Cabe Gallo, a Nemzetbiztonsági Szolgálat ügynöke felkeresi egykori pártfogoltját, Waltert O’Brient, hogy zsenicsapatával segítsen megoldani egy hibás programfrissítésből adódó problémát a Los-angelesi repülőtér földi irányítórendszerében. A csapathoz csatlakozik Paige a pincérnő, akinek van egy zseni gyermeke. A csapat sikeresen megoldja a problémát, ezért Gallo ügynök folyamatos együttműködést ajánl fel nekik, amit Walter elfogad. Walter felkéri Paige- et, hogy csatlakozzon hozzájuk, ők pedig segíteni tudnak zseni kisfia nevelésében.

Ma Kalifornia kormányzója kéri a Skorpió csapat segítségét, mivel kislánya vírustámadás áldozata lett és mindössze 24 óra áll rendelkezésre, hogy megmentsék. A küldetés szíven üti Waltert, mert a betegágyban fekvő kislány szklerózis multiplexben szenvedő nővérére emlékezteti, akinek romló állapotáról éppen ma reggel kapott levelet. Cabe-ben fájdalmas sebeket tép fel nemcsak az áldozat, de az elfogott tettes története is. Ralph lógási kísérlete kudarcba fullad és minden mesterkedése ellenére az iskolában kell töltenie a napot. Sylvester egyik legrosszabb rémálmával néz ma farkasszemet, amikor egy veszélyes vírusokkal teli raktárba kell bemennie. Toby végre eléri exmenyasszonyát, aki végleg elbúcsúzik tőle, Happy pedig ennek kapcsán felidézi mennyi ember hagyta őt el eddig.

Walter elbízza magát eddigi sikereiktől és Cabe minden tiltakozása ellenére elvállalja egy kaszinó magánmegbízását Las Vegasban, ahol meg kell találniuk annak az okát, hogy az egyik asztalnál miért kevesebb a bevétel, mint a többinél. A munkát elvégzik, és Walter megenged a csapatnak egy kis lazítást, de még mielőtt játszhatnának egyet, Walter észrevesz egy készülő rablást, melynek kitervelésével a helyi rendőrség végül őt vádolja meg, és ezért börtönbe kerül.

Walter távollétében Paige fogja össze a csapatot, akik a hely szelleméhez méltóan szerencsejátékkal próbálják összegyűjteni a pénzt az óvadékra. Walter a börtönben ismerőssel találkozik, míg a többiek a kaszinó környékén kutakodnak a rablók után, és mivel bajba kerülnek, így végül mégis Cabe segítségét kell kérniük.

Egy Los Angeles közelében levő használaton kívül atomreaktor rendszerének összeomlása nukleáris katasztrófával fenyeget. A csapatot egykori tagjuk, Mark Collins hívatja oda a katonákkal, és Walter kénytelen bevonni őt is a probléma megoldásába. Walter Markkal egykor több héten keresztül annyira elmerült a gondolkodásban, hogy teljesen kizárták magukat a világból és végül Happy mentette meg őt a fizikai összeomlástól. A mentálisan egyre rosszabb állapotban levő Markot, Walter egy zárt intézménybe vitette néhány évvel ezelőtt, ennek a lépésnek a helyességét azonban azóta is megkérdőjelezi magában. A csapat fél, hogy mindnyájukat veszélybe sodorja Mark megjelenése, ezért bizalmatlanok vele szemben. A rendszerhiba miatt Cabe csapdába kerül és nagyon kis esélye van a megmenekülésre, ezért elköszön Waltertől. A nap végén kiderül, hogy Mark igazából vissza akart kerülni a csapatba, azért hívatta őket a reaktorhoz.

A csapatnak pszichológiai alkalmassági vizsgálaton kell részt vennie, miután az előző akciójuk végén megsemmisült egy 100 millió dollárra becsült festmény és a vizsgálat eredményétől függ, hogy kapnak-e további megbízást a Nemzetbiztonsági Szolgálattól. A csapattagok és a pszichológusnő közötti beszélgetésekből áll össze a kép az akcióról, mely azzal indul, hogy egy művészeti múzeum felkéri a csapatot biztonsági rendszerük felülvizsgálatára egy nagyértékű festmény kiállítása miatt...

