Der Serienkiller Red John scheint Jane immer einen Schritt voraus zu sein. So kennt er bereits die Namen der sieben Verdächtigen, die Patrick Jane für Red John hält. Weder Lisbon noch er können sich erklären, wie er an diese brisante Information gekommen ist. Das CBI muss den Mord an Sandra Helvig aufklären, die von ihrem Freund, dem Baseballspieler Cody Benbow tot in der Wohnung aufgefunden wurde. Doch parallel kümmern sie sich weiter um Red John…

Nachts explodiert auf der Churchill Road in Sacramento ein Wagen: Der Fahrer, Titus Stone, der bei einer Drohnen-Entwicklungsfirma arbeitete, ist bis zur Unkenntlichkeit verbrannt. Nachforschungen bringen zutage, dass sein Tod mit dem Projekt „Redbird“, an dem er mit seinen Chefs Kris Makenna und Elliott Winston beteiligt war, zu tun haben muss. Bei einem Einsatz in Afghanistan verfehlte eine Drohne ihr militärisches Ziel, traf ein Wohnhaus und tötete viele Menschen.

Das Team wird zu einer Hochzeitgesellschaft gerufen, bei der es einen Mord gab. Jane vermutet den Täter unter den Gästen. Bald kristallisiert sich heraus, dass es wohl eigentlich um den Diebstahl einer sehr wertvollen Bibel ging. So muss die Braut trotz allem vor den Altar treten, und auf der anschließenden Hochzeitsfeier verrät sich der Täter auch prompt. Bei dem Versuch zu fliehen, kommt es zu einer wilden Schießerei…

Eine gefakte Liste mit Männern, die Red John-Verdächtige sind, wurde aus dem Büro von Patrick Jane gestohlen. Kurz darauf ist Benjamin Marx tot – er stand auf der. Lisbon befürchtet nun, dass die anderen Männer dieser Liste auch ermordet werden sollen und ordnet für sie Polizeischutz an. Ein gewisser Haibach, der diesen Schutz ablehnt, wird entführt. Als Patrick Jane auf eigene Faust weiterermittelt, wird auch er das Opfer einer Entführung.

Der Mitinhaber eines Sportstudios, Chad Parkman, wird sterbend mit einer Stichwunde in seinem Hotelzimmer aufgefunden, nachdem der Sicherheitschef des Hotels Kämpfe gehört und die Tür aufgebrochen hat. Vom Mörder fehlt jedoch jede Spur! Er kann weder durchs Fenster noch durch Tür entkommen sein. Da Parkman Mitglied der Visualize-Sekte des Sektenführers Bred Stiles war, ermittelt Patrick Jane zunächst in diese Richtung. Doch dann taucht ein weiterer Toter in einem Auto auf…

Die von Red John ermordete Kira Tinsley hat Patrick Jane kurz vor ihrem Tod anvertraut, dass Red John eine Tätowierung hat: drei Punkte auf seiner Schulter. Patrick Jane will alle verbliebenen Red-John-Verdächtigen zu einem gemeinsamen Treffen überreden, bei dem er herausfinden will, wer die Tätowierung trägt. Das Treffen gelingt, doch als Patrick sie mit vorgehaltener Waffe zwingt, ihre Schultern zu entblößen, erlebt er eine Überraschung…

Lisbon findet den bewusstlosen Patrick Jane nach einer Explosion auf, nachdem er die letzten fünf Red-John-Verdächtigen zur Rede gestellt hatte. Drei Verdächtige sind tot; der zwielichtige FBI-Agent Reede Smith hat die Explosion überlebt und kann entkommen, ebenso der CBI-Direktor Bertram. Immerhin hat sich bestätigt, was Patrick Jane bereits geahnt hat: Alle Verdächtigen gehören einer Geheimorganisation an, deren Mitgliedausweis ein Tattoo mit drei Punkten auf dem Oberarm ist.

