén egy savval teli palack lóg egyenesen Toby fejére irányítva. A búvóhelyet amatőr rádiófrekvenciák megfigyelésével megtalálják, és míg Walter üldözőbe veszi Markot, a többiek azon gondolkodnak, hogyan szabadítsák ki a kelepcéből Tobyt...