Lorsque Dieu perd foi en l'humanité et disparaît, une légion d'anges en colère menée par Gabriel déclenche une guerre contre la race humaine. Les survivants se réfugient alors dans des villes fortifiées. L'archange Michael a choisi de prendre parti pour l'humanité contre son frère Gabriel et de vivre parmi les humains dans la forteresse de Vega, en plein désert. Pendant 25 ans, les hommes trouvent la force de se battre en s'accrochant à l'espoir de l'arrivée d'un enfant élevé pour les guider hors des ténèbres. Seulement personne ne sait qui est l'Elu. Pas même lui...

Alex essaye d’échapper à ses responsabilités en quittant Vega, mais Michael lui évoque le sacrifice de ses parents pour le protéger. Pour protéger la cité, le général Riesen prend des mesures drastiques.

Alex commence son entrainement avec Michael, mais il a une vision qui le pousse à se rebeller.

Alex demande à Michael et Claire de l’aider à libérer les Billes Noires des anges qui les possèdent. David Whele est proche de découvrir l’identité des Acolytes Noirs dirigé par son fils. Il planifie également un coup d’état grâce à une nouvelle alliance.

Quand des Anges Supérieurs sont découverts morts à Véga, Michael demande à Alex de l'aider à protéger les autres, mais Gabriel révèle un secret qui menace de les séparer. William, lui, tente de rééduquer son père. Par ailleurs, une vieille attirance renait entre Alex et Noma...

Alex et Michael sont en froid après la révélation de l'identité d'un des Anges Supérieurs. Après le mariage de Claire et William, Riesen quitte Véga, conformément au voeu de sa fille. Arika accueille une délégation d'Héléna avec une cargaison inattendue...

Quand Dieu perd foi en l’Humanité et disparaît, une légion d’anges en colère menée par l’archange Gabriel déclenche une guerre contre la race humaine. Les Hommes s’accrochent à l’espoir de l’arrivé d’un Elu. Seulement personne ne sait qui il est...