Ezra, Sabine, Zeb, Chopper e Hera sono reclutati per salvare Hondo Ohnaka dalla prigione, durante la fuga Ezra uccide gli Stormtrooper di guardia: più tardi durante una ricognizione viene scoperta una stazione imperiale. Kanan si rende conto che la Forza gli sta dando delle abilità che compensano la perdita della sua vista. Avvertendo la sensazione che Ezra è in pericolo, Kanan si reca in suo soccorso. Nel frattempo una nuova minaccia si fa avanti, il Grand'ammiraglio Thrawn che vuole distruggere tutta la resistenza.

Quando Maul prende l'equipaggio dello Spettro in ostaggio, Ezra e Kanan devono passare una prova al fine di recuperare l’antico artefatto Sith, trovato su Malachor, per salvarli.

Sabine va sotto copertura come cadetto alla Skystrike Academy su Montross per aiutare diversi giovani piloti, che vogliono disertare e unirsi alla ribellione, a evadere.

Durante una missione Hera salva suo padre, poi torna a casa per recuperare un preziosissimo cimelio di famiglia ma la presenza delle forze imperiali metta a rischio il tentativo di Hera e la sicurezza sua e di Ezra.

In una missione di salvataggio, guidata dal capitano Rex, l'equipaggio de Lo Spettro viene catturato da un gruppo di vecchi droidi da combattimento determinato a combattere "l’ultima battaglia" per terminare le Guerre dei Cloni.

Dopo aver perso i contattati con i ribelli da Concord Dawn Sabine, Ezra e Fenn Rau decidono di indagare e ben presto si rendono conto che i Mandaloriani imperiali hanno preso il sopravvento e controllano la stazione.

Ezra e Sabine cercano di far ragionare un equipaggio di giovani piloti che hanno ottenuto numerose vittorie nelle battaglie contro l’Impero ma stanno stupidamente rischiando le loro vite per la troppa sicurezza nei propri mezzi.

I Ribelli uniscono le forze con alcuni pirati senza scrupoli per salvare una nave da carico piena di armi che farebbero molto comodo alla ribellione. Tuttavia, la missione finisce per essere molto più pericolosa del previsto.

Ezra e Kanan s’infiltrano nella fabbrica imperiale di Lothal per ottenere informazioni su una nuova arma imperiale, ma, dopo essere stati scoperti, devono fidarsi di un improbabile alleato per fuggire dall’edificio.

Perseguitato dalle visioni di Maul, Ezra decide di viaggiare attraverso la galassia. Una volta arrivato a destinazione, deve partecipare a uno strano rituale per recidere il suo legame con Maul.

Dopo aver trovato un superstite della squadra ribelle mancante, i membri dell’equipaggio dello Spettro scoprono un'altra sorpresa su Geonosis e devono impegnarsi per nasconderlo dalle forze imperiali.

Dopo aver trovato un membro della squadra ribelle mancante, l'equipaggio dello Spettro scende nelle gallerie per cercare di scoprire il motivo per cui l’impero ha sterminato la popolazione Geonosiana.

Chopper e Zeb trovano un droide danneggiato nel deserto dell'Atollon. Quando tornano alla base scopro che si tratta di una nuova sonda imperiale programmata per spiare e distruggere i ribelli.

Per aiutare a reclutare la sua gente per unirsi ai ribelli, Sabine accetta, con riluttanza, di imparare a gestire e utilizzare un’antica arma Mandaloriana, una volta iniziati gli allenamenti trova la sfida più difficile del previsto.

Sabine torna a casa con Kanan ed Ezra, con la speranza che la sua famiglia accetti di aiutare la ribellione ma si ritrova coinvolta nella lotta di potere della sua famiglia per il controllo di Mandalore.

Ezra e il resto dei ribelli temono che l’Impero possa a breve scoprire l’identità di una spia ribelle e organizzano un piano per salvarlo prima che venga catturato.

Hera, Zeb ed Ezra sono incaricati di trasportare un leader della ribellione, la senatrice Mon Mothma, attraverso la galassia, durante il viaggio sono attaccati dai TIE Defender, i nuovi modelli di Caccia dell’impero.

Chopper e AP-5 s’infiltrano in una stazione imperiale per rubare alcuni file necessari alla causa dei Ribelli, ma uno specialista imperiale riprogramma i droidi che si rivoltano contro l'equipaggio causando il caos.

Ezra ha una visione di Maul che si troverebbe su Tatooine alla ricerca di Obi-Wan, Ezra decide di mettersi in viaggio verso il remoto pianeta nella speranza di fermare i piani dell'ex Sith.

I Ribelli fanno gli ultimi preparativi prima dell’attacco a Lothal, i piani dello Squadrone Phoenix sono interrotti quando il Grand’Ammiraglio Thrawn scopre la loro posizione.

Hera e Kanan lottano per mantenere viva la squadriglia mentre sono intrappolati su Atollon con la base ribelle sotto assedio. Ezra cerca di rompere il blocco grazie ad un aiuto inaspettato.