Amikor Ralph rég nem látott édesapjának, Drew-nak a telefonhívása befut a Skorpió irodájába mindenkiben ismerős emlékek törnek el. Walter aggódni kezd a kisfiúért, mert nem akarja, hogy úgy csalódjon az apjában, ahogy ő az apjaként szeretett Cabe-ben a bagdadi bombázás miatt. Drew másodosztályú baseball játékos, aki után Toby és Walter - Paige kérése ellenére - nyomozni kezdenek, és ez feszültséget okoz a mai munkában. A csapat aktuális feladata három szökött elítélt, köztük egy hozzájuk hasonló zseni felkutatása és annak felderítése, hogy mire készülnek. Walter elszántan üldözi a "közülük valót", aki képességeit nem a jó szolgálatába állítja, mint ők. Cabe érdes hangja és egy chipszes zacskó ma segít a bűnözők beszélgetésének a megfejtésében.Toby megkeresi Happy apjának az adatait, de a lány nem örül ennek és ledarálja az aktát. Paige egy egész napi vívódás és Happy meghallgatása után elhatározásra jut Drew és Ralph találkozásáról.

Walter a Drew miatt felhalmozódott feszültséget utcai autóversenyzéssel próbálja oldani, a legutóbbi verseny elvesztése miatt most egy bűnöző üldözi az üzeneteivel. A csapatnak Cabe ma rendőrségi megbízást hoz, miután meggyilkolnak egy zeneipari bloggert, akinek tehetséges zenész barátja (Scott Mescudi) létrehozott egy olyan algoritmust, amely tökéletes popslágert képes megalkotni emberi közreműködés nélkül. A rendőrség a helyszínen felrajzolt matematikai képlet miatt kéri a Skorpió csapat segítségét. A csapat nyomozni kezd a zenei producerek között, miközben Drew Ralph-fal baseball meccsre megy, és mivel nem igazán találja vele a közös hangot, Walter tanácsot ad neki. Toby szorult helyzetbe kerül egy erkélyen, a csapat új munkaeszköze pedig az akció áldozata lesz.

Drew baseballjátéka Walter tanácsának köszönhetően annyira feljavult, hogy lehetőséget kapott egy elsőosztályú baseballcsapatba szerződni Portlandbe. Bizalmasan elárulja Walternek, hogy megpróbálja Paiget-et és Ralph-ot is elvinni magával, ettől Walter rosszkedvű lesz. Feszültségoldásként Cabe elhívja őt reggelizni, ám közben utoléri őket Cabe volt feleségének, Rebeccának (Jessica Tuck) egyezményes jelzése arról, hogy bajban van. Rebecca ügyvédként politikai gyilkosság nyomára bukkant egy pénzátutalás kapcsán, mely egy nagy vállalatcsoporthoz és egy új választáshoz kapcsolódik. Cabe és Walter a gyanús céghez mennek, Happy pedig Cabe jelvényével ügynöknek adja ki magát. Walter szokásos vakmerősége és egy felmosófelszerelés is szükséges a bizonyítékot jelentő adathordozó megszerzéséhez, ám ezzel magukra vonják ellenfeleik figyelmét, akik feldúlják a raktárt...

Walter bemutatja Megant a csapatnak, akik eddig még nem találkoztak a nővérével. A mai megbízás középpontjában egy F-120 Hawking repülőgép van, mely fedélzetén egy speciális álcázó radarral, lezuhant Bosznia felett. A katonák tapasztalata mellett a csapat tudására is szükség van ahhoz, hogy megtalálják a lezuhant gépet és visszahozzák az értékes lopakodó-rendszert. A küldetés részét képezi a gépen elhunyt pilóta holttestének a hazaszállítása is, szomorú felesége megkéri őket, hogy hozzák el a férfi azonosító-nyakláncát és tegyék a zsebébe a családja fényképét. A csapat háborús körülmények közt végzi a munkáját, miközben Sylvester Meganról gondoskodik a garázsban. A két hosszú nap alatt Walter ismét hajmeresztő dolgokat művel egy aknamezőn, Cabe autót indít be toalettpapír segítségével, Toby és Happy pedig egy helyivel kötnek ismeretséget...

