Après une dispute avec Rebelle, Bulle s'isole dans la forêt. Elle découvre que l'endroit est enchanté et fait la connaissance d'un papillon qui lui donne une craie magique. Elle peut désormais créer le monde qu'elle veut avec ses dessins.

À l'école, lors d'une journée consacrée aux métiers, le professeur présente sa dernière invention aux élèves de la classe. Il s'agit d'un portail temporel. Mojo Jojo, qui passait par là, s'intéresse à l'exposé et convainc le professeur de régler le portail sur le jour où il s'est intéressé à la science.

Lui défie les Supers Nanas pour une série de neuf épreuves autrement le professeur paiera.

Les Supers Nanas ont une nouvelle voisine, Robin, avec laquelle elles s'entendent très bien. Malheureusement elles ont des obligations et doivent parfois délaisser leur amie. Princesse, qui a toujours voulu être une Super Nana, profite de la situation.

C'est le Sommet 2000, de l'Association Mondiale des Supers Héros. Les Supers Nanas réussissent avec brio les épreuves leur permettant d'intégrer la congrégation. Mais les participants s'opposent à cette admission.

Une pluie terrible s'abat sur Townsville, une pluie dont chaque goutte contient un nanobot : un robot miniature qui détruit tout sur son passage. Pour pouvoir vaincre les nanobots, les Supers Nanas doivent se réduire à leur taille

Les Supers Nanas sauvent un petit écureuil d'un aigle et le ramènent à la maison. Mais l'animal est très malade. Bulle décide de lui donner de l'agent chimique X pour le sauver, ce qui donne des supers pouvoirs à l'écureuil, rebaptisé Bravoure. Il combat auprès des Supers Nanas, mais vient un temps où il doit retourner à la forêt.

Une force extra-terrestre très puissante menace Townsville, forçant les Supers Nanas à demander de l'aide à Mojo Jojo. Quand tout semble perdu pour Townsville et ses habitants, Mojo Jojo perd la tête et détruit la force.

Dick, un ancien ami de fac du professeur est de passage à Townsville et lui rend visite. Il découvre les Supers Nanas et pense pouvoir en tirer un bénéfice financier. Dick les convainc de lui donner la formule de leur création ainsi que de l'agent chimique X. Puis il commercialise les « Supers Nanaz », des doubles bas de gamme.