Etter å ha funnet ut at dette årets Unova-liga vil finne sted i Vertress City, klarer Ash nesten ikke å vente! Heltene våre tar farvel med Cynthia og Jervis og av sted de drar. De planlegger å gjøre et stopp i Dragelandsbyen på veien, slik at Iris kan få besøke sin hjemby.

Under en lunsjpause har Iris og Emolga et ubehagelig møte med en gruppe bestående av tre velkledde og nesevise jenter, som kaster rundt seg med fornærmelser om deres utseende, for deretter å dra av sted leende. Iris er rasende på grunn av deres arroganse, og drar inn til byen for å finne ut hvem de onde jentene er og hvor hun kan finne dem. Det viser seg at de tre er med i Blomsterhagegruppe, bestående av kvinnelige aktører og deres Pokémon. Det betyr at ingen menn har adgang til deres hovedkvarter—og ingen mannlige Pokémon, heller!

Men Iris er fast bestemt på å komme seg inn ditt og hevne seg, og hun klarer å overtale Ash og Cilan til å bli med henne, selv om det betyr at alle må kless seg ut i kjoler, smykker og sminke. Pansage må ha på seg en rosa sløyfe – og til og med Pikachus hale får en forkledning!

Straks de er innenfor spør våre helter i forkledning om de kan få se på når gruppen øver, og lederen Moira sier det er greit. Hun tlbyr dem noen tips om stil og holdning, og så presenterer hun dem for en rekke med utfordringer. Først blir våre helters Pokémon nødt til å gå over en bom for å demonstrere hvor grasiøse de er. Når det viser seg å være altfor enkelt, blir innsatsen hevet; det er en kamp oppe på bommen, og denne gangen er det en gjørmedam under den! Til slutt er det klart for Skjønnhetskamparenaen, hvor Iris endelig får sin hevn, når hun beseirer Moira og en av hennes tjenere og dunker dem ned i gjørmen. En vakker seier!

Når heltene våre nå nærmer seg Vertress City, stedet for dem kommende Unova-ligaen, legger de merke til en Drilbur og en Braviary som ser ut til å overvåke dem. Deres trenere—brødrene Rocko og Soren—dukker raskt opp og utfordrer Ash til en Tag-kamp! Ash tar med glede imot utfordringen, og bestemmer seg for å gå I tospann med Cilan for et lignende land-og-luft team med Pansage og Unfezant.

Det første trekket til de to brødrene er Drill Wing, som ingen av heltene våre har hørt om før! Det viser seg at Soren og Rocko er dyktige til å bruke dobbelt-trekk angrep—I dette tilfellet, blir Drilburs Drill Run kombinert med Braviarys Wing Attack. Det tar ikke lang tid før Ash og Cilan har lært seg denne teknikken, og med et imponerende samarbeid, beseirer de brødrene…som umiddelbart begynner å skylde på hverandre.

Cilan griper inn og skiller dem, og bruker sine ferdigheter som Pokémon-kjenner for å gi dem noen råd: begge brødrene funger bra I lag med sin egen Pokémon, men de trenger en Vann-type for å komplettere deres land-og-luft team. Og selvsagt, siden han også er en Fiske-kjenner, gir ham dem gladelig none leksjoner i hvordan man fanger en. De får først to sprelske Frillish på kroken, men de blir ikke enige om en strategi for å hale dem inn, så de to Frillish slipper unna. Når Soren og Rocko roer seg ned og begynner å jobbe sammen, klarer de å fange en Buizel og en Corphish for å komplettere deres team. Nå kan de skryte over å være herskere på land, i luften og til vanns!

Våre helter tar farvel med brødrene med løfter om en Tag-kamp omkamp hvis de møtes igjen, og reisen til Unova-ligaen fortsetter!

Når heltene våre ankommer Iris sin hjembye, Dragelandsbyen, møter de på Iris sin barndomsvenn Shannon og de to Zweilous hun har alet opp. Iris avtaler å møte Shannon senere og fortelle venninnen hennes alt om hennes reise, men først må hun besøke den Vise.

Den Vise gir Iris en varm velkomst, og etter en rask undersøkelse, erklærer hun at Iris har tatt godt vare på Axew. Noen av de andre landsbybeboerne ønsker å se resten av Iris sine Pokémon, og Iris kaller på Dragonite . Alle er forbauset over denne imponerende fangsten—I det minste inntil Dragonite havner i en krangel med en Haxorus i nærheten! Men utrolig nok får et par beroligende ord fra den vise dem til å roe seg ned. Så bærer det av sted til Shannons hus for å spise lunsj, hvor Iris foreslår at hun blir med heltene våre på deres reise! Shannon sier at hun har planlagt å starte på en reise etter at begge hennes Zweilous har utviklet seg, men hun er ikke sikker på at hun har et talent for dett. Hun har planer om å bli en Pokémon Avler, og tror at hun at det er best for henne og bli hjemme og arbeide med det målet.

Når heltene våre prøver å overbevise henne om at en reise vil bli en fantastisk mulighet, hører de et desperat skrik fra en av hennes Zweilous utenfor. De skynder seg dit for å undersøke, og oppdager at den eldste Zweilous holder på å utvikle seg til Hydreigon! Det er et spennende øyeblikk—men det blir raskt ødelagt når det viser seg at Hydreigons plutselige utvikling har fått den til å reagere med panikk og forvirring. Den går helt berserk, og angriper alt i nærheten! Iris husker hvordan den Vise roet ned hennes Dragonite, og bestemmer seg for å handle.

Mev hjelep av alle hennes Pokémon, klarer hun å jage Hydreigon inn i et hjørne hvor hun kan nærme seg den. Det er en vanskelig oppgave, men Iris gir seg ikke, og hun snakker rolig og oppmuntrende til Hydreigon. Og hennes tålmodigheten svarer seg, for hun lykkes og Hydreigon roer seg ned, til alles store forundring!

Landsbyens vise, som har stått og sett på, kommer for å gratulere Iris med hennes triumf—og det samme gjør også Gym-leder Drayden, Iris sin gamle lærer! Hun har prøvd å unngå ham fordi hun er flau fordi hun sluttet på skolen, men han skryter av hennes utvikling og utfordrer henne til å komme til Opelucid Gym for å ta en kamp mot ham. Og så er neste stopp på våre helters reise bestemt!

Iris har blitt utfordret av Opelucid City Gym-leder Drayden, og hun er tilbake i byen for å kjempe mot ham! Men i det hun ankommer(med Ash og Cilan på slep), blir hun plutselig grepet av en indre uro og hun jager av sted opp i et høyt metalltårn for å få litt frisk luft og ro. Hun får imidlertid ikke bli der lenge, for Offiser Jenny kommer raskt til stedet for å få henne ned på bakken igjen, og hun får Iris til å love aldri å gjøre dette igjen. Det virker som om den ambisøse Dragemesteren har litt av en fortid her…

Når hun møter på sin tidligere internatleder Martha, avslører Iris at hun en gang var student på Opelucid Akademiet, en av de mest berømte skolene for Pokémon-kunnskap i Unova-regionen—ledet av ingen ringere enn Gym-leder Drayden, som er akademiets president. Det virket som en ypperlig anledning for henne å lære mer om forskjellige Drage-type Pokémon…men den livlige Iris hadde problemer med å finne seg til rette i lag med de andre studentene, og hun fikk snart hjemlengsel. Hun klatret opp I tårnet I et forsøk på å få et glimt av hjemstedet sitt, og den friske luften minnet henne om hennes elskede Dragelandsby, så toppen av tårnet ble hennes favorittilfluktssted. Etter at en kamp mot en av hennes klassekamerater endte med tap, fikk hun en streng skjennepreken av Drayden om å lytte mer til hennes Pokémon. Hun bestemte seg da for at akademiet ikke var noe for henne, og hun returnerte hjem før hun dro av sted på sin reise med Axew.

Nå er det tid for Iris å bevise for Drayden hvor mye hun og hennes Pokémon har utviklet seg! Kampen starter med Draydens Haxorus mot Iris sin Excadrill—det er en omkamp etter den kampen de hadde i Dragelandsbyen da Iris var yngre! Denne gangen ender det med uavgjort, når Excadrill og Haxorus klarer å slå hverandre ut samtidig. Deretter kaller Drayden på sin Druddigon, og Iris velger sin Dragonite. Hun bestemmer seg først for å angripe fra luften siden Druddigon ikke kan fly, men ombestemmer seg raskt når hun husker at Dragonite fortrekker en like forutsetninger, og hun endrer på sin startegi for å tilfredstille hennes Pokémons ønsker. De virker jevnbyrdige, og Druddigon ender til slutt opp som vinner.

Iris lir beseiret…men kampen har tjent sitt formål, og Drayden er fornøyd med hennes potensial og den styrken hun har vist. Han anbefaler henne om å fortsette å trene og å bli sterkere, og ber henne om å komme tilbake på besøk når hun er klar. Når hun drar, avslører Martha at det faktisk var Drayden som foreslo overfor landsbyens Viser at Iris skulle dra på en reise…og at han hadde planer om at hun skulle ta over som Opelucid Gym-leder når han trakk seg tilbake!

Iris er sjokkert over å høre disse nyhetene, og ber om litt tid for å tenke på dette mens hun fortsetter på sin reise. Neste stopp: Vertress City og Unova-ligaen!

På vei mot Vertress City, stedet for Unova-ligaen, kommer heltene våre ut for et steinras. Ash og Iris prøver å klatre over det, og det gir etter under føttene deres! Men en ung mann med en Eevee kommer dem til unnsetning, og hans Espeon bruker Psychic for å transportere Ash og Iris ut av fare.

Dere redningsmanns navn er Virgil, og han er sammen med sin eldre bror, Davy, og deres far, Jeff. De er alle medlemmer av Pokémon Redningskorps, som har som mål å redde andre i nød. Korpset består av flere team, og Virgils team blir kalt Team Eevee fordi det inkluderer alle syv av dets Evolusjoner!

Like etter mottar korpset en nødmelding fra en demning i nærheten. Davy drar dit for å undersøke dette nærmere, og oppdager at hele innsjøen og demningens kontrollrom er frosset til is, noe som har ført til strømbrudd og at en arbeider sitter fast i heisen. Han evakuerer de andre arbeiderne, men en vill Cryogonal går til angrep, noe som fører til at han blir stengt inne i kontrollrommet med døren frosset igjen!

Det betyr at der er Virgils tur til å sende ut et redningskorps. Heltene våre bestemmer seg for at å redde folk ved hjelp av Pokémon høres ut som en god ide, så de blir med for å hjelpe til! Virgils oppgave er å lade opp nødbatteriene på nytt for å få strømmen tilbake. Iris og Cilan distraherer de fem sinte Cryogonal, som er ansvarlige for krisen, og Ash og Virgil finner batteriene og lader dem opp på nytt ved hjelp av Jolteon og Pikachu.

Når strømmen er tilbake igjen drar Davy av sted for å undersøke de merkelige lydene som kommer fra kontrollrommets kjeller. Der finner han årsaken til hendelsen; en liten Cryogonal, som er fanget bak noen rør! Han befrir den ved hjelp av sin Darmanitan, og oppdager da at Virgils Eevee har laget en tunnel for redde ham ved å bruke Dig.

Heltene våre, Virgil og Davy blir snart gjenforent, og den lille Cryogonal vender tilbake til sine venner, og de svever lykkelig av sted. Demningen, innsjøen og kontrollrommet blir tint opp, arbeiderne er trygge og takket være Eevees heroiske handling, blir den forfremmet til et fullverdig medlem av Team Eevee!

Før han tar farvel, avslører Virgil at han og Eevee vant alle åtte Unova Gym badges på deres reise sammen, og at de har planer om å være med i Unova-ligaen også! Ash ser frem mot en spennende ny rivalisering, i det heltene våre fortsetter ferden mot Vertress City.

Heltene våre har endelig ankommet Vertress City, stedet for Unovaligaen, og Ash er i fyr og flamme av spenning! Når de står og beundrer den enorme Unovaligastadion, begynner de kjente ansiktene til flere trenere å rulle inn i byen for å delta I konkurransen—og til Ash sin fortvilelse er Biancas entré like dramatisk som alltid.

Ash, Trip, Stephen, Bianca og den nye vennen Virgil (fra Pokémon Redningskorpset) er alle klare for å sette I gang – det samme er Cameron, som har ligget I telt I tre dager med sin Riolu, for å være sikker på at han ikke kom for sent! Men ingen har fortalt ham at han måtte registrere seg til turneringen, så Ash skynder seg sammen med sin åndsfraværende venn til Nurse Joy—like etter at registreingen er stengt. Heldigvis for Cameron, er Nurse Joy grei med ham og lar ham få registrere seg allikevel.