A csapat egy nemzetközi nyomozás részesévé válik, amikor a „Ghosts” nevű kegyetlen rablóbanda üldözésébe vonják be őket. Sylvester súlyosan megsebesül a banda által hátrahagyott robbanószerkezetet vizsgálva, ezért kórházba kerül. Walter nagyon aggódik a barátjáért és emiatt még elszántabban akarja elkapni a bűnözőket. Az Interpol ügynöknőjének, Simone-nak (Karolina Wydra ) kapóra jön Walter fanatizmusa, mert a kollégája tragédiája miatt hasonlóan érez, és mindenáron igazságot akar szolgáltatni neki. Walternek lelkiismeretfurdalása van pillanatnyi tétovázása miatt és még Sylvester sem tudja megnyugtatni. Az akció után Simone meghívja egy italra Waltert, Paige pedig vacsorázni megy Drew-val. Megan Sylvester betegágyánál tölti a napot, este azonban a csapat is vele van, és képregényeket olvasva őrzik barátjuk álmát.

Drew próbajátékon van Portlandben, így ezt a karácsonyt sem tölti Ralph-fal. Paige a karácsony szellemét akarja behozni a garázsba, amely a csapat történeteit megismerve nem könnyű vállalkozás. Walter a tengerparton üldögél Megannel és megpróbálja rábeszélni egy újabb kezelésre, amikor földcsuszamlás miatt egy kisfiú a part közelében levő víznyelőben reked, beszorulva egy nagyobb szikladarab alá. A dagály közeledte miatt mielőbb ki kell szabadítani onnan, ezért Walter riasztja a csapatot. Sylvester hibát követ el a mentés során és emiatt el akarja hagyni őket, Megan próbálja visszatartani őt. Walter megígéri a kisfiúnak, hogy kimenti őt és ezt mindenáron be akarja tartani, emiatt vállalja az életveszélyt is. Az akció után Walter nem akar Grincs lenni, így ő bármit is gondol, ma meghagyja az emberek hitét a csodákban. Happy rászánja magát, hogy felfedje kilétét az édesapja előtt, ezért elmegy hozzá. Este új lakó érkezik a garázsba: a karácsony szelleme.

Megérkezik Walter rakétája a garázsba, mellyel egy 15 millió dolláros díjat akar megnyerni Megan betegségének kutatására. Ralphot az iskola előtt letartóztatják, mert akaratlanul is törvénytelenséget követett el, azzal, hogy a dark weben keresztül egy olyan számítógépes játékba keveredett, amelynek egy titkos szintjére eljutva, fedett CIA-ügynökök búvóhelyére vezetett el külföldi terroristákat. A kisfiú most hasonló helyzetbe keveredik, mint Walter egykoron, aki ráadásul felelős a kisfiú bajbajutásáért, hiszen ő mutatta meg neki a világháló sötét oldalát. Ahogy annak idején Cabe megmentette őt, most neki kell ugyanezt tenni Ralph-fal, Cabe és a csapat pedig segítenek neki ebben. Drew és Walter egymásnak feszülnek, de Paige rendet tesz közöttük, Ralph pedig segít Walternek megoldani az ügyet.

Paige Walterrel kapcsolatos érzéseivel szembesül, amikor reggel fura álomképek ugrasztják ki az ágyából. Cabe új ügyet hoz, a CIA Belső Ügyosztályától, akik elfogták az egyik munkatársuk kódolt levelét, de nem boldogulnak annak megfejtésével, így azt sem tudják, ki küldhette azt. A Skorpió csapat felfedi az áruló kilétét, aki úgy gondolva, humanitárius célokra fogják felhasználni, vegyi fegyverek előállítására alkalmas vegyszereket csempészett ki a magát jemeni segélymunkásnak kiadó szerelmének. Walternek találkoznia kell a nővel egy bárban, ehhez flörtölési leckét vesz Paige-től. Tobyt megkörnyékezi egy CIA-ügynöknő, akinek hasznos ajándékait nem ő, hanem Happy és Cabe próbálják ki magukon. Paige a fülhallgatón keresztül ad instrukciókat Walternek, aki végül akciófilmbe illő módon fejezi be az ügyet, és később ismét arról elmélkedik, hogy az embereket milyen veszélybe sodorhatják az érzelmeik.

