Para detektywów, James Gordon i doświadczony Harvey Bullock prowadzą dochodzenie w sprawie morderstwa zamożnych rodziców 12-letniego Bruce’a Wayne’a.

Gordon i Bullock chcą rozwikłać sprawę gangu handlarzy bezdomnymi dziećmi. Jedną z ich ofiar jest Selina. Tymczasem Pingwin wraca do Gotham.

Gordon i Bullock poszukują mściciela, który morduje skorumpowanych obywateli Gotham, przywiązując ich do balonów meteorologicznych.

Termin kontrowersyjnego głosowania radnych w sprawie dzielnicy Arkham za pasem, ale żaden polityk nie jest bezpieczny.

Gordon i Bullock tropią dilerów nowego narkotyku wywołującego euforię, a potem śmierć. Cobblepot stara się zinfiltrować świtę Maroniego.

Gdy morderca zabija pierworodne dzieci elity Gotham, w głowie Bullocka kłębią się traumatyczne wspomnienia z podobnej sprawy.

Motyw śmierci skatowanego mieszkańca Gotham intryguje detektywów. Bruce wraca do szkoły, ale nawiązywanie przyjaźni nie przychodzi mu łatwo.

Chcąc zamknąć sprawę Wayne’ów, Harvey Dent namawia Gordona, aby dołączył do burmistrza Jamesa. Pingwin kontaktuje się z Lizą, protegowaną Pani Fish.

Selina ze swoim nowym przyjacielem zmierzą się z mordercami podczas wypadu po Gotham. Gordon zostanie karnie przydzielony do innej sprawy.

Sprawa szpitala w Arkham nie idzie po myśli Gordona, ale morderstwo strażnika zmienia dynamikę i prowadzi prosto do dr Leslie Thompkins.

Gordon chce wrócić do starej sprawy. Pomogłoby mu w tym ujęcie Jacka Grubera, zbiega z Arkham z zamiłowaniem do elektryczności.

Po śmierci ważnego świadka w sprawie o zabójstwo Gordon podejrzewa zdradę w kręgu zaufanych osób. Szuka wskazówek u starego przyjaciela.

Fish ujawnia tajemnicę Oswalda Cobblepota, aby sprawdzić lojalność Maroniego. Gordon i Bullock ścigają mordercę chorych na fobie.

Gordon i Bullock chcą przyskrzynić nauczyciela biologii pobierającego narządy ofiar morderstw. Mooney prowadzi intrygi, aby przejąć władzę.

Gordon z dr Leslie Thompkins są w cyrku, gdy ten zostaje zaatakowany. Falcone wynajmuje Butcha Gilzeana, aby pomógł Pingwinowi z klubem nocnym.

Po serii napadów na banki Gordon i Bullock prowadzą dochodzenie w sprawie gangu Red Hood. Przyjaźń Seliny i Barbary kwitnie.

Gordon stara się rozwikłać kontrowersyjną sprawę komisarza Loeba. Lojalność Fish wobec więźniów zostanie poddana próbie.

Gordon i Bullock zajęli się nierozwiązaną sprawą seryjnego zabójcy młodych kobiet w Gotham. Fish planuje ucieczkę z niewoli u Lalkarza.

Gordon i Bullock badają sprawę Ogre’a, którego interesuje osoba bliska Gordonowi. Bruce i Selina obnażają korupcję pracownika Wayne Enterprises.

Ścigany przez Gordona i Bullocka Ogre doprowadza Barbarę do załamania nerwowego. Pingwin dokonuje masakry, która staje się zalążkiem okrutnej wojny.

U szczytu wojny gangów w Gotham Fish Mooney bierze się za łby z Maronim i Pingwinem. Stawką jest kontrola nad miastem.