Neste morgen er det tid for å komme I gang! Freddy Kupp kommer dalende ned I fallskjerm, for å ønske velkommen, og han begynner med å kunngjøre reglene: før hovedkampene begynner , må Trenerne gå gjennom en kvalifiseringsrunde, hvor de bare får bruke en Pokémon hver. Stephen vinner den første kampen enkelt. Virgil og Bianca strever mot sine motstandere—og Ash skal ut mot sin aller første Unovarival: Trip!

Trip kaller på sin superraske Serperior, som sørget for Ash sitt nederlag i Pokémon World Tournament Junior Cup finalen. Denne gangen setter ikke Ash sin lit til Pignites typefordel, men velger I stedet Pikachu til å sparke I gang hans Unovaligaeventyr! Men heller ikke Pikachus Quick Attack er rakst nok til å ramme Serperior, som viker unna hvert trekk med slangeaktige ferdigheter. Til slutt får Trip Serperior til å slå tilbake med Dragon Tail—og det blir en fulltreffer! Vil Ash og Pikachu bli slått ut av Unovaligaen før de en gang har kommet til hovedkampene?

Når Unovaligakvalifiseringsrunden mellom Ash og Trip fortsetter, ser det ut til at Serperior skal hale i land seieren—for Pikachu ser slagen ut! Men Ash har bestemt seg for at hans rival ikke skal få slå ham ut av turneringen, og en kombinasjon av Iron Tail og Electro Ball snur situasjonen, noe som betyr at helten vår går videre til hovedturneringen!

Og det begynner med Cameron mot Bianca som dagens første kamp! Camerons Samurott tar umiddelbart initiativet mot Biancas Escavalier, og selv om Bianca kjører Escavaliers defensive kraft på full styrke med Iron Defense, lykkes uansett Samurott med en dobbel Razor Shell, og Escavalier er ute.

Bianca kaller på Emboar, som virker som et underlig valg—siden en Ild- type er underlegen mot en Vann-type Samurott. Men Biancas strategi er fornuftig—Emboar bruker Attract, og Samurott blir truffet umiddelbart! Med et par kraftfulle Kamp-type angrep, går Samurott ned for telling. Cameron kaller da på hans favoritt Riolu, som viser seg å være sterk som en okse til tross for sitt lille format. Med sin fart, fingerferdighet og gode timing—kombinert med trekk som Copycat og Vacuum Wave—klarer den å ta seg av Emboar, og Cameron vinner den første kampen i Unovaligaens hovedturnering!

Når den andre runden av Unovaligaen er ferdig, har Ash, Cameron, Stephen og Virgil alle vunnet sine kamper, og de går videre til tredje runde! Mens alle diskuterer hvordan de skal tilbringe kvelden – se på fyrverkeriet, sjekke alle salgsbodene på stedet eller slappe av i badstuen – vandrer Axew av sted og forsvinner raskt i mengden.

Når den prøver å finne tilbake til Iris, blir Axew dratt med av en feirende småbyfanklubb! De er i Vertress City for å heie på Russet, den første treneren i deres hjemby som har klart å ta seg videre til tredje runde i Unovaligaen.

Imens har heltene våre funnet ut at Axew har forsvunnet, og Virgil foreslår at de sjekker opptakene fra overvåkningskameraene. De løper av sted ut i byen for å lete etter Axew, men det er for mange mennesker der. De bestemmer seg for å skille lag for å dekke over et større område, og Pikachu, Oshawott, Scraggy og Emolga blir med for å lete. Mens de er ute for å lete, får Oshawott øye på en stor eske med frukt og begynner fornøyd å spise av den—og forstår ikke at maten tilhører en Garbodor og en gruppe med Trubbish, som i sinne drar av sted for å fakke tyven!

Emolga får til slutt øye på Axew--men de sinna Gift-typene nærmer seg med stormskritt, og de støter på våre helters Pokémon på kanten av en klippe! Ash og de andre hører oppstyret og kommer for å undersøke det nærmere. Alle blir gjenforent og Ash prøver å beklage Oshawotts oppførsel overfor Garbodor, men den ignorer ham og angriper!

Virgil gjør bruk av sine Pokémon Redningskorpsevner, ved først å bruke Espeons Psychic for å få alle sammen unna. Deretter bringer han frem Trøsteklokken for å roe ned Garbodor. Når kampen er blitt avverget, gjør Cilan det hele godt igjen ved å stelle i stand en deilig middag for Garbodor og gruppen med Trubbish, og alle samler seg for å se på fyrverkeriet sammen.

Tredje runde av Unovaligaen begynner neste morgen, og den første kampen er Ash mot Stephan! Stephan skal kjempe med sin nye Liepard, og Ash kaller på sin første Pokémon...men hvilken blir det? Det finner du ut neste gang!

Ash og Stephens tredjerunde kamp i Unova League er akkurat i gang, og det er Ash sin Krookodile mot Stephens Liepard! Det er ingen tvil om at begge lag satser alt for å vinne, og de ser ut til å være jevnbyrdige når de presenterer det ene kraftfulle trekket etter det andre. Krookodile få seg noen kraftige karameller når Stephen bringer ut sin fantastisk raske Zebstrika. As bytter den derfor ut mot Palpitoad—en Vann- og Jord-type for å bekjempe Zebstrikas beste trekk, Flame Charge og Thunderbolt. Med dyktig strategi fra begge lag, ender denne bataljen med uavgjort!

Den neste ut er Stephens talentfulle Sawk, som skal ut mot et uventet Pokémon-valg: Ash sin Leavanny! Men hvor Sawk er muskuløs og bestemt, er Leavanny elegant og rask, og dukker unna mange av Sawks trekk med stil! Leavannys energinivå kan imidlertid ikke måle seg med Sawks fasthety, og Sawk vinner.

Til slutt bringer Ash ut Krookodile igjen som sin siste Pokémon. Den er tydeligvis sliten etter sin første kamp, og Iris og Cilan er bekymret for typeulempen. Men Ash har en overraskelse oppi ermet: han har lært opp Krookodile til å bruke Aerial Ace! Dette uventede Flyve-type trekket snur opp ned på alt, og Ash vinner kampen!

Kvartfinalene begynner neste morgen, og Ash skal ut mot Cameron i en full seks-mot-seks kamp. På toppen av det, stilles Ash nå ansikt til ansikt med Camerons “hemmelige våpen”—en fryktinngytende Hydreigon! Hvordan vil Ash svare på dette? Det finner du ut neste gang!

Vi er i kvartfinalene av Unova League, og den første kampen er mellom Ash og Cameron—som nettopp har avslørt Hydreigon som hans hemmelige våpen! Ash velger Boldore til å starte—en virkelig sterk Pokémon. Men Hydreigons krefter er overveldende, og snart har Cameron skaffet seg det første stikket i deres seks-mot-seks kamp.

Ash sitt neste valg er Oshawott. Bianca er ikke sikker på at dette er en god ide, men Cilan og Iris er sikre på at Ash har en plan, og Oshawott beviser raskt at den har imponerende krefter til tross for sin lille størrelse! Det er imidlertid ikke helt nok til å overmanne Hydreigon, og en avsluttende Dragon Rush gir Cameron en to-null ledelse. Men når Ash velger Pignite, begynner ting endelig å gå hans vei. Pignite er en hardnakket Pokémon og nekter å gi seg selv etter å ha havnet i bakken flere ganger, og en smertefull Brick Break dunker Hydreigon ut av turneringen.

Camerons neste Pokémon er Ferrothorn—men det viser seg å være et dårlig valg mot en Ild-type som Pignite, og kampen står nå helt likt med to-to. Deretter velger Cameron Samurott, hvis styrke og ferdighet – for ikke å glemme dens typefordel—endelig overmanner Pignites fasthet.

Pignite er ute, og det er tid for Pikachu — og alle vet at de har en fantastisk kamp i vente! Samurott klarer å vike unna Pikachus Elektrisk-type angrep med sin raske Razor Shell , men en velplassert Iron Tail slipper gjennom, og Ash drar i land sin tredje seier, slik at det nå står uavgjort tre-tre.

Nå sender Cameron ut sin Swanna, og håper på en fordel fra luften—men Pikachu setter raskt en stopper for det, når dens Elektrisk-type trekk viser seg å være for sterke til å stå imot. Det er 4–3 i Ash sin favør, og det er Riolus tur til å skinne, når Ash kaller Pikachu tilbake for å hvile seg litt og sender ut Unfezant.

Men det må mer enn litt elegant flyvning til å ta seg av Riolu! Med sin kraftfulle Circle Throw og dyktige Copycat besegler den raskt Unfezants skjebne, og Ash sender ut sin sjette og siste Pokémon: Snivy! De to ser ut til å være jevnbyrdige, når kampen mellom Snivy og Riolu skrider frem, og etter en kraftfull Leaf Storm, ser Riolu ut til å være nede for telling…men det skjer plutselig en vending når Riolu utvikler seg til Lucario! Vil Ash og Snivy klare å komme tilbake etter denne overraskende vendingen?

Nå som Cameron sin Riolu har utviklet seg til Lucario midt i Unova League-kampen mot Ash og Snivy, tilspisser det seg. Etter at han utviklet seg, er Lucario sine trekk enda sterkere enn det Riolu sine var, og Snivy blir beseiret. Ash setter inn Pikachu, som ikke er helt restituert etter de forrige kampene ennå. Pikachu sin styrke og iherdighet er imponerende som alltid - et resultat av det sterke båndet mellom trener og Pokémon – og han klarer nesten å beseire Lucario. Men Lucario klarer med en siste Aura Sphere å vinne over Pikachu til slutt. Ash er ute av Unova League og Cameron går videre til semifinalen…

…hvor han møter Virgil og Team Eevee, og Flareon vinner over den sterke Lucario. Virgil sin Eevee viser seg også å være en verdig konkurrent når han beseirer sin siste motstander Druddigon, og vinner Unova League! Etter at heltene våre har tatt farvel med sine venner og rivaler, sitter Ash og tenker på alt det spennende som venter ham. Han føler seg mer klar enn noensinne, han skal gjøre sin drøm om å bli Pokémon-mester til virkelighet.

Nå som Unova League er over, drar våre helter til Nuvema Town og laboratoriet til Professor Juniper. På veien treffer de en veldig oppskjørtet jente som heter Nanette. Hun er kjemperedd for å gå på broen fordi hun er redd den skal falle ned etter at hun tappet på den. Ash prøver å vise henne at broen er trygg, ved å gå på den selv først, men han ender likevel opp med å gå tilbake og hente henne, og går sammen med henne. Nanette er takknemlig og Ash gir henne et råd: å være forsiktig er bra, men av og til må du bare gjøre ting. Heltene våre kommer fram til laboratoriet, og Nanette kommer like etter dem. Hun skal se etter en nybegynner-Pokémon. Professor Juniper sier hun har kommet til riktig sted, men Nanette blir redd igjen, og hun tror at det kommer til å skje forferdelige ting. Men, etter råd fra Cilan, velger Nanette den søte Tepig. Ash foreslår at de har en Tag kamp så hun kan bli vant til sin nye Pokémon. De to kjemper mot Cilan og Iris så Nanette kan lære å bli en trener…og kampen overværes av ingen ringere enn Team Rocket! Skurkene er tilbake på scenen og har som mål å stjele Pikachu for sjefen sin, men når de ikke får det til, bestemmer de seg for å stjele Nanette sin Tepig i stedet for! Nanette er mer bekymret og rådvill enn noen gang, men så husker hun hva Ash sa om mot. Nanette snur og viser virkelig kamp-ånd. Og ved hjelp av Ash sin fantastiske Unfezant, kommer Tepig uskadd tilbake, og Team Rocket farer av gårde. På laboratoriet får Professor Juniper en telefon fra sin far, Cedric. Han kan fortelle dem at De hvite ruiner, et arkeologisk utgravningssted som kan gi verdifull informasjon om den legendariske Pokémon Reshiram, har blitt oppdaget i nærheten av Icirrus City. Våre helter vil selvfølgelig dra dit for å se, så etter å ha sagt ha det til Nanette og Professor Juniper, går de om bord i fergen til Aspertia City. Professor Juniper har tipset dem om å oppsøke en Gym-leder som heter Cheren, som nettopp har åpnet en ny Gym der. Dermed er alt lagt til rette for nye eventyr og garantert spenning!