Drew ma előhozakodik a portlandi költözés ötletével, Paige pedig bizonytalan magában, ezért Walter véleményét kéri. Közben a távoli Izlandon egy hacker betör az USA helyi nukleáris rakétaindító rendszerébe, és megpróbál elindítani egy rakétát, ezért a Skorpió csapat közreműködését kéri a Nemzetbiztonság. A megoldáshoz szükségük van egy volt ügynök segítségére, aki az amerikai elnököt védve sérült meg 16 évvel ezelőtt. Akkor tűnt el a rakétairányító rendszer indításához szükséges „labda” nevű táska, ezt kell megkeresniük ahhoz, hogy megakadályozzák a nukleáris támadásokat az USA szövetségesei ellen. A férfi egy kórházban van, és korábbi sérülése miatt súlyos emlékezetkiesésben szenved. A csapat párhuzamosan próbálja megkeresni az irányítórendszert feltörő hackert és visszahozni az ügynök emlékezetét. A nap végén Paige megkapja Walter végleges válaszát a költözés ötletére.

Walter „üzleti vacsorát” tervez Paige-dzsel másnapra, amely véletlenül éppen Valentin napra esik. A mai megbízás miatt azonban egy luxus tengerjáróra kell menniük, ahol ellopott vállról indítható rakétákat kell megkeresniük és átkódolni őket, hogy elkaphassák a fegyvercsempészeket a fegyverek átadásakor. A társaság ismét mások bőrébe bújik: Sylvester ifjú milliomost, Paige a feleségét, Walter az inasukat, Cabe pedig a személyi edzőjüket alakakítja. Walter a hajón összefut volt barátnőjével, akinek szavai elgondolkodtatják a tervezett vacsorát illetően. Toby Happyvel ezalatt Ralphra vigyáz és segítenek a kisfiúnak megnyerni szíve hölgyét. Este kiderül, hogy Sylvester a képeslap mellé más ajándékot is adhat Megannek Valentin napra.

Walter interjút ad az egyik helyi televízió állomásnak, azzal a szándékkal, hogy felhívja a figyelmet a csapat munkájára és így több megbízásuk legyen. A riportban pontatlan információk hangzanak el a csapat tagjairól, ráadásul úgy tűnik, mintha egyedül Walter érdeme lenne minden sikerük, emiatt a többiek alaposan megsértődnek. Cabe ebbe a fagyos hangulatba csöppen bele a milliárdos tech-guruval, Richard Elia-val, aki megbízza a csapatot, hogy mentsék ki a lányát egy mexikói drogkartell fogságából. Toby tiltakozása ellenére Walter elvállalja a munkát, és Elia magángépén Mexikóba mennek. Sylvester végre közli Walterrel, hogy együtt jár Megannal, aki először nem örül a hírnek. A kartell csapdába csalja őket, és Cabe minden mesterlövész készségére, de még egy láda narancsra is szükség van ahhoz, hogy mindannyian ép bőrrel kimeneküljenek. Happy egy új barátot szerez, és emiatt Cabe elbúcsúzhat értékes karórájától. Hazaérkezésük után Elia állásajánlatot tesz Walternek.

Paige esti iskolába jár, hogy befejezze elkezdett tanulmányait és jó példát mutasson Ralphnak. Egy beadandó dolgozatot összekapcsolt a mára rendelt munkával, így felkészülten megy a mai helyszínre, ahol a belorusz, litván és lett határkonflktusok miatt szervezett titkos tanácskozáson kell a csapatnak részt vennie. A tárgyalások egy merénylet miatt elfajulnak és a harmadik világháború kitörése fenyeget, ha nem találnak ellenanyagot a megmérgezett politikusnak, illetve nem kutatják fel a merénylőket. Merrick és Cabe között éles szóváltás zajlik le, miközben a csapat két részre osztva próbálja megoldani a feszült helyzetet. Walter vakmerő akcióba kezd, melyben Happy és Paige mellett egy új segítője akad egy kis vadászgörény személyében. Cabe John Wayne-rajongása ma hasznosnak bizonyul, bár az ellenség nem lovon érkezik. Happy váratlan dolgot tesz, amivel igazán meglepi a mit sem sejtő Tobyt.