Das CBI unter Lisbons Leitung wird vom FBI geschlossen. Daraufhin macht sich Patrick Jane eigenständig auf die Suche nach dem Serienmörder Red John. Hinter dem Spitznamen vermutet man den ehemaligen CBI-Chef Bertram, der zur Fahndung ausgeschrieben ist. Dieser kontaktiert Patrick und vereinbart ein Treffen mit ihm auf dem Friedhof. Der Ermittler muss sich vorsehen. Sein Date hat mörderische Absichten…

Zwei Jahre ist es her, dass Patrick Jane den Mörder seiner Familie umbrachte. Auf einer mexikanischen Insel scheint er in Sicherheit vor den Recherchen des FBI-Agenten Abbott zu sein. Doch dann verliebt sich Patrick in die schöne Touristin Kim Fischer – er kann nicht wissen, dass auch sie für den FBI arbeitet. Letztendlich lässt er sich zurück in die USA locken. Schnappt die Falle zu?

Patrick Jane wird vom FBI gefangen gehalten, weil er sich einer Zusammenarbeit verweigert. Doch seine ehemalige (und mittlerweile in die Bedeutungslosigkeit verbannte) Chefin Teresa Lisbon kann ihn doch umstimmen, zumindest in einem Fall mit dem FBI zu kooperieren: Das gesamte amerikanische Finanzsystem ist gefährdet, nachdem Abel Schneidermann entführt wurde – der Kopf des Teams, das den Quellcode zum Schutz des US-Bankensystems entwarf.

Jane ist nun offizieller Berater des FBI. Agent Fischer hat gleich einen neuen Fall, wo sie Patricks Unterstützung gebrauchen könnte: Ein DEA Büro wurde überfallen und sechs Agenten getötet. Der einzig überlebende FBI Agent vermutet, dass es sich bei dem Attentäter um ein Mitglied des gefürchteten Drogenrings handelt, dem sie schon seit längerem auf der Spur sind. Das FBI hofft nun, das es Patrick gelingt die Identität des Drogenbosses zu entlarven und damit der ganze Schmuggelring ausgehoben werden kann.

Jane und das FBI sollen den Mord an Charles Whitaker, einem High-Tech-Kartographen, untersuchen. Whitaker hat für das Pentagon als Berater gearbeitet. Offenbar ist er an einer tödlichen Dosis eines Drogencocktails gestorben. In Whitakers Haus entdeckt Jane eine geheime Nachricht, die daraufhin deutet, dass das Opfer kurz vor seinen Tod einem geheimen Spionenagering auf der Spur war. Inzwischen entdeckt Lisbon, das ehemalige CBI Agenten verfolgt und teilweise getötet werden.

Nahe der amerikanischen Grenze in der Stadt Juárez wird die Leiche einer äußerst engagierten Pflichtverteidigerin, Edith Ferlok, gefunden. Weder die mexikanische, noch die amerikanische Polizei kann sich erklären, wie die Leiche auf mexikanischen Boden gelangen konnte, da ein Grenzübergang der Anwältin nirgendwo vermerkt ist. Doch dann findet Jane bei seinen Ermittlungen einen geheimen Tunnel.

Als Rigsby und Van Pelt in ihren eigenen vier Wänden lebensgefährlich bedroht werden, steht es außer Frage: Jemand möchte den Tod von Lisbons ehemaligem Team. Anscheinend wird das ehemalige CBI-Team von jemandem überwacht. Außerdem werden Van Pelt und Rigsby zu Beratern des FBI. Inzwischen müssen Jane und Fisher einen Mordfall in Texas aufklären. Ein junger Farmer wird tot im Abwasserbecken einer Ölfrackinganlage gefunden.

Während Rigsby mit seinen ehemaligen CBI-Kollegen zusammensitzt und ein Bier trinkt, wird Grace aus ihrem Hotelzimmer entführt. Der Entführer dürfte dieselbe Person sein, die LaRoche getötet hat. Als Hauptvertdächtiger gilt Rychard Haibach. Doch der kann für alle Morde, die an den ehemaligen CBI-Agenten verübt wurden ein Alibi vorweisen. Jane muss mit allen Tricks arbeiten, um Grace zu retten bevor es zu spät ist.