Om bord på et skip som seiler i retning av De Hvite Ruiner og Professor Junipers far, Cedric, møter heltene våre en spesiell mann ved navn N. N forteller at han ser på alle Pokémon som sine venner, og påstår at han kan høre de indre stemmene til Pokémon. Han syns det er godt å se det nære båndet som er mellom Ash og Pikachu. Ash nevner at de er på vei for å undersøke den legendariske Pokémon Reshiram, og når N virker interessert i å høre mer, forteller Ash ham om den gangen han traff Zekrom. N blir revet med når han forteller om sine egne mål, som for eksempel å lære mer om verdens mysterier, om hvorfor Pokémon eksisterer i denne verden, om at han ønsker å møte Reshiram og Zekrom, og å gjøre livene til Pokémon bedre. Ash syns dette høres bra ut, men det blir raskt klart at han og N har forskjellig syn på ting når N sier at han ikke liker at Pokémon blir tvunget til å kjempe mot vennene sine. I mellomtiden er Team Rocket på tokt for å stjele Pikachu for sjefen sin. Først lokker de Axew til seg mens Ash og Iris har en treningskamp, og Pikachu følger etter. Snart har Team Rocket fanget begge to, men med assistanse fra N, er de snart løslatt igjen, men Pikachu har blitt forgiftet etter et angrep fra James sin Amoonguss. Ash vet ikke hva han skal gjøre, men N har en plan. Han tar med alle bakerst på dekk og kaller på vennene sine. To ville Alomamola hopper opp av sjøen og bruker Refresh til å hele Pikachu.

Skipet legger til kai ved Castelia City, hvor N går av, men han forsikrer heltene våre om at de vil treffe ham igjen. Når han drar, tenker han på hva det betyr for Ash å ha truffet Zekrom, at det vil endre livet hans.

Våre helter har endelig kommet fram til Aspertia City, og på anbefaling fra Professor Juniper vil de besøke den nye Gym, som også er en skole hvor de kommende trenerne kan lære alt om Pokémon. De treffer en ung trener som heter Cheren, som også viser seg å være den nye Gym-lederen. Ash utforder Cheren til kamp, men de må nøye seg med en oppvisnings-kamp fordi kamparenaen ikke er ferdig bygget ennå. De planlegger en kamp senere samme dag, og i mellomtiden viser Cheren heltene våre rundt på skolens område. I løpet av denne rundturen drar Axew av sted på egen hånd, og når Pikachu følger etter den, havner de begge to i trøbbel. Bråket det medfører sendes utover skolens høyttaleranlegg. Det plutselige bråket skremmer de Pokémon som bor i Pokémon-huset på skolen, og de flykter ut gjennom en åpen dør. Alle leter etter dem og etter litt om og men, fanger Ash noen godt kamuflerte Sunflora. Iris får tak i flere Minccino fra skolekjøkkenet, og Cilan og Pansage klarer å få noen motvillige Ducklett ut av bassenget. Cheren teller over alle Pokémon ettersom de kommer tilbake til Pokémon-huset, og oppdager at det er en Shinx som mangler. Heltene våre finner den, men Shinx er redd, og når to av elevene innringer den og prøver å ta den, angriper den. Cheren iler til for å beskytte elevene og prøver å roe ned Shinx. De to elevene bryter sammen og forteller at de ville prøve å fange dem fordi det var de som hadde latt døren til Pokémon-huset stå åpen. Cheren tilgir dem og det er tid for en kamp mellom Cheren og Ash. Med elevene som heiagjeng, viser Cheren hvor dyktig han er med Herdier, og selv om Ash får inn noen kraftige angrep, vinner den nye Gym-lederen. Cheren takker Ash for å ha hjulpet ham med å bygge opp selvtilliten, og bestemmer seg for å slutte å bekymre så mye over jobben som Gym-leder, lærer og rollemodell for elevene. Heltene våre sier farvel og reiser videre til De hvite ruiner.

I et mørkt laboratorium eksperimenterer vitenskapsmannen Colress på en skrekkslagen Galvantula, og prøver å øke dens kraft ved å bruke elektromagnetiske bølger. Det virker som han er medlem av en mystisk organisasjon som kalles Team Plasma, som har som mål å herske over Unova-regionen. I mellomtiden er våre helter på vei til De hvite ruiner via Floccesy Town. Der blir de angrepet av tre sinte Amoonguss. Ash, Iris og Cilan nedkjemper dem og tar dem med til Pokémon-senteret, hvor det viser seg at det er helt fullt. Nurse Joy forteller at det er flere fjell-Pokémon som har kommet ned fra fjellet og begynt å angripe folk helt umotivert, og en av trenerne sier at han har sett noen fremmede oppe ved det forlatte observatoriet nær toppen av fjellet.

Ash og de andre drar avgårde for å undersøke saken. Etter en stund treffer de på en skjeggete mann som råder dem fra å gå videre fordi det er for farlig. Det viser seg raskt at han har rett, for plutselig begynner alle Pokémon i området å angripe dem, inkludert Pikachu og Axew. Mannen har et skjold som beskytter de Pokémon mot de farlige EM-bølgene. Etter at de har roet seg fjerner han forkledningen sin. Det er etterforsker Looker fra det internasjonale politi, sist sett da han nedkjempet Team Galactic i Sinnoh-regionen, og nå på jakt etter Team Plasma. Han har fulgt etter dem til det forlatte observatoriet, og naturligvis blir våre helter med ham videre for å hjelpe til.

Når de konfronterer Team Plasma inne i observatoriet bestemmer Colress seg for at Pikachu er det perfekte testobjektet for sine eksperimenter. Det oppstår et intenst øyeblikk når Pikachu kjemper mot apparatet til Colress, men båndet melllom Ash og Pikachu er sterkere enn noen EM-bølge, og Pikachu bryter seg løs. Mens Colress beundrer det han nettopp har sett, oppdager han at en merkelig dings er plugget inn i apparatet hans, og den stjeler dataene! Det er Team Rocket! De tar noe av utstyret - og slik løses alle fjell-Pokémon fra Colress sin kontroll - og flykter i ballongen sin. Men en missil fra Team Plasmas luftskip sender dem raskt opp i lufta. Looker skjønner at det gjenværende utstyret er innstilt på selvødeleggelse, og sørger for at alle kommer seg raskt ut av bygningen før observatoriet sprenges i lufta og ødelegger alt bevis på at Team Plasma har vært der og på Colress sine eksperimenter. Han lover å komme til bunns i Team Plasmas skurkeplaner, og Ash og de andre ønsker ham lykke til i det de tar farvel med ham og reiser videre til De hvite ruiner.

På sin reise til De hvite ruiner møter Ash, Iris og Cilan en uregjerlig Mareep og en Ampharos som prøver å få den med seg tilbake til flokken, uten særlig hell. Snart møter de en jente som heter Ellie og hun tar dem med seg til Floccesy Ranch hvor bestefaren hennes aler opp Pokémon. Ampharos gjeter Mareep-flokken, men den mangler autoritet, så de Mareep bryr seg ikke så mye om hva den sier. Ellie forteller at hun driver og lærer Ampharos et kraftigere trekk, Thunder Punch, for at den skal få litt mer autoritet, men det har ikke gått så bra. Iris kommer på at hennes Dragonite kan Thunder Punch, og spør den om den vil være treneren til Ampharos. Dragonite vegrer seg først, men etter hvert går han inn for oppgaven, og er overraskende tålmodig når Ampharos ikke får det til.

Team Rocket-trioen lurer i buskene som vanlig, og planlegger å stjele Mareep for å forbedre maskinen som skal fange Pikachu. De får med seg et par Mareep ved hjelp av en elektrisk stråle, og når Ellie oppdager at de er borte, blir våre helter med for å lete. Men de blir overrasket av tett tåke og må gi opp letingen.. inntil Ampharos bruker lyset sitt til å klarne tåken, og da får de øye på Team Rocket og de savnede Mareep. Kampen begynner, og Ampharos får endelig til Thunder Punch, og Jessie, James og Meowth flyr av gårde igjen.

Nå som Ampharos har bevist hva den er god for og reddet de Mareep, har de begynt å respektere den. Og Ellies bestefar bestemmer seg for at Ampharos er en god vakt-Pokémon likevel. Vel vitende om at ranchen er i de beste hender, fortsetter våre helter reisen til De hvite ruiner.

Team Plasma jobber fortsatt med sin onde plan, å fange Pokémon for å bruke dem som forsøks-objekter i et eksperiment som har verdensherredømme som mål. To tilhengere, Schwartz og Weiss, har fanget en Braviary og kjører den tilbake til hovedkvarteret, men de møter på en veisperring, plassert der av N. I forvirringen som oppstår, åpner N lasterommet og slipper fri Braviary, og de rømmer sammen, men de har begge blitt skadet, og Braviary har en skjult sporings-enhet festet til nakken.

I mellomtiden er våre helter på vei til De hvite ruiner, og på veien møter de det skadde paret. De drar til Pokémon-senteret, hvor Nurse Joy bandasjerer den skadde vingen til Braviary. I løpet av et mystisk strømbrudd forårsaket av Team Plasma, oppdager N sporings-enheten, og skjønner at han må få Braviary vekk derfra fort. Han forklarer planen for Ash og de andre, og de setter i gang. Schwartz og Weiss jakter på signalet fra sporings-enheten, men de oppdager raskt at det bare er N som opptrer som lokkemat for å distrahere dem mens Ash, Iris og Cilan får Braviary i sikkerhet.

Men Braviary føler at N er i fare, og strever og roper helt til våre helter skjønner hva det er. De kommer fram til N i siste liten, for N blir angrepet av tilhengerne sine Pokémon. Ash vet at N misliker Pokémon-kamper, det det ser ikke ut til at de har noe valg, og snart er kampen i gang; Zangoose og Seviper på skurkenes side mot Ash sin Pikachu og Iris sin Excadrill, med litt hjelp fra den ville Braviary, som resulterer i at våre helter vinner. Schwartz og Weiss flykter, og lover seg selv å fange Braviary en annen dag.

Endelig kan Braviary vende tilbake til naturen, og våre helter kan fortsette reisen, men denne gangen.. bli N med dem!

På sin vei til De hvite ruiner har våre helter og N nå kommet fram til Virbank City. De ser at det brenner og løper til for å finne ut hva som har skjedd. Men i det Ash ber Oshawott om å slukke brannen blir de stoppet av en meget bestemt Watchog som bærer et rødt skjerf. Det viser seg at brannen er en del av en øvelse iscenesatt av Pokémon-havne-patruljen, et team som passer på havne-området i Virbank City. Under ledelse av kaptein Halsey er Dewott og Frillish med på å redde folk, og slukker brannen, mens Watchog sitter vaktpost.

Men det er noe som plager Watchog, og N skjønner hva det er. Watchog vil også være med og redde folk. Uheldigvis stryker Watchog på opptaksprøven, så Halsey ber den om å fortsette på vaktposten litt til. N sier hva han mener, og det er at han ikke støtter at Pokémon skal tvinges til å redde folk i det hele tatt, og mens han og Halsey diskuterer, får kapteinen en telefon om en ekte nødsituasjon, en brann i Virbank Complex, hvor en lokal barnehage er på besøk. Alle løper til for å hjelpe, mens Team Rocket, som lusker rundt som vanlig, finner ut at de skal fange Pikachu i kaoset som oppstår. Mens Ash, Iris, Cilan og N leder barn og arbeidere ut av bygningen og Watchog står vakt, går Halsey, Dewott og de Frillish inn i bygningen for å slukke brannen. Men når Team Rocket dukker opp og kampen begynner, starter enda en brann på utsiden.. branndørene slås igjen automatisk og sperrer Halsey og hans team inne. Ash og Oshawott prøver å slokke brannen, men de klarer det ikke alene. Iris ber Excadrill om å grave en tunnell inn til Halsey, men når det er for hardt å komme gjennom for Excadrill, får N en idè. Han ber Watchog bruke sine evner til å se hvor de harde stedene er, og sammen klarer Watchog, N, Iris og Excadrill å få Halsey og de andre ut av bygningen. De slokker raskt den andre brannen, og Halsey sier at han vil vurdere om Watchog skal få prøve seg i redningsarbeidet. N sier at han også har fått noe å tenke på, fordi Watchog har vist ham at noen Pokémon hjelper mennesker fordi de ønsker det.

På reisen til De hvite ruiner stikker våre helter, som nå reiser med N, innom Kanto-markedet, en festival som feirer naturen i Kanto. Ash, som opprinnelig kommer fra Kanto, begynner selvfølgelig å mimre om hjemstedet. Og når Professor Oak presenterer de tre Pokémon som er tilgjengelig for nye trenere, Bulbasaur, Charmander og Squirtle, kommer minnene om Ash sin egen tidlige Pokémon-reise tilbake.

