事件から２日後、モールで「レッド･ジョン」と名乗る男を射殺したジェーンの裁判が始まる。ジェーンは弁護士をつけず、検察側が提示した保釈金百万ドルをそのまま承諾し、刑務所にとどまっていた･･･。

ジェーンはコンサルタントとしてＣＢＩへの復帰を許され、バートラム局長からレイ・ハフナーという捜査官が率いるチームに参加するよう言われる。一方、停職処分中のリズボンは自宅でリハビリに励み、リグスビーは一時的に警備の仕事に配属され、ヴァンペルトは効果に疑問を抱きながらもカウンセリングを受けていた。

９歳の少年コナーの誘拐事件が起きる。ジェーンらは被害者の母親ベスに指名されたのだが、ベスはジェーンの昔の顧客だった。今もジェーンをサイキックと信じるベスは霊視でコナーを捜させようとする。リズボンは捜査の混乱を避けるためにジェーンを捜査から外そうとするが･･････。

移民政策の改革を訴える市長が率いるデモのさなか、路地で身元不明の男性が殺されているのが発見される。連絡を受けて現場に向かう途中で、ジェーンは不穏な目つきで市長を見つめる男に気づく。

サンフェリックス島のビーチに若い女性の遺体が流れ着く。女性にはレイプされた痕があり、ＣＢＩが出動。島の住民らは当初、知らない女性だし、本土か海で落ちて流れ着いた遺体だろうと言うが、ジェーンは自らの実験から、女性の遺体はこの島で捨てられ、犯人は島にいると断言する。

カリフォルニア州フェアモントでグリーン署長の遺体が発見される。リズボン達はグリーン署長の自宅を調べに行く。すると、何者かが家の中を探っていた。なんとそれは、リズボンの弟トミーだった。

フレズノ近郊で連続殺人犯「サンホアキン・キラー」による新たな犠牲者が出る。ジェーンは、サンホアキン・キラーを最初の事件から