Bruce finner ut mer om sin avdøde fars hemmeligheter, mens Gordon inngår et motvillig samarbeid med Oswald Cobblepot.

Gordon leder jakten på rømlingene fra Arkham som fortsatt befinner seg på frifot. I mellomtiden tyr Alfred til drastiske midler for å beskytte Bruce.

Alfred overtaler Bruce til å delta på et veldedighetsarrangement for et barnesykehus, men før kvelden er over har det hele tatt en overraskende og urovekkende vending.

En tragedie i avdelingen fører til forfremmelse for Gordon og en fornyet innsats i bekjempelsen av ondskap. Theo Galavan avslører sin plan for Gothams fremtid.

Gothams kriminalitet blusser opp når Penguin og Galavan allierer seg med en familie av brannstiftere. En gammel feide mellom familiene Galavan og Wayne får nytt liv.

En usikker Bridgit vurderer fremtiden sin. Penguin og Galavan fortsetter å kjempe om makten.

Penguin er fast bestemt på å få løslatt moren. Silver og Selina møtes for første gang og krangler om Bruce.

Etter at Barbara våkner opp fra et skremmende mareritt, kommer en maktsyk Galavan med et tilbud overfor Bruce, som er vanskelig å avslå.

Lee uttrykker bekymring over Gordons mørke sider. Edward hjelper en skadet Penguin tilbake til hektene, og søker samtidig hans råd.

Selina og Bruce fornyer samarbeidet. Samtidig forsterker Gordon innsatsen for å holde Galavan bak murene, der han hører hjemme.

Etter at Bruce blir bortført, søker Gordon hjelp hos en usannsynlig alliert for å stanse Galavans hevnplaner mot Wayne-familien.

En ny og skremmende skurk er kommet til Gotham, som fryser folk i hjel. Gordon forbereder seg til et viktig vitnesbyrd.

Alfred deler ny informasjon om mannen som drepte foreldrene til Bruce. Politiet forbereder seg på å flytte en ny fange til Arkham Asylum.

Gordon og Bullock etterforsker et innbrudd på museet mens Penguin møter gamle venner. Bruce tester nye ferdigheter.

Gordon får en smak av livet i fengsel, og Bullock kommer med tragiske nyheter. På en annen kant må Penguin hanskes med dysfunksjon i familien.

Mens en desperat Gordon forsøker å renvaske seg, finner Penguin ut den overraskende sannheten om farens død.

Barbara strekker ut en hånd til Gordon i et forsøk på å reparere forholdet deres. Bruce og Alfred leter etter en av Thomas Waynes gamle kollegaer.

Mens Gordon spør Professor Strange om arbeidet hans ved Pinewood Farms, forbereder en ny skurk seg på å angripe byen.

Azraels løfte om å drepe Gordon får Penguin til å komme ut av buskene. Men det tar ikke lang tid før Bruce er det nye målet.

Med støtte fra Gordon, Lucius og Alfred drar Bruce for å redde Selina. Men først må de finne det hemmelige laboratoriet til Professor Strange.

Gordon gjennomgår en medisinsk forvandling dypt inne i Professor Stranges laboratorium. Samtidig trues Gotham av en ny fare.