Toby táblára rajzolt matematikai ábrákkal vezeti le, hogy mit gondol Walter Paige iránt érzett érzelmeiről. Walter nem ért vele egyet, de megjelenik Cabe és indulniuk kell egy csapat eltévedt fiatal felkutatására. A kereséshez Walter egykor Bagdadban használt szoftverét használják, ezzel Cabe és Walter ismét a régi ügy árnyékában magukat. A csapat a helyszínre helikopterrel akar eljutni, de az lezuhan velük és a pilóta megsérül. A rádióból kipattanó szikra miatt erdőtűz keletkezik, így a csapatnak már nemcsak a leszálló sötétséggel kell harcolnia, hanem az egyre jobban terjedő tűzzel is. A sebesült katona mentése közben előtörnek Sylvester apjával kapcsolatos emlékei, aki sosem tartotta őt sokra. Cabe egy katonai helikopterrel megy értük, ám végül egy gyémántgyűrű árán találja meg a csapatot és a fiatalokat. Toby este újabb fogadást köt Happyvel, Walter pedig megmutatja Toby diagramját Cabe-nek.

Toby nagy bajban van, mert nem ment el az esti randevúra, Happy pedig emiatt rendkívül dühös és kiengesztelhetetlen. Walter arra kéri Tobyt, felejtse el a munkahelyi kapcsolatot, de ő jó ellenérvként megmutatja az előző heti diagramjából megmaradt rajzot. Ma a csapat egy koronatanú védelmében vesz részt, aki egy veszélyes dél-amerikai szindikátus vezetőjének a tárgyalásán fog tanúskodni, de ehhez két országon keresztül kell átvinniük, miközben a bűnözők a nyomukban vannak. Útközben kiderül, hogy ő is egy nehéz természetű zseni, aki ráadásul gyermeket vár. Happy bebizonyítja, hogy egy papírtörlőből is fegyvert lehet készíteni, Walter és Cabe pedig veszélyes behajtóként szerez járművet maguknak. Walter némi biztatást kap Paige egy elejtett mondatából és Toby is a lelkére beszél a garázsban, ezért nagy levegőt vesz és elindul megvallani az érzéseit Paige-nek.

Egy idegmérgeket tároló laboratórium rendszerét feltöri egy ott dolgozó munkatárs, aki bosszút akar állni elhunyt menyasszonya miatt. Szarin gázt enged az épület szellőzőrendszerébe, melynek elterjedésével az egész város veszélybe kerülhet. A helyszínen kiderül, hogy a féri menyasszonya a bagdadi bombázás következtében halt meg, ezért Walter feszültté válik személyes érintettsége miatt. A férfi bosszút akar állni és nyilvánosságot követel, ezért napvilágot lát a régi ügy valamennyi dokumentuma, mely miatt Cabe bevallja a teljes igazságot Walternek. A vallomás alátámasztja Walter akkori haragjának jogosságát, a merénylővel szembekerülve pedig nyilvánosan is kijelenti, hogy magát tartja felelősnek az a bagdadi áldozatok haláláért. Ralph megszökik az iskolából, mert segíteni akar a csapatnak a város megmentésében, de bajba kerül...

A megmaradt csapattagok aggódnak bizonytalanná vált jövőjük miatt, mert nem bíznak abban, hogy Cabe és Paige nélkül is boldogulnak majd, Cabe pedig Merrick kezébe nyomja a jelvényét és felmond a Nemzetbiztonságnál. Mivel Walter nem jelenik meg a garázsban, Toby, Happy és Sylvester keresni kezdik őt, és megtalálják az összetört autót egy szikla peremén egyensúlyozva. A csapat egyik legfontosabb küldetése kezdődik most, mert meg kell menteniük Waltert, aki maga sem lát túl sok esélyt a megmenekülésre, ezért kedves emlékeket idéz fel a többiekkel kapcsolatban, hogy utoljára így fejezze ki a szeretetét irántuk. Cabe-et is odahívják, és ők ketten végre tisztázzák a múltat...