Die Abteilung für Kunstdiebstahl ist mit einer Diebesserie überfordert, die inzwischen auch ein Todesopfer gefordert hat. Die Ehefrau des Opfers, bittet die Agenten den Mörder ihres Mannes zu fassen. Als Jane davon hört, mischt er sich in den Fall ein und verspricht den Mörder zu verhaften. Mittels einer gekonnten Inszenierung will er die Diebe überführen. Dazu braucht er nicht nur seinen Vorgesetzten, sondern auch Cho, Lisbon und Fisher. Jeder bekommt eine Rolle zugewiesen und Jane selbst spielt einen Kunstdieb.

Als bei einem Bombenanschlag ein junger Mann stirbt, nimmt Patrick Jane zusammen mit Abbotts Team die Ermittlungen auf. Wie das Bombenkommando herausfindet, wurde um den Sprengkörper eine schützende Decke gewickelt, um keine weiteren Passanten zu verletzen. Bei dem Ermordeten handelt es sich um den Bruder eines in der Todeszelle sitzenden Inhaftierten, der in den nächsten Tagen hingerichtet werden soll. Der getötete Bruder war nah dran, endlich die Unschuld seines Bruders zu beweisen.

In einem abgelegenen Nationalpark wird die Leiche einer jungen Frau gefunden. Das einzige Anwesen in der Nähe ist der noble 'Foragers Club’, der ausschließlich reichen Männern vorbehalten ist. Jane und Lisbon finden heraus, dass die Ermordete Madison Pryce heißt und dort als Geheimprostituierte gearbeitet hat. Unter Verdacht gerät der Unternehmer Marvin Gryska, dem das FBI bereits wegen diverser Finanzvergehen auf der Spur ist.

Auf der Straße trifft Jane zufällig auf einen Mann, der ihm verdächtig erscheint. Als Jane und Lisbon der Sache nachgehen, finden sie in seinem Haus eine angeschossene junge Frau vor, die kurze Zeit später stirbt. Als Erklärung gibt der offensichtlich verwirrte Mann an, die Verstorbene auf der Autobahn aufgelesen zu haben. Wylie ist es möglich nach seiner Beschreibung die Stelle zu lokalisieren und dort finden Cho, Jane und Lisbon eine weitere gefesselte Frau in einem Erdloch. Das FBI ist auf einen Mädchenhändlerring gestoßen, deren Betreiber zu den brutalsten Verbrechern gehören.

Eine Grand Jury wird zusammengestellt um zu klären, ob Jane wegen des Mordes an Red John angeklagt werden soll. Es stellt sich heraus, dass es dem FBI nicht um die Anklage an sich geht. Denn diese ist bloß ein Aufhänger, um an die Staatsanwältin heranzukommen. Sie wird verdächtigt Bestechungsgeld von einem Mafiaboss erhalten zu haben. Und Agent Lisbon steckt in privaten Schwierigkeiten, da ihr Freund Agent Pike sie nach Washington mitnehmen möchte. Lisbon ist nicht überzeugt von dieser Idee, da sie Jane nicht alleine lassen möchte.

Jane und Lisbon suchen nach wie vor nach den verschwundenen Frauen. Sie machen eine grauenvolle Entdeckung: in einem aufgegebenen Krankenhaus werden ausgeweidete Frauenleichen gefunden. Außerdem wurden die Frauen mit schwarzen Herzen auf dem Handrücken markiert. Nachdem der ehemalige Chirurg Alexander Lark ausgepackt und zugibt, die Frauen mit Propofol getötet und die geforderten Organe entnommen zu haben, wird er tot in der Zelle aufgefunden. Lisbon und Jane müssen sich beeilen, wenn sie die übrigen Mädchen aus den Klauen der Bande befreien wollen, bevor sie per Übersee verschifft werden.

Als Teresa Patrick mitteilt, dass sie nach Washington gehe, nimmt Patrick die Nachricht recht gelassen auf. Doch dann taucht plötzlich ein Brief beim FBI auf, der einen alten Fall wieder aufrollt und eine neue Drohung enthält, dass weitere Morde passieren werden. Die Brisanz des Falles läßt Lisbons Versetzung zu diesem Zeitpunkt nicht zu. Sie muss bleiben und ermitteln. Im Zuge der Nachforschungen stellt Lisbon fest, dass der Brief ein Fake ist und Patrick ihn selbst geschrieben hat.