Ash forteller om hvordan han først møtte Charmander. Akkurat som Tepig, var Charmander forlatt av sin opprinnelige trener. Ash reddet den, og den ble raskt en del av hans Pokémon-familie. Men da den utviklet seg til Charmeleon, sluttet den helt å høre på hva Ash sa, og gjorde akkurat som den ville. Men Ash ga aldri opp, og etter en stund utviklet den seg til en fantastisk og fryktinngytende Charizard.

De to reiste sammen en stund. De var i Charicific Valley, hvor mange Charizard trener sammen. Ash benyttet anledningen til å trene opp styrken til Charizard her. Selv om de to har møttes ved flere anledninger, vil Ash gjerne se sin gamle venn igjen, og det vil alle de andre også. Så Professor Oak ordner med et Pokémon-bytte, og Charizard kommer på besøk.

Når Charizard møter Iris sin Dragonite, begynner det å gnistre mellom dem, og de prøver å begynne å slåss. I stedet for å prøve å stoppe dem, foreslår Ash at de kan ha en skikkelig kamp. Det blir raskt tydelig at Charizard har trent hardt i Charicific Valley, og begge Pokémon viser hvor sterke de er. N avslutter kampen, og konstaterer at de to Pokémon nå har fått respekt for hverandre. Ash spør om Charizard vil reise sammen med ham igjen, noe alle de andre er glade for. Reisen til De hvite ruiner fortsetter, men nå er også Charizard med, gjenforent med våre helter nok en gang.

I det våre helter fortsetter på reisen, finjusterer Team Plasma sin onde plan: å fange og kontrollere alle Pokémon, øke raseriet og angrepsstyrken maksimalt, ved bruk av apparatet Dr. Colress har utviklet. Agentene til Team Plasma holder også et øye med Cedric Juniper og hans team ute ved De hvite ruiner, samtidig som de leter etter N.

Ash og de andre blir stoppet av Officer Jenny, som forteller dem at broen er stengt på grunn av en rasende Haxorus som ramponerer byen. Iris vet at en dragetype aldri ville gjort noe sånt uten grunn, så de løper av gårde og prøver å finne en annen vei inn til byen. De finner en robåt som er lekk. De kommer fram til en by som virker forlatt, men plutselig løper de rett på Looker fra det internasjonale politi. Looker leder sin egen etterforskning. Ash presenterer Looker for N, men Looker har allerede kjent ham igjen som en Team Plasma ser etter. I mellomtiden har Team Rocket sett på ødeleggelsene og tenker at det må være Team Plasma som har fått Haxorus til å gjøre dette (basert på hva de har sett i Flocessy Town). Jessie, James og Meowth bestemmer seg for at det apparatet Team Plasma har brukt for å oppnå dette resultatet, det skal de ha! Når våre helter og N finner Haxorus, prøver de å roe den ned. Men når Iris henter fram Dragonite for å hjelpe, sikter Colress på den. Dragonite blir truffet, og blir like rasende som Haxorus. Slåssingen fortsetter, og når Team Plasma oppdager N, blir det tydelig at de kjenner hverandre fra før. Team Plasma vil at N skal bli med dem, men N nekter. Han ber dem la ham være i fred. Og når Iris havner midt i skuddlinjen, dytter N henne ut av veien. Han blir selv truffet, og slått bevisstløs. I mellomtiden har Team Rocket prøvd å stjele flyet til Team Plasma (og det apparatet de kontrollerer Pokémon med) mens Team Plasma var opptatt med noe annet. Men det går ikke ubemerket hen så lenge, og når slåssingen begynner igjen, blir apparatet ødelagt av et angrep av Team Plasmas Liepard. Haxorus og Dragonite blir sluppet fri, Colress signaliserer retrett, og Team Plasma stikker av, selv om de vet at Lord Ghetsis, lederen, vil at de skal få tak i N uansett hva det koster.

Ash, Iris og Cilan prøver forgjeves å vekke N. En mystisk tåke legger seg over landskapet, og to kvinner dukker opp. De får sine Pokémon, Gothitelle og Gardevoir, til å løfte N, og dra av gårde med ham. Våre helter og Team Rocket følger etter dem. Skurketrioen havner bokstavlig talt på kanten av stupet, mens våre helter står ved foten av fjellet, og ser på at kvinnene senker N ned i et vann. Hva er det de gjør med ham? Svarene kommer, i det reisen fortsetter.

På sin reise kommer våre helter og N over flere Team Plasma-tilhengere som fanger uskyldige Pokémon og bruker dem som testobjekter. Det oppstår en kamp mellom de to partene, og N havner midt i skuddlinjen og blir alvorlig skadet. To mystiske kvinner kommer ut av en tett tåke og tar med seg N til en dam langt ute i skogen, og våre helter følger etter.

Våre helter står forbauset og ser på at N blir fullstendig frisk igjen. De får vite at N og hans to kompanjonger, Concordia og Anthea, bor på et hemmelig skjulested, som også er et fristed for skadede Pokémon.

N forteller at han som liten gutt bodde i et herskapshus og aldri fikk gå ut. Concordia, Anthea og N ble alle tre fortalt av Ghetsis, Team Plasmas leder, at de var forutbestemt til å kunne høre de indre stemmene til Pokémon, og at de dermed kunne hindre at Pokémon ble dårlig behandlet av mennesker. Men når Ghetsis blir konfrontert av den legendariske, og veldig sinte Reshiram, innser de at Ghetsis har løyet til dem.

Fortsatt er N og kompanjongene hans overbevist om at man ikke kan stole på mennesker, og mener at Pokémon må holdes unna mennesker.

Våre helter bestemmer seg for å vise at de tar feil, og Concordia og Anthea blir snart overrasket over hvor godt Pokémon går overens med de unge trenerne.

Når Team Plasma finner skjulestedet til N, oppstår det en ny kamp. Men våre helter er parat, og Team Plasma trekker seg tilbake, for denne gang.

Likevel holder N, Concordia og Anthea fast på overbevisningen om at Pokémon og mennesker ikke bør leve sammen, så de tar farvel og forsvinner i tåken. Ash og vennene hans lurer på om de noen gang kommer til å få se vennen sin N igjen.

Etter å ha tatt farvel med N og kompanjongene, har våre helter kommet fram til Dragespiraltårnet. De er like ved De hvite ruiner, og Ash er utålmodig. Men først må de finne ut av noe. Pignite sin Flamethrower har blitt veldig svak, og etter å ha undersøkt litt, finner de ut at noe sitter fast inni nesen. Det hjelper ikke å hoppe opp og ned, og Charizard sin spinning i lufta hjelper heller ikke. Til slutt prøver Iris å kile Pignite i nesen med et gresstrå. Da kommer det ut i et kraftig nys, det som viser seg å være en kapsel fra et tidligere Bullet Seed-angrep.

Mens de er opptatt med dette, driver Team Plasma og Team Rocket og lurer hverandre. Jessie og James bryter seg inn i Team Plasmas laboratorium for å stjele maskinen som Colress bruker til å kontrollere Pokémon. Mens alle jager dem, går Meowth inn til Dr. Colress og inviterer ham til å bli med i Team Rocket. Colress virker smigret, men først vil han bruke Meowth som testobjekt. Meowth går med på det, og planlegger å bruke sine spesialtrente konsentrasjonsferdigheter til å unngå å bli påvirket av maskinen. Men maskinen er for kraftig og Meowth faller offer for Team Plasmas kontroll. Den vender seg til og med mot Jessie og James når de kommer tilbake etter å ha vært lokkemat for Team Plasma. Etter mye kamp klarer de å trenge gjennom Meowth sine Fury Swipes og gjenopprette kontakt med sin partner, og de flykter sammen alle tre.

Ghetsis er ikke fornøyd med at Team Plasma ikke har klart å få tak i N, men han har oppdaget noe som kanskje kan lede dem til Reshiram, og det befinner seg ved De hvite ruiner. Jessie, James og Meowth overhører dette fordi de har plassert lytteutstyr på laboratoriet til Team Plasma. Så nå ser det ut til at våre helter, Team Plasma og Team Rocket skal til samme sted.

Ash, Cilan og Iris møter Professor Junipers assistent utenfor Dragespiraltårnet, og han tilbyr dem å sitte på i bilen det siste stykket til De hvite ruiner hvor Professor Juniper venter. Underveis forteller han dem at utgravningsteamet kan ha funnet noe veldig stort, men mer vil han ikke si. Vel framme møter de Professor Juniper, som viser dem en dør som er dekorert med mystiske symboler. Han flytter på noen av steinene, og døren åpner seg! Der, rett foran øynene på dem, er lyssteinen, den gjenstanden som ifølge legenden er Reshiram i en annen form! Når professoren løfter steinen, spruter den ild, og sender et voldsomt lys opp i lufta, uten å skade professoren.

N ser lyset fra avstand og føler nærværet av Reshiram. Han drar til ruinene, overrasker Professor Juniper og de andre, og forlanger å få vite hva professoren planlegger å gjøre med steinen. Cedric forklarer at lyssteinen og Reshiram er en del av hans livsverk, og sier at han har tenkt å undersøke steinen nøye. Dette finner N uakseptabelt og han tar affære. Han tar kofferten med steinen og løper av gårde. Ash løper etter ham, men bakken gir etter. N går tilbake for å hjelpe ham, og han slipper til og med taket i steinen for å ta tak i hånda til Ash, men han faller han også, og begge to lander på myk sand langt nede i dypet.

Tilbake på overflaten, prøver de andre å finne ut hvordan de skal redde Ash og N, mens de får uventet besøk: Team Plasma! Skurkene så også lyseksplosjonen fra steinen og dro til ruinene for å få tak i både N og lyssteinen. De skal til å angripe Iris, Cilan og Cedric, men akkurat da avslører professorens assistent sin egentlige identitet; det er etterforsker Looker fra det internasjonale politi. Han tar tak i Aldith fra Team Plasma, og sier at forsterkninger er på vei. Men Colress aktiverer sin nå perfeksjonerte maskin, og tar kontroll over Golurk som har hjulpet til med utgravningene, og vender den mot vårer helter!

Jessie, James og Meowth har fulgt etter Team Plasma til feltet, men de bestemmer seg for å slappe av og vente til mørket faller på, for så å ta lyssteinen og Pikachu. Nede i dypet har Ash og N en lang prat om forholdene mellom mennesker og Pokémon. N mener fortsatt at Pokémon har det best uten mennesker, men Ash insisterer på at hans eneste hensikt med å lære mer om Pokémon er at han vil værer venner med dem, inkludert Reshiram! Når de hører lyden av kamper over seg bestemmer de seg for å finne en vei ut. Hvem vil gjøre krav på lyssteinen når dette slaget er over?

Team Plasma planlegger å stjele Lyssteinen og ta N til fange. Cilan og Iris kjemper mot dem oppe på bakkenivå mens Ash og N er fanget under bakken. N hører de indre stemmene til sine Pokémon-venner, og føler den samme uroen som de føler. Ash bestemmer at de må komme seg ut for å kunne hjelpe til, og minnes en av eventyrreglene til professor Cedric Juniper: Gi ikke opp før det er slutt. Og mens N forbauset ser på, får Ash ut alle sine Pokémon, og de begynner å grave en tunnell opp til overflaten. N er overveldet over det sterke båndet mellom dem.

Samtidig, på overflaten, har Colress igjen aktivert sitt Pokémon-kontroll-apparat. Cilan og Iris føler seg tvunget til å returnere Crustle og Dragonite til sine Pokeball, sånn at apparatet ikke kan kontrollere dem. Dette gjør dem sårbare, og Team Plasma rykker fram for å ta dem. Aldith vil at Colress skal sende de kontrollerte Pokémon ned i undergrunnen, og akkurat da bryter Krookodile opp fra undergrunnen, etterfulgt av Charizard, Ash og N, som holder Lyssteinen! Colress sikter apparatet sitt mot Ash sine Pokémon, og Ash returnerer alle sammen..alle bortsett fra Pikachu, som som kjent har aversjon mot å være i sin Pokeball. Apparatet til Colress tar kontroll, og Pikachu snur seg mot heltene våre og begynner å angripe. Ash prøver alt han kan å få bestekompisen til å kjenne ham igjen, men får det ikke til. Pikachu langer ut et fullblods Thunderbolt mot Ash på kloss hold, og slår ham bevisstløs.

N blir desperat og ofrer seg selv og Lyssteinen, mot at Colress slår av apparatet og frigir Pikachu. De kommer til enighet, N blir tatt hånd om av Team Plasma, og Pikachu kommer til hektene igjen og kryper trist opp i armene til den skadde Ash. Ghetsis ankommer og avdekker sitt ultimate mål: å vekke den legendariske Pokémon Reshiram fra Lyssteinen og ta kontroll over hjernen. Klarer heltene våre å stoppe denne skurkeplanen før det er for sent?

Team Plasma fortsetter mot sitt mål om å kontrollere Reshiram, og våre helter er hjelpeløse vitner. Axew sniker seg ut av håret til Iris, der den har vært trygt beskyttet, og klarer å slippe løs Iris og Cilan fra metallbåndene som holder dem fast. Så dukker Concordia og Anthea opp fra tåken og ber N komme og gjemme seg sammen med dem. Men N velger å bli i virkelighetens verden og kjempe for sine idealer. Apparatet til Dr. Colress har tatt kontroll over både Gothitelle og Gardevoir, og den nylig vekkede Reshiram, og situasjonen ser ikke bra ut. Så kommer Team Rocket på banen. De har sittet på sidelinjen og fulgt med på trygg avstand, men når etterforsker Looker ser dem og ber om hjelp til å ødelegge apparatet og frigi alle kontrollerte Pokémon, går de med på det. Meowth distraherer de andre medlemmene av Team Plasma mens Ash og Pikachu nærmer seg apparatet. Colress prøver desperat å ta kontroll over Pikachu, men viljestyrken til Pikachu, og båndet til Ash, er sterkere, og Pikachu sikter Thunderbolt på Reshiram for å frigjøre den også. Apparatet bli ødelagt, og Team Plasma beseires, takket være et uvanlig samarbeid mellom våre helter og Team Rocket.

Reshiram er fri, men fortsatt veldig sint. N snakker med Reshiram og prøver å roe den ned, og Reshiram blidgjøres når N forteller at mennesker og Pokémon kan leve og jobbe harmonisk sammen. Han lover Reshiram at han skal fortsette å kjempe for en ideell verden for alle, både mennesker og Pokémon, og virker fornøyd med svaret fra Reshiram. Iris vil vite hva Reshiram svarte, men det vil ikke Ash. Han vil heller møte Reshiram igjen en dag, og spørre ham selv.

Ash flyr på ryggen til den legendariske Pokémon Reshiram og har det kjempemorsomt. Plutselig blir de utfordret til kamp av Iris, som rir på den legendariske Pokémon Zekrom. Zekrom sin Thunderbolt slår ut Ash.. og han havner i senga på laboratoriet til Professor Juniper. Han har drømt, og siden Iris ikke klarte å vekke ham, ba hun Pikachu bruke Thunderbolt på ham. Hun ber ham gjøre seg klar, for neste del av reisen begynner i dag! Ash skal hjem til Kantoregionen, og både Iris og Cilan bestemmer seg for å bli med. Professor Juniper foreslår at de reiser til Kanto med et cruiseskip som skal ha flere stopp på Decolore-øyene. Den idèen liker alle tre.. og smuglytterne fra Team Rocket.

Takket være noen knep fra Team Rocket, ender våre helter opp på deres lille skip, i stedet for på det store skipet som faktisk skal til Kanto. Jessie, forkledd som mannskap, får Ash, Iris og Cilan til å overlate sine Pokeball til henne, og byr Pikachu og Axew noe godt å spise. Hun lokker de Pokémon inn på et lekerom mens James, forkledd som kaptein, tar med seg våre helter til deres rom, og låser dem inne der.

Men det var èn Pokeball som rullet av gårde mens Jessie var uoppmerksom, så Oshawott vandrer fritt omkring på skipet.. og oppfatter raskt hva Team Rocket driver med.

Oshawott angriper, og dens Razor Shell treffer kontrollpanelet, og slår ut det elektriske anlegget, og dermed åpnes alle dørene. Ash, Iris og Cilan får raskt tak i sine Pokémon og løper opp på dekk for å konfrontere Team Rocket, og kampen begynner, selv om Cilan advarer mot å slåss om bord på et skip. Og han får rett! Når Iris ber Excadrill om må bruke Dig, går det rett gjennom bunnen av skipet, som begynner å synke.

Team Rocket blir blåst av sted i en diger vannsprut, og våre helter klarer å flykte, til det riktige skipet denne gangen. Nå er de på vei til Kanto, og skal stoppe underveis på Decolore-øyene, i det reisen fortsetter.

På vei tilbake til Pallet Town, ser våre helter frem til sitt første stopp på Decolore-øyene: Honning-øya, kjent for sin søte honning laget av Combee som bor der, og for noen av de søteste dessertene noen noensinne har smakt. I det de forlater Decolore Queen blir de møtt av Jessie og James fra Team Rocket forkledd som turistguider, og invitert til å bli med til øyas berømte dessertfabrikk for å smake på alle de 151 søte dessertene. Men selvfølgelig, det er en felle, og våre helter detter ned i en fallgrop rett etter at de har gått ut av bilen. Den påfølgende kampen tiltrekker seg en sint sverm av Beedrill. I det våre helter og skurkene sprer seg, kommer de bort fra sine Pokémon, og Pikachu, Axew, Oshawott og Meowth bestemmer seg for sammen å finne veien tilbake til skipet. Meowth har selvfølgelig sin egen agenda, og Pikachu er med rette mistenksom. Alle havner i trøbbel underveis: De Beedrill vil ikke slutte å jage Jessie og James, Ash og gjengen forstyrrer en Ursaring, og må løpe vekk fra den, og Pikachu, Axew og Oshawott ender opp med å redde Meowth fra en farlig Victreebel. Når de Pokémon endelig kommer tilbake til byen, står det et par politioffiserer og tilbyr dem skyss til Pokémon-senteret hvor trenerne deres venter..men det viser seg at det er Jessie og James igjen! Dragonite og Charizard kommer raskt til unnsetning, og kampen begynner igjen, men når Jessie ber Meowth om å bli med og kjempe, får ikke Meowth seg til å angripe ”kompisene” sine, og skurkene blir blåst av sted igjen. Til slutt ender våre helter opp på Pokémon-senteret, hvor Nurse Joy først tar seg av de utslitte Pokémon og etterpå dekker et bugnende bord med honning-fylte desserter for alle som vil smake. Det blir en søt slutt på en lang dag.

Når våre helter forlater Honning-øya og reiser videre med et annet skip, blir de overrasket over å se Porter om bord på skipet, sjefspurseren de traff på det forrige skipet! Den nye Porter forklarer at han er den identiske fetteren til han de møtte sist gang. Så forteller Porter om den kommende Hav-Cup-turneringen, og Ash og Iris vil gjerne delta!

De treffer også Ripple, en av de mest kjente sten-samlerne i Unova, og hun vil vise dem sten-samlingen sin etter turneringen. Hun vil også vise dem sin Purrloin, som, i likhet med alle Purrloin, gjør Cilan nervøs. Når Ripple viser dem samlingen sin, blir alle spesielt opptatte av ”Liepard sitt øye”, den største stenen i sitt slag i hele verden. Shaw som også er en lideskapelig samler vil gjerne kjøpe stenen, men til hans frustrasjon vil ikke Ripple selge den.

Hav-Cup-turneringen begynner oppe på skipets hoved-dekk. En ukjent trener som heter Teaque og hans Vanillite vinner lett over Iris og Axew, og i finalen kjemper Ash og Pikachu mot Teaque, som velger Galvantula denne gangen. Samtidig sniker Shaw seg inn på det låste rommet hvor stenene er, for å se nærmere på ”Liepard sitt øye”. Under kampen forårsaker Galvantula sin Thunderbolt et midlertidig strømbrudd. Når strømmen er tilbake vinner Ash og Pikachu kampen, og plutselig, helt ut av det blå, hopper Purrloin på Teaque og angriper ham. Ash klarer å få Purrloin til å slippe taket og den løper sin vei. Ripple og Porter drar for å se etter den, og når de kommer til sten-rommet, oppdager de at Shaw har brutt seg inn, og at ”Liepard sitt øye”er forsvunnet! Shaw insisterer på at den var borte da han kom, men med tanke på hans ekstreme interesse for stenen, anses han fortsatt som hoved-mistenkt. Men etter å ha lett gjennom alt, kan Porter fortelle at stenen ikke er å finne blant tingene til Shaw. Det er et mysterium, og ved en tilfeldighet er en av våre helter spesielt opptatt av mysterier. Og plutselig er Detektivkjenner Cilan på saken. Han begynner å sette sammen bevisene, og skjønner fort at selv om han ikke liker Purrloin, så var den på rommet mens stenen ble stjålet, og Purrloin er dermed hans viktigste vitne. På bakgrunn av Purrloin sitt plutselige angrep på Teaque etter strømbruddet, og den våte flekken på teppet ved siden av bordet hvor stenen var, kan han konkludere: Teaque må ha forårsaket strømbruddet med vilje, og sendt sin Vanillite inn på det låste rommet via luftesjakten for å stjele ”Liepard sitt øye”!

Saken er løst, stenen er tilbake, og eventyrene til sjøs fortsetter!

Om bord på cruiseskipet som seiler mellom Decolore-øyene, oppdager Ash, Iris og Cilan et stort antall Oshawott og Dewott. Porter forteller dem at neste stopp er Muslingskjell-øya, hvor det hvert år holdes en konkurranse der Oshawott og Dewott konkurrerer om Muslingskjell-konge-tittelen. Ash sin Oshawott har naturligvis lyst til å delta.

På øya viser Freddy ”Skup” fram premien, det nydelige Gyldne Muslingskjell, som øyeblikkelig blir interessant for Team Rocket. Freddy presenterer alle for Osharina, regjerende Muslingskjell-dronning, som øyeblikkelig får Ash sin Oshawott sin oppmerksomhet. Men det ser ut til at Muslingskjell-dronningen har en beundrer allerede, en Dewott ved navn Caesar. Caesar sørger for å holde Oshawott unna, og dens Trener, Cadbury, forteller Ash at Oshawott ikke har en sjanse.

Kampen starter med visning av Muslingskjell. De vurderes etter hvor vakre de er, og hvilken form og farge de har. Publikum og dommerne virker imponerte over alle Muslingskjellene, men Iris og Cilan synes det er vanskelig å se forskjell på dem. Den siste deltakeren er en litt rar Dewott med to enormt store Muslingskjell, det er Meowth i forkledning, med et par falske Muslingskjell håndlaget av James!

Deltakerne skal kaste sine Muslingskjell mot en målskive. Oshawott sitt kast er ikke dårlig, Caesar sitt forsøk er mye bedre, og Meowth sitt Muslingskjell går kjempelangt..men James aktiverer fjernkontrollen og fører det rett mot midten av målskiva. Neste øvelse er å bruke sine Muslingskjell til å knuse murstein, og igjen har James laget et falskt Muslingskjell som skal tåle mye. Uheldigvis for Meowth, er ikke forkledningen like bra laget, og de blir avslørt under Muslingskjell-visningen. Jessie og James forbereder seg på flukt, og aller helst vil de ha med seg Det Gyldne Muslingskjell, men Pikachu setter en stopper for planen med en Thunderbolt som gjør at skurkene blir blåst av sted igjen. I siste runde kjemper Cadbury og Caesar mot Ash og Oshawott, og til tross for at Cadbury er overbevist om at en uutviklet Pokémon ikke kan slå dem, vinner Oshawott kampen. Freddy overrekker Oshawott Det Gyldne Muslingskjell og annonserer at Kong Oshawott skal være Muslingskjelløya sin maskot, sammen med Dronning Osharina, i ett år. Ash blir trist ved tanken på å måtte reise videre uten Oshawott, men han ser hvor betatt Oshawott er av Osharina, og vil at Oshawott skal bli lykkelig.

Men Osharina har andre planer, og viser tydelig at den har valgt en annen konge. Det virker som dronningen og Caesar er ment for hverandre likevel. Oshawott sitt hjerte er knust og det er også dens Muslingskjell. Uten et fungerende Muslingskjell, kan ikke Oshawott være Muslingskjell-konge. Caesar blir kronet i stedet, og Oshawott reiser videre med våre helter som returnerer til skipet.

Fra dekk på cruiseskipet ser Ash, Iris og Cilan noe som ser ut som en kjempe-Pokémon inni tåka. Det virker ikke som om noen andre har sett den, så de bestemmer seg for å spørre noen når de kommer fram til neste stopp, Store Spektral-øya, for å finne ut om øyboerne vet noe. En butikkeier forteller dem at det gikk et rykte om et sånt syn på den lille naboøya, og de løper straks av gårde for å undersøke før han rekker å si at ryktet er ti år gammelt.

Den lille øya viser seg å være et hellig sted for Pokémon. I det våre helter utforsker skogen, bli de truet av en diger Heatmor, som driver dem rett mot klippene! Den skremmer også flere ville Pokémon, blant annet en Foongus som angriper Axew med Spore i et forsøk på å slippe unna, og Axew faller i dyp søvn. Pikachu prøver å kjempe mot den enorme Pokémon, men det er ingenting som virker. Plutselig kommer en mystisk person i mørk frakk og solbriller ut fra skogen og stiller seg opp mellom våre helter og den store Heatmor, og så forsvinner de begge to! Cilan tror at alt er en illusjon, men det er større enn som så. Axew sover fortsatt og de må få den til et Pokémon-senter.

På vei tilbake til den andre øya oppdager de et gammelt og nedslitt Pokémon-senter som ligger gjemt langt inni skogen, og det er fullt av ville Pokémon på venteværelset. Iris ber om hjelp, og en Audino dukker opp, og løper av gårde for å finne Nurse Joy, som kommer ut uten Audino. Dette forvirrer Ash, siden Nurse Joy og Audino alltid jobber sammen. Et annet tegn på at dette Pokémon-senteret er litt annerledes, er at Nurse Joy lager medisin til Axew ved å røre sammen noen bær for hånd i en morter. Men det primitive utstyret virker, og Axew våkner igjen, full av ny energi.

Så dukker den mystiske personen med solbrillene opp igjen, og presenterer seg. Hun er en litt eldre Nurse Joy som nå sjekker Pokémon-sentre. Hun sier at akkurat dette Pokémon-senteret, hvor hun jobbet før, skulle vært stengt siden det ikke er noen Trenere på øya. Så beskylder hun den yngre Nurse Joy for å være en bedrager.

Den yngre Nurse Joy står og skjelver, og da ser våre helter noe rart: et syn som viser den eldre Nurse Joy for ti år siden, i det hun frakter en skadet Zorua inn på Pokémon-senteret. Hun forteller våre helter at hun slapp Zorua ut i skogen igjen etter at hun hadde behndlet den, men at den ofte vendte tilbake til Pokémon-senteret og hjalp henne med forskjellige ting. De to ble gode venner, men til slutt ble Pokémon-senteret stengt, og Zorua hadde sluttet å komme på besøk, så hun fikk aldri sagt fra om at hun måtte dra derfra.

Snart blir alt klart: den Nurse Joy som behandlet Axew, og hennes Audino-hjelper, er begge Zoroark i forkledning! Zoroark, som utviklet seg fra den Zorua som Nurse Joy reddet, har drevet Pokémon-senteret selv for å hjelpe alle de ville Pokémon som bor på øya. Nurse Joy bli så rørt at hun tilbyr seg å åpne Pokémon-senteret igjen, så hun og Zoroark kan hjelpe øyas Pokémon sammen. Og etter at våre helter har gjort en skikkelig rengjøring av huset, ser Pokémon-senteret så godt som nytt ut, og våre helter drar videre på nye eventyr.

Våre helter fortsetter reisen på Decolore-øyene, og de er nå kommet fram til Torom-øya, hvor de treffer ingen ringere enn Professor Oak! Han er kommet for å fange en Rotom som del av et forskningsprosjekt. Han skriver om den uvanlige Pokémon sine forskjellige formendringer, fremkalt av bestemte typer elektriske apparater. Mens han forteller Ash, Iris og Cilan om Rotom og alt den kan gjøre, blafrer lysene, og strømmen går. Nurse Joy forklarer at de Rotom tiltrekkes av den smakfulle elektrisiteten fra øyas strømforsyning, så strømbrudd ved lunsjtider er vanlig.

For å imøtekomme dette, har befolkningen laget en lekeplass til de Rotom, med masse forskjellige elektriske apparater. Siden dette vil være et lett sted å fange en Rotom, drar våre helter og Professor Oak dit. De får øye på tre Rotom som farer nedover kraftledningene, og Pikachu bruker Thunderbolt for å lokke dem til seg. Det ser ut til at de tre liker smaken av Pikachu sin elektrisitet, men når Cilan sin Stunfisk prøver å bli med, reagerer de med avsmak. Emolga sin elektrisitet derimot, blir godt likt, i hvert fall helt til de tre Rotom blir distrahert av elektrisitet som kommer fra et annet sted. Det er Team Rocket! De har avledet elektrisiteten fra kraftstasjonen og bruker den til å lokke til seg Rotom, og de klarer til og med å fange en. Men våre helter har en plan: de har Jord-type-Pokémon, som ikke reagerer på elektrisitet. Med hjelp fra Krookodile, Excadrill og Stunfisk, blåser de Team Rocket av sted igjen, og setter Rotom fri. Professor Oak merker at Rotom kaster gnister og ser skadet ut, så han skaffer litt medisin. Da blir Rotom så glad at når Professor Oak spør om den vil bli med ham for å hjelpe ham med forskningsprosjektet, hopper den rett inn i sin Poké Ball. Oppdrag utført!

Det er en nydelig dag på sjøen, og våre helter nyter den friske luften på dekk i det en Croconaw, en Azumarill og en Octillery sniker seg usett om bord. De tre bryter seg inn i skipets lagerrom for å stjele mat, og oppdager at Team Rocket er ute i samme ærend! Alarmen går, og Porter sier at dette bare kan bety èn ting..pirater!

Pikachu og Snivy drar for å undersøke, og oppdager tre naskende Pokémon i det de drar av gårde med tyvegodset. Skipets mannskap prøver å stanse dem, men de Pokémon har gjort dette mange ganger før, så de kommer seg unna, og får lasten om bord på flåten hvor Ducklett, det fjerde gjengmedlemmet, venter. De stikker av etter å ha kastet Team Rocket over bord.

Mens Meowth prøver å få tak i tyvegodset, får våre helter vite av Officer Jenny fra øy-politiet at gjengen med pirater har herjet på øyene i lang tid. Ash, Iris og Cilan tilbyr seg å hjelpe, og sammen drar de av gårde i politibåten til Officer Jenny for å lete etter gjemmestedet til tyvene.

Meowth har oppdaget gjemmestedet, men når piratene oppdager Meowth, angriper de, til tross for at Meowth ber om å få snakke om saken. Charizard oppdager gjemmestedet fra lufta, og leder politibåten dit. Officer Jenny vil arrestere dem, og Ash spør dem hvorfor de driver og stjeler. Med Meowth som oversetter, forteller de fire Pokémon sine triste historier om Trenere som har behandlet dem dårlig. På grunn av dette har de blitt slemme og begynt å stjele. De blir enige om å ta en kamp. Hvis piratene taper, skal de slutte å stjele. Og de taper.

Våre helter og Officer Jenny forbereder seg på å dra når det plutselig blåser opp! De legger merke til en gummibåt ute på bølgene med tre livredde Darumaka om bord! Sjøen er for tøff til at politibåten kan gå ut, men Croconaw får med seg gjengen, og alle fire svømmer ut og får dratt båten inn til land. Officer Jenny blir imponert over motet og tilbyr dem å bli medlemmer av Kystvakten, men først må de be om unnskyldning til alle de har stjålet fra. Og dermed ser fremtiden lys ut for eks-piratene, og våre helter setter igjen seil, og reiser videre til Kanto-regionen!

Våre helters cruise på Decolore-øyene fortsetter, og neste spennende stopp på reisen er Vandrer-øya. Det er et nydelig sted hvor alle typer Pokémon kommer for å hvile underveis i emigrasjonen. Etter råd fra Nurse Joy ved Pokémon-senteret, drar Ash, Iris og Cilan av gårde til fjellene for å titte på emigrantene.

De kommer akkurat i tide, så de får se en flokk Metapod utvikle seg til Butterfree og fly av gårde! Men etter at de Butterfree har flydd sin vei, kommer det en Caterpie ut av skogen. Det viser seg at den Caterpie ikke var klar til å utvikle seg ennå, og nå er den alene. Ash husker at den første Pokémon han fanget var en Caterpie, og bestemmer seg for å hjelpe den. Men det er ett problem: Caterpie er ikke interessert i så mye mer enn å sove.

Ash tenker at en fullt utviklet Bug-type kanskje kan hjelpe en annen Bug-type å utvikle seg, så han sender sin Leavanny ut for å kjempe mot den ville Caterpie! Men når Leavanny sin Energy Ball bråvekker Caterpie, løper den av gårde i panikk. Ash løper etter den, og ber om unnskyldning, og Caterpie bestemmer seg for å stole på ham. De klatrer i trær og leker i skogen hele dagen. Det er spesial-trening, men det er morsomt! Og Caterpie redder Ash med String Shot når han mister taket og faller.

Ash vet at Caterpie må spise mye for å kunne utvikle seg, så han drar av gårde for å samle Oran-bær til sin nye venn. Uheldigvis har de forvillet seg inn i territoriet til Ursaring, og den er ikke interessert i å dele sine Oran-bær med dem. Ash tar tak i Caterpie og løper, men når de ikke kommer lenger, bestemmer Caterpie seg for å ta en kamp. Det viser seg at den er god til å kjempe, der den driver den større Pokémon vekk, før den til slutt utvikler seg til Metapod!

Men de begynner å få dårlig tid. Iris har fått vite av Nurse Joy at enda en flokk Butterfree snart skal dra fra øya. Hvis Metapod vil bli med dem, må den utvikle seg igjen, og det fort!

Spesial-treningen øker i intensitet. Ash presser Metapod til sitt ytterste, med blant annet en løpetur som gjør at Cilan blir helt utslitt. Plutselig blir treningen avbrutt av en ny trussel som kommer ovenfra. Det er Team Rocket, som igjen er på plass for å stjele Pikachu, og tilfeldigvis får med seg Metapod samtidig!

Jessie, James og Meowth flyr av gårde i ballongen sin, men Ash hopper opp og klarer å gripe tak i kurven deres. Når James sin Amoonguss angriper Ash, utvikler Metapod seg til Butterfree akkurat i det Ash slipper taket. Butterfree tar tak i Ash og gir ham en trygg og myk landing. Så flyr han etter skurkene og sørger for at de blir blåst av sted igjen.

I det solen står opp, gjør alle Butterfree seg klare til å fly, og Ash må ta farvel med sin venn. Det er et sterkt øyeblikk, men Ash lover at de skal møtes igjen en dag, og Butterfree emigrerer sammen med de andre og starter et helt nytt liv!

Det som begynner som en nydelig dag på en av Decolore-øyene, Capacia-øya, utvikler seg til å bli ganske ille. I det våre helter begynner å gå på stien som krysser øya, bli Iris plutselig betatt av en eng full av nydelige blomster. Ash blir litt småirritert, men venter sammen med Cilan til hun har festet de nydelige blomstene i håret sitt. Plutselig ser våre helter en sjelden Pokémon, Dunsparce, og Ash kjenner at han er nødt til å ta en kamp og fange den. Men når Pikachu prøver å bruke Electro Ball for å stoppe Dunsparce i å bruke Screech (som får blomsten til å falle ut av håret til Iris, og Ash til uheldigvis å falle oppå den og knuse den) skumper Axew borti Pikachu, og den sky Dunsparce kommer seg unna. Ash skjønner at han har gjort en feil, men hendelsen har skapt dårlig stemning mellom Ash og Iris. Ash oppdager et frukt-tre og prøver å be om godt vær ved å gi frukt til Iris og Axew, men Iris får uheldigvis en som er råtten. Hun blir rasende, og en virkelig kamp utspiller seg mellom Iris og Ash. Hun drar av gårde. Hun er ferdig med ham! Men de må fortsatt følge den samme stien..

Etter hvert begynner begge to å angre. Etter en regnfull natt drar Pikachu og Scraggy av gårde på egenhånd for å finne Iris og Axew.

Samtidig venter Team Rocket langs stien med håp om å fange Pikachu. Og i det Pikachu og Scraggy passerer, fanger Team Rocket dem i nettet sitt. Men Ash og Cilan løper etter dem (etter at Cilan har overtalt Ash til å si unnskyld til Iris). Og akkurat i det det ser ut som om Team Rocket skal lykkes i å dra av gårde med Pikachu og Scraggy, høres ”Axew! Bruk Dragon Rage!” fra bak trærne, og Iris og Axew hopper fram og starter Team Rockets tilbaketrekning, som Ash og Pikachu fullfører.

Ash ber om unnskyldning for alt som har skjedd, og det gjør Iris også. De ler godt av alt sammen og blir enige om at Ash skal la Iris ta seg av frukt-plukkinga heretter.

Mens de fortsetter reisen rundt Decolore-øyene på vei mot Kanto-regionen, utforsker heltene våre en steinete, gold del av Rommesli-øya. Etter at de setter opp leir for natten, blir Pikachu og Axew vekket av den mytiske Pokémon Jirachi! Det blir sagt at Jirachi våkner hvert tusende år og da bare i syv dager. Når Pikachu og Axew leker med Jirach våkner de andre av bråket, og når Ash forstår hva han ser blir han opprømt og løper fram for å bli venner med den, noe som skremmer Jirachi bort. Neste morgen, mens Ash, Cilan og Iris snakker om at de så Jirachi, dukker en jente kalt Gemma opp og ber dem om å fortelle hvor den ble av. Det viser seg at hun desperat ønsker at Jirachi skal oppfylle ønsket hennes - å gi tilbake liv til fjellet hvor hun bor slik at det blir vakkert og grønt igjen. Senere, når de møter Gemmas mor, blir heltene våre fortalt at hennes mann har vært på en reise i nesten to år for å finne ut hvorfor fjellet har tørket opp og blitt så goldt. En av de mange grunnene til at Gemma er så desperat etter å få ønsket sitt oppfylt er sånn at faren kan komme hjem igjen! Det er bare syv dager før Jirachi går tilbake i dvale for nye tusen år, så Ash og vennene hans tilbyr seg å hjelpe Gemma med å finne den flyktige Pokémon og få ønsket hennes oppfylt. Den første gangen de finner den nærmer de seg for bort og den flykter igjen. Men de fortsetter letingen, dag etter dag - og de er ikke de eneste. Jessie, James og Meowth vil også ha kloa i den mytiske Pokémon! Endelig, på den syvende dagen, finner de Jirachi igjen og denne gangen holder Gemma seg rolig. Jirachi samtykker når hun ber om ønsket sitt, men så blir den fanget av Team Rocket! Men Gemmas mot, våre helters kampferdigheter og Jirachis fantastiske evner setter samlet Jirachi fri og sender Team Rocket avgårde igjen. Jirachi er utslitt og skadet etter hendelsene. Gemmas far ankommer og leder alle opp til Fjellets Helligdom, hvor Gemma har et nytt ønske. Hun vil bare at Jirachi skal ha det bra. Ønsket går i oppfyllelse og etter hvert som Jirachi får tilbake energien sin begynner vann på nytt å flomme fra innsiden av fjellet. Familien til Gemma er endelig sammen igjen og fjellet er i ferd med å helbredes. Jirachi går endelig tilbake til sin tusenårige dvale og heltene våre fortsetter reisen sin.

Når de nærmer seg havna på Rommesli-øya etter en lang reise over øya, ser heltene våre noe som ser ut som et stjerneskudd - inntil det spinner ut av kontroll og krasjer ned i havet. De undersøker avbrutte deler og Ash finner en amulettmynt, som er sagt å bringe hell og lykke til eieren. Spente og glade drar de tre vennene til Pokémonsenteret i byen for en god natts søvn før de skal tilbake til skipet. I mellomtiden undersøker Team Rocket også det uidentifiserte flyvende objektet. James finner sin egen amulettmynt, mens Meowth støter på en gruppe Beheeyem, som tar ham med ombord på skipet sitt hvor det prøver å rive løs amuletten i pannen hans! Beheeyem har også sporet opp Ash sin amulettmynt til Pokémonsenteret og lurer nå i skyggene utenfor... Neste morgen våkner Ash og oppdager at alle i byen plutselig ser ut som Beheeyem! Han løper for å finne hjelp men Jenny og Nurse Joy har blitt rammet av den samme, merkelige tilstanden. Faktisk er Jessie og James de eneste folkene han kan finne som ikke ser ut som Beheeyem. De tre avlegger en midlertidig våpenhvile for å prøve å finne ut hva som skjer. Jessie, James og Ash kommer over et møte på torget i byen, hvor en ekte Beheeyem kommanderer byens innbyggere til å lete etter noe som ser ut som den amulettmynten Ash fant. Når innbyggerne oppdager at de tre tyvlytter blir de tvunget til å finne et gjemmested, hvor de finner Meowth igjen og hører om den flyvende tallerkenen. Ash ønsker å konfrontere Beheeyem og få dem til å gjøre alle normale igjen, mens Team Rocket planlegger å stjele teknologien deres for sjefen... De sniker seg ombord i skipet hvor Beheeyem tar kontroll over Meowth slik at de kan snakke gjennom ham. De forklarer at skipet deres krasjet og mistet kraftforsyningen sin - som tilfeldigvis ser ut som Ash sin amulettmynt og som Meowth sin amulett. Ash tilbyr mynten han fant, men det er ikke den de leter etter. James bestemmer seg for at hvis "mynten" hans virkelig er kraftforsyningen til et romskip så må den være verdt mer enn han trodde, så han vil ikke gi den i fra seg - inntil en hjelpsom Thunderbolt fra Pikachu blåser skurkene avsted igjen og kraftforsyningen lander i hendene til Ash. Ash gir tilbake den manglende delen til Beheeyem, som reparerer skipet sitt, slippet taket på byens innbyggere og flyr avsted. Han møter Iris og Cilan, som ikke aner hva som har skjedd...men det er ok fordi de er klare til å fortsette reisen!

Heltene våre har ankommet Avlingsøya, berømt for sine deilig bær og den Store Avlingsfestivalen. Ash, Iris og Cilan drar for å se på festival og støter på en Pokémon de aldri har sett før - en som Ash sin Pokédex ikke kan identifisere! Ash vil fange den, selvsagt, men når han utfordrer den til en kamp gir den ham et elektrisk støt som sender ham i bakken, og Treneren dens løper fram for å beklage. Hun introduserer seg som Alexa, en Pokémonjournalist fra Kalos-regionen langt borte. Sammen medsine Pokémon, Helioptile og Gogoat, reiser hun verden rundt på grunn av jobben. Hun skriver om og fotograferer Pokémon i sine naturlige omgivelser. Helioptile, som slo Ash til bakken, hjelper henne med å lade utstyret hennes og Gogoat bærer utstyret i salveskene sine - og husker hvor ting ligger, noe Alexa ikke er flink til! Alexa har kommet til øya for å skrive om Pokémonsumo-konkurransen på festivalen, så de bestemmer seg for å dra dit sammen. På veien forteller hun heltene våre legenden rundt konkurransen: For lenge siden sto øya i fare for å bli gold og øde fordi folk og Pokémon hadde høstet inn nesten alle bærene. Øyas to sterkeste Pokémon kjempet mot hverandre over det siste bæret uten at noen dem vant, og ting så ille ut...men en liten gutt plukket opp bæret og delte det i to og tilbød en halvdel til hver av de to Pokémon og fortalte dem at de måtte dele. Øya kom seg igjen og i dag hedrer Pokémonsumo-konkurransen den store kampen. Ash, Iris og Cilan bestemmer seg for å bli med i konkurransen, og mens de venter på at den skal begynne støter Ash på en frekk gutt som heter Rodney, som skyver ham overende ved en bod som selger paier. Det viser seg at Rodney også er med i konkurransen - med sin enorme Golurk, som gjør kort prosess på alle sine konkurrenter! Men Ash og Pignite er besluttsomme og Rodney begynner gradvis å vise respekt for deres utholdenhet. Til slutt, med bruk av smart manøvrering, klarer Pignite å få Golurk ut av balanse og kaster den til bakken. Ash vant! Rodney er skuffet, men Ash tilbyr å dele et bær med ham, som et ekko fra den gamle legenden. Det er nok bær til å mette alle på festivalen og alle er glade sammen. Etterpå drar heltene våre til skipet igjen, og oppdager at Alexa skal til Kanto-regionen for å jobbe på sin neste artikkel, så hun vil reise sammen med dem!

Nå som heltene våre har begynt å reise sammen med Alexa, er de spente på den neste øya på turen: Storbladøya. Når Alexa viser dem et mystisk skattekart som er knyttet til øya blir alle veldig spente ved tanken på en skattejakt! Alexa har tidligere skrevet en artikkel om en utstilling om en pirat, skipet hans, de Pokémon som reiste med ham (Shiftry, Nidoking, Mismagius, Honchkrow og Vulpix) og den ukjente skatten i skipet hans. Kartet har en rekke rare symboler som må inneholde nøkkelen til å finne skatten! Jessie, James og Meowth har tyvlyttet på våre helters samtale og selvsagt vil de ha skatten for seg selv. Så hvis de tålmodig venter til Dustene finner skatten kan se bare stjele den - og Pikachu også, selvsagt... Alexa, Ash, Iris og Cilan reiser med båt til en liten, øde øy i nærheten. Etter at de såvidt unnslipper en malstrøm finner de et skjult innløp som leder dem forbi noen høye klipper, og tre Honchkrow holder nøye øye med dem. Der, råtnende på en strand, ligger et veldig gammelt sjøsøverskip! Men Team Rocket har fulgt etter dem i en pedal-drevet undervannsbåt, og når skurkene tar til overflaten for fort, kjører de rett inn i det gamle skipet ved et uhell og det sklir tilbake i dypet. Ash er redd for at skatten gikk ned med skipet, så han blir lettet når Alexa ser en dør dekket av symboler som ligner på de på skattekartet! Cilan skjønner at det er et puslespill hvor man må skyve rundt på blokkene og begynner å flytte symbolene rundt slik at de stemmer med kartet. Når han er ferdig åpner døren seg plutselig og bak den ligger en trapp. Helt sikre på at trappen leder til skatten begynner heltene våre turen oppover trinnene, uvitende om at Team Rocket allerede ligger et steg foran dem... På toppen av trappene oppdager Ash og de andre en tett skog, hvor de blir angrepet av to Mismagius! Etter at Snivy og Charizard nedkjemper dem, møter grippen på tre redde Eevee som blir jaget av en Nidoking! Pikachu og Axew forsvarer Eevee, og Nidoking beslutter at de ikke er verdt alle problemene. De tre Eevee blir med heltene våre og Alexa opp til toppen av fjellet, hvor en stjerne på kartet til Alexa indikerer at skatten ligger. På veien blir de angrepet igjen, denne gang av tre Shiftry. Alexa begynner å sette sammen bitene og skjønner at de Pokémon som har angrepet dem passer med historien om piraten og mannskapet hans! Men de har enda ikke sett en Vulpix... På fjelltoppen finner de fire Pokémonstatuer og en tom pillar. Og såangriper den siste Pokémon - det er en Nintales som må ha utviklet seg fra den Vulpix de har lett etter! Etter at de driver bort Ninetales oppdager de en femte statue og den hemmelige inngangen ved foten av den. Jessie, James og Meowth viser seg endelig og vil kjempe mot heltene våre for skatten - men deres Pokémon er utslitt etter å ha kjempet fra øyas Pokémon, og de blir raskt blåst avgårde uten noe. Som antatt er det en skattekiste inne i den siste statuen og den inneholder en utrolig mengde Utviklingssteiner! Disse steinene har blitt brukt av øyas Pokémon over årenes løp, og nå også, for når de tre Eevee ser skatten tar de hver sin stein og utvikler seg til Jolteon, Flareon og Vaporeon der og da. Våre helter og Alexa skjønner da at de Pokémon som angrep dem beskyttet denne skatten. Med det i minne bestemmer Alexa seg for å slette alle opptakene sine av dette eventyret og alle er enige om å holde øya hemmelig, til gode for de Pokémon som bor der. De drar tilbake til skipet og fortsetter reisen mot Decolore-øyene og videre mot Kanto-regionen!

Heltene våre gjør seg klare til stjernekikking - Alexa har fortalt dem om Conleykometen, som etter sigende skal bli synlig i kveld! Hun er spent på å filme denne himmelske hendelsen og en spesiell gruppe Pokémon som alltid samler seg på fjelltoppen for å se kometen nærme seg. Ash, Iris og Cilan vil vite mer, så Alexa viser dem hele historien i en gammel bok. For lenge, lenge siden roet en Trener kalt Conley ned en gruppe angripende Pokémon og ble venn med dem. Dermed reddet han øya og ble en helt i sammen slengen. Øyboerne bygget en imponerende kamparena på fjelltoppen til hans ære, og mens Ash og vennene hans planlegger å se den kommer en mystisk kvinne med en krone opp til dem. Hun bekrefter at de skal opp på fjellet, og så gir hun Ash en medalje og sier at den vil bli nyttig. Imens forkler Jessie, James og Meowth seg som spøkelsestype-Pokémon som bor i området, og planlegger å følge etter heltene våre for å stjele Pikachu! Inne i ruinene av kamparenaen, finner Ash og de andre en stor statue av Conley, men blir rast distrahert av Team Rocket i forkledning som hopper fram for å skremme dem! Alexa sin Helioptile, som har vært nervøs hele turen, reagerer med en kraftig elektrisk støt. James blir truffet og snubler inn i statuen og velter den. Den lander på Jessie, som blir sint og kaster den til side. De tre skurkene kaster forkledningen - bare for å finne seg selv flytende i luften. Flere Gengar og Banette kommer fram fra ruinene. De bruker Psychic for å holde Team Rocket unna statuen av helten deres. Når de sinte Pokémon går etter Ash og de andre, tar Alexa fram sin Noivern (en imponerende Pokémon fra Kalos-regionen) for å kjempe mot dem, noe som gir alle en mulighet til å unnslippe! Spøkelsestypene gir ikke opp så lett, og jakten fortsetter unntil en Shadow Ball sender Ash i bakken. Medaljen han fikk av den mystiske kvinnen faller ut av lommen hans og Pokémon blir umiddelbart interessert, de samler seg rundt symbolet og snakker opprømt. Meowth hører etter slik at han kan oversette. Det viser seg at medaljen faktisk tilhørte Conley, noe som markerer at Ash og de andre er venner og ikke fiender. Cilan skjønner at disse Pokémon er de samme som Conley en gang ble venn med! Og så snart statuen av Conley er satt tilbake på plass, blir spøkelsestypene veldig glade. (Selvsagt kan ikke Team Rocket gi seg der og de prøver å ta Pikachu selv etter at heltene våre hjalp dem å unnslippe...men Pokémon sender dem blåsende avgårde igjen.) Natten har falt på og den blendende lyse og nydelige Conleykometen viser seg endelig! Spøkelsestype-Pokémon begynner en gledesdans og den mystiske kvinnen som ga Ash medaljen dukker opp igjen fra ruinene. Hun forklarer at Pokémon danser for å feire sin gamle helt, og indentifiserer seg kun som "den som kjenner fortiden og gir den videre til framtiden". Alexa begynner å filme når Ash, Iris og Cilan blir med i feiringen også! Neste morgen prøver Alexa å spille av opptaket sitt, men finner ut at det ikke er noe annet enn støy på skjermen. Medaljen til Ash er borte også. Alexa husker at medaljen så kjent ut og ser gjennom boken sin for å lete etter den. Og hun finner den, sammen med et gammelt bilde av den mystiske kvinnen ved siden av Conley! Kan kvinnen ha kommet til dem fra fortiden?

Mens de tilbringer litt tid på et Pokémon-senter på en øy på vei til Kanto-regionen, tar heltene våre et øyeblikks pause mens Alexa jobber litt med en kommende artikkel. Hun ber dem se etter Gogoat, en meget veloppdragen Pokémon som ikke trenger mye tilsyn. Så Ash og de andre følger ikke med når Gogoat møter en liten gutt som heter Tony, føler at han vil dra et sted og uten videre reise avgårde med gutten på ryggen! Selvsagt informerer heltene våre Alexa så fort de oppdager at Gogoat er forsvunnet og løper for å finne politibetjent Jenny for å be om hjelp. Hun snakker allerede med Tonys mor, som sier at Tony ville besøke observatoriet på toppen av fjellet hvor faren hans jobber og levere en spesiell bursdagspresang. Alexa tror at Gogoat har sanset Tonys ønske og bestemt seg for å ta ham med dit selv. Men det kan være farlig i fjellet, så heltene våre drar avgårde for å sørge for at Tony er ok, og deler seg opp for å utforske de to stiene som leder til observatoriet. Ash og Alexa tar raskt igjen den forsvunne gutten og ber ham komme tilbake til byen, men Tony er fast bestemt på å komme seg til observatoriet, så de bestemmer seg for å dra sammen med ham. Til slutt når de toppen og Tonys far er lettet for å se ham og blir veldig glad for gaven sin: en tegning av favoritt-stjernebildet hans, Braviary. Etter å ha sett litt på stjernene er Alexa og heltene våre klare til å fortsette reisen sin!

Mens Alexa får videokameraet sitt reparert tar Ash, Iris og Cilan litt fri for å ha en avslappende lunsj på land. Det er iallefall planen, men deres Pokémon havner stadig i krangler over maten, og Emolga slipper løs sitt Discharge-angrep mot alle som irriterer den, og får kjeft av Iris. Etter lunsj ser Iris at Emolga og Axew leker sammen og ber Emolga passe på Axew for henne. Men når hun har ryggen til forstyrrer Axew en Galvantula og får el-sjokk! Emolga prøver å hjelpe men løper på Axew ved et uhell og Axew ender opp med en stygg kul i hodet. Når Iris ser kulen og restene av elektrisiteten fra angrepet til Galvantula, skylder hun på Emolga som flyr avsted, sinna... ...bare for å lande midt oppi strategimøtet til Team Rocket! Etter en brå kamp hvor Emolga nedkjemper Woobat og Yamask, så Frillish og Amoonguss, alt uten å begynne å svette en gang, bruker Jessie en ny strategi og inviterer Emogla til å bli med i Team Rocket! Nå begynner Iris å bekymre seg for hva som har skjedd med Emolga, og heltene våre begynner å lete. De finner Emolga sammen med Jessie, James og Meowth, og skurkene får tak i Axew også! Men plutselig dukker en Exploud opp og Team Rocket kommer seg unna! Heltene våre må finne Team Rocket og finne ut hva det er som skjer, så Charizard og Dragonite drar for å lete etter skurkene. Snart utspinner en voldsom kamp seg, og selvom Meowth overhører Emolgas plan - den bare later som sånn at den kan ta igjen på Iris for den tidligere misforståelsen - så har Team Rocket enda den sinte Exploud å bruke! Flere kamper tar til, men Team Rocket, sammen med Exploud, blir blåst avsted igjen! Hele denne tiden har Axew prøvd å få Iris til å forstå hva som egentlig skjedde med Galvantula, og når hun endelig fokuserer så oppdager hun at hun kan forstå hva Axew tenker! Iris forstår at hun har gjort en kjempetabbe ved å anklage Emolga for noe den ikke har gjort. Etter at hun ber om unnskyldning er alt tilgitt og livet går tilbake til normalt. Cilan spekulerer til og med i at Iris sine ferdigheter i å forstå Axews tanker kan være neste steg på hennes vei mot å bli en dragemester!

Når heltene våre ankommer Paladin-øya blir Cilan overrasket av å finne ut at brødrene hans, Chili og Cress, også er på vei til øya. Mens Ash, Iris og Cilan venter på at de skal komme, nærmer en Abomasnow seg. Cilan sin Pansage tilbyr noen av bærene sine til den enorme Pokémon og den svarer med å angripe! Treneren dens, en arrogant kvinne ved navn Morana, kjefter på heltene våre for åha kommet for nærme hennes Abomasnow, og det viser seg at hun er grunnen til at Chili og Cress kommer til øya.

De forteller Cilan at Morana utfordret dem på Striaton Gym med en uvanlig forespørsel: hvis hun vant ville hun at de skulle gi henne hele gymmen! Chilis temperament tok overhånd og han gikk med på utfordringen. Kampene gikk ikke bra for brødrene - Moranas Mamoswine overvant en type-ulempe og vant over Chilis Pansear, og så vant hennes Glalie over Cress sin Panpour like etterpå. Nå er hun her for å utfordre Cilan, den tredje gymleder-broren for å fullføre seieren sin og kreve Striaton Gym som sitt eget!

Iris anbefaler Cilan å bruke Crustle i kampen, siden den er sterkest mot is-typene som Morana ser ut til å like best. Men han er fast bestemt på å forsvare gymmen sin med sin kjæreste partner, Pansage, og for å rettferdiggjøre den beslutningen legger han ut om deres historie sammen, inkludert deres reise sammen med Ash og Iris. Og snart er det kamptid!

Morana sender sin Abomasnow, som forventet, og selvsagt har Cilan Pansage. Etter et par angrep tilbyr Cilan en kritisk vurdering av Moranas partnerskap med hennes Abomasnow - det mangler varme og omsorg, så de to er ikke så effektive som team som de kunne vært. Han snakker om hvor viktig det er for en trener å forenes med hjertet til sin Pokémon, slik han og Pansage har gjort. Morana er ikke interessert i en slik forening, hun vil bare vinne, og hun avbryter talen hans med et grusomt angrep som fryser PAnsage til is! Men solens stråler - og stemmen til Cilan - an fremdeles nå Pansage gjennom isen, og den bryter seg løs med en kraftig SolarBeam. Morana er for sjokkert til å reagere, og Pansage sitt neste trekk gjør Abomasnow ute av stand til å fortsette og kjempe. Cilan har vunnet og Striaton-brødrene får beholde gymmen sin!

Når Chili og Cress gjør seg klar til å dra tilbake til Unova, lurer Cilan på om han skal bli med dem og gå tilbake til å være en gymleder. Men brødrene hans forsikrer ham om at alt vil gå bra. Så lenge Cilan liker reisen sin, vil de at han skal fortsette å reise med Ash og Iris. Og det er nettopp det som skjer når reisen deres mot Kanto-regionen fortsetter!

Når heltene våre og Alexa avslutter reisen sin gjennom Decolore-øyene se de flere lokale Pokémon fra Kanto-regionen. Porter sier at det er et sikkert tegn på at det siste stoppet, Vermilion City, er nær! Alle har planer for Kanto: Ash gleder seg til å komme hjem, Iris og Cilan vil se Pokémon som er nye for dem og Alexa har planer om å intervjue Professor Oak. Selvsagt ligger Team Rocket hakk i hel, og skurkene har sine egne planer - å endelig fange Pikachu! Fra Basculin-ubåten sin prøver de å stoppe cruiseskipet ved å snore opp propellene, og når det ikke virker klarer de det ved å løfte skipet opp fra havoverflaten med gigantiske ballonger! Passasjerene får panikk og i forvirringen klarer Team Rocket å fange Pikachu, Axew og en imponerende mengde Pokéballer fra heltene våre og de andre passasjerene! Fanget i lasterommet prøver Ash, Iris og Cilan flere ganger å rømme før de endelig får det til og de angriper Team Rocket med hevnlyst! Det tar ikke lang tid før den håpløse trioen blir overmannet, og alle Pokémon blir returnert mens skipet glir ned til et trygt og mykt plask. Alexa har jobbet i lugaren og hatt høretelefoner på så hun aner ikke hva som har skjedd, men når hun finner det ut vil hun skrive en artikkel om det! Decolore Queen legger endelig til kai i Vermilion City og Iris og Cilan klare ikke å holde inne gleden og spenningen - de vil dra videre på neste steg av reisen sin umiddelbart! Iris vil dra til Blackthorn City for å trene med Gym-leder Clair og Cilan planlegger å delta i en fiskekonkurranse i Hoenn-regionen. Ash og Alexa drar til togstasjonen for å si farvel, og når de vinker hadet er det et bittersøtt øyeblikk for Ash når han tenker tilbake på alleeventyrene de har hatt sammen. Men etter en lang reise er han nesten hjemme, og tiden er inne for Ash og Alexa å dra til Pallet Town!

Etter å ha sagt farvel til Iris og Cilan på togstasjonen, drar Ash, Pikachu og Alexa til Ash sitt hjem i Pallet Town! Selvsagt kan ikke Ash vente å se sine Pokémon på laboratoriet til Professor Oak, men et fornuftig råd fra Alexa overtaler helten vår om at første stop burde være å hilse på moren sin hjemme. Det besøket tar ikke lang tid - etter at Ash har oppdater moren sin om sine siste eventyr, vet hun at han ikke lenger kan vente med å se sine Pokémon og sier at han kan gå til labben til professor Oak, hvor Alexa er i gang med å intervjue professoren. Etter å ha takket sine Unova Pokémon (sammen med Pikachu og Charizard) for alt det gode arbeidet de gjorde opp mot og under Unova League, ber Ash Alexa om å introdusere professor Oak til hennes Pokémon: Helioptile, Gogoat og til slutt den mektige Noivern! Helt opp i synet har alltid vært en favorittmåte for professor Oak å forske, og med et mektig Boomburst fra Noivern, får han viljen sin! Ash er full av spørsmål om Kalos-regionen, og Alexa kan knapt holde følge med dem. Men alle skjønner at spenningen rundt Kalos bygger seg opp i helten vår, og før kvelden er omme annonserer Ash at han skal dra til Kalos sammen med Pikachu og Alexa allerede neste morgen. Dette overrasker ikke moren hans det monsye, selv om hun er lei seg for at han drar. Etter en hvileløs natt, altfor spent på den neste reisen til å sove, takker Ash sin mor for alt og byr henne og professor Oak farvel. Og med løfter om å gjøre sitt aller beste, reiser Ash, Pikachu og Alexa mot Kalos-regionen, og uante nye eventyr!