Ahsoka manda l'equipaggio dei ribelli in cerca del il capitano Rex, un eroe di guerra che Ahsoka vuole trovare e reclutare per la loro causa. Il capitano Rex si considera troppo vecchio per combattere e la missione è a rischio.

Ezra e l'equipaggio cominciano a stringere amicizia con il Capitano Rex e i suoi uomini, questo li spinge a lavorare insieme per respingere un attacco da parte dell'agente Kallus.

Ezra, Sabine, Zeb e Chopper viaggiano verso una stazione medica abbandonata per recuperare le forniture mediche di cui hanno bisogno, ma sono interrotti dall'arrivo degli Inquisitori.

Ezra e Chopper prendono il Phantom per rispondere ad una richiesta di soccorso da parte di un nave di un gruppo di contrabbandieri, qui Ezra è tentato di unirsi all’equipaggio del pirata Hondo Ohnaka.

Hera deve portare a termine una missione importante, acquistare una nuova nave, la B-Wing, che può contribuire a rompere un blocco imposto dall’Impero e cambiare le sorti delle battaglia.

Sabrine deve scortare ad un punto d’incontro un corriere che ha delle informazioni vitali per la causa dei ribelli, durante il viaggio deve affrontare una vecchia amica dei tempi dell’accademia.

Ezra e Kanan vengono inviati ad indagare sui rapimenti dei neonati da parte dagli Inquisitori, qui scoprono che gli questi ultimi sono alla ricerca di bambini sensibili alla Forza.

L'Impero attacca la flotta dei ribelli su Garel, Kanan e Ezra tornano a Lothal alla ricerca di un ex prigioniero che potrebbe avere informazioni importanti sul destino dei genitori di Ezra.

Una collaboratrice di Bail Organa viene inviata a Lothal per consegnare delle navi alla flotta ribelle, ma un blocco imperiale costringe i ribelli a creare un diversivo per liberare le tre astronavi.

I ribelli, mentre sono alla ricerca di nuove rotte iperspaziali a causa della pressione imperiale, trovano una scorciatoia, ma per usarla devono ottenere il permesso dal leader del sistema più vicino.

Zeb ed il resto dell’equipaggio scoprono due sopravvissuti Lasat, l’incontro costringe Zeb a venire a patti con il suo passato e aiutare la sua gente a raggiungere la loro nuova casa,il pianeta promesso.

L'equipaggio va in missione per recuperare del carburante utile per la flotta dei ribelli e finiscono per proteggere i Purrgill dai Rodiani che minacciano le loro vite.

I ribelli volano a Ryloth per aiutare un combattente per la libertà a rubare un vettore imperiale che viene utilizzato per bombardare il suo pianeta.

Dopo un agguato imperiale andato male Zeb e l'agente Kallus si ritrovano su un pianeta isolato ghiacciato, i due devono collaborare per tentare di sopravvivere.

Kanan, Ezra, e Ahsoka ritornano al Tempio degli Jedi su Lothal in cerca di risposte da Yoda e scoprire come gli inquisitori siamo sempre stati in grado di monitorare i ribelli.

Chopper prova ad acquistare una nuova gamba, quando i suoi tentativi non vanno a a buon fine decide di rubarne una, nella fuga finisce in su una nave imperiale, dove fa amicizia con un droide imperiale.

Kanan, Ezra e Ahsoka si preparano a partire e svelare il segreto di Vader, mentre i ribelli devono trovare un modo per respingere le creature predatrici che occupano il pianeta.

Kanan, Ezra e Ahsoka cercano di ottenere informazioni sul Sith per combattere gli Inquisitori con l'aiuto di un nuovo alleato, ma con l’arrivo di Vader si trovano in inferiorità numerica. Per sconfiggere gli inquisitori Ezra accetta l’aiuto di Maul, nonostante i dubbi di Kanan e Ahsoka. Maul tradisce il gruppo e acceca Kanan. Darth Vader combatte con Ahsoka mentre il Tempio collassa. Ahsoka vede il vero volto di Darth Vader.