El detective Gordon cree que Jonathan Crane ha vuelto. El Pingüino organiza una fiesta para celebrar la apertura de su nuevo local. Bruce comienza a patrullar las calles para mantenerlas seguras.

Gordon persigue a Jonathan Crane para demostrar que el Departamento de Policía de Gotham todavía es poderoso y eficaz en la lucha contra el crimen. Selina y Tabitha sopesan los riesgos que implica unirse a Barbara en el negocio de las armas.

Gordon viaja a Miami para convencer a Carmine Falcone de que le ayude a luchar contra el Pingüino; cuando regresa, Sofia, la hija de Carmine, lo sigue a Gotham. El Pingüino se fija en Bruce durante una subasta en el Iceberg Lounge.

Bruce pone varias vidas en riesgo para ocultar cuál es el verdadero valor del cuchillo de la subasta. Ra's Al Ghul demuestra que su devoción no conoce límites. Sofia Falcone trata de arrebatarle el control de Gotham al Pingüino.

Gordon y Bullock están a la caza de un asesino serial que ha colocado a sus víctimas cabezas de cerdo; Sofía trata de vencer al Pingüino; Thompkins, Nygma y Grundy encuentran algo insólito.

Gordon y Bullock buscan pistas que los conduzcan hasta el profesor Pyg, quien está sembrando el terror en Gotham. Por otra parte, un antiguo compañero de clase convence a Bruce para salir con otros conocidos de su etapa escolar.

Grundy y Nygma se convierten en las principales atracciones del club de lucha de Cherry. El Pingüino desea vengarse de Nygma por haberlo humillado. A Gordon le ofrecen el puesto de capitán, lo que enoja a Bullock.

El profesor Pyg sigue atormentando a los habitantes de Gotham. Sofia y el Pingüino organizan un evento de recaudación de fondos para el orfanato. La amistad de Bruce y Alfred se enfría por la vida disoluta que lleva Bruce.

Gordon trata de llegar a un acuerdo con el Pingüino que involucra a Sofia. Mientras tanto, Alfred trata de sacar a Bruce de su espiral descendente de angustia adolescente, mientras Lee Thompkins gana más control sobre los Estrechos.

Las cosas se complican para Gordon, Sofia y el Pingüino cuando Carmine Falcone llega a la ciudad. Alfred trata de llegar a Bruce de una vez por todas, mientras que Nygma lucha para obtener el control sobre la personalidad del Acertijo y Tabitha intenta que Grundy recuerde su pasado. Mientras tanto, una sonrisa familiar resurge en Gotham.

Gordon es llamado a la escena después de que Toy Maker es contratado para asesinar a uno de los médicos de Gotham. Lee Thompkins comienza a tratar de reconstruir Estrechos, con Nygma como su compañero. Mientras tanto, la nueva vida de Alfred en los Estrechos se complica e Ivy le revela su nueva identidad a Selina.

Ivy rastrea un proyecto secreto en el que Wayne Enterprises está trabajando y comienza a seguir a cualquier persona involucrada que pueda darle información. Mientras tanto, Jerome se obsesiona con el Pingüino en Arkham. Además, Gordon comienza a replantearse su trato con Sofía y una inquietante secuencia de sueños sacude a Bruce.

Ivy escoge su próximo objetivo, guiando a Gordon y Lucius a un viejo amigo, mientras Selina intenta tomar cartas en el asunto. Sofia quiere el control total de Gotham y recurre a Lee para saber sobre el estado de los Estrechos. Mientras tanto, Bruce intenta hacer las paces con Alfred, y Nygma visita Arkham.

Bullock y Gordon intentan localizar a alguien que es clave en el control de Sofia sobre Gotham. Mientras tanto el Pingüino, Lee y Nygma alistan a un aliado inusual mientras buscan venganza, y Selina le pide a Bruce un favor que la ayudará a librarse de su culpa sobre Ivy.

Los "mejores" de Arkham le dan a Gordon y Bullock un plazo para su dinero mientras traman un plan para escapar del manicomio. Entretanto, Bruce diseña su propia estrategia para frustrar sus planes. Además, Barbara recibe una oferta que no podrá rechazar.

Gordon y Bullock intentan mantenerse un paso adelante cuando Jerome se concentra en su próximo objetivo. Mientras tanto, Nygma conduce un juego de acertijos en los Estrechos y encuentra en Lee Thompkins a su rival más difícil, y el Pingüino va a ver a Butch con una propuesta.

Los reclusos de Arkham todavía corren libremente en Gotham y cada vez son más difíciles de atrapar. Gordon elabora un plan, pero a regañadientes tiene que recurrir a la ayuda de Bruce. Mientras tanto, Barbara se da cuenta de hasta qué punto están dispuestos a llegar por ella sus nuevos amigos.

Gordon y Bullock intentan descubrir quién es el astuto ladrón detrás de los robos a varias sucursales bancarias en Gotham. Mientras tanto, Barbara es puesta en peligro, obligando a Tabitha a reclutar ayuda.

Estalla el caos en el DPCG, enviando a Gordon en una búsqueda inútil para capturar al culpable detrás de la enorme toma de poder. Mientras tanto, un amigo de Bruce se vuelve paranoico, lo que resulta en un comportamiento precipitado y destructivo.

Cuando Gotham cae en una anarquía total, un equipo de héroes inesperados surge para salvarla; Bullock toma el control del Departamento de Policía de Gotham City; los límites psicológicos de Bruce son puestos a prueba.

Jeremiah le dice a Gordon que habrá más destrucción en Gotham; Gordon debe tomar una difícil decisión; Barbara reúne a un equipo para asegurar su posición; Bruce debe tomar una decisión sobre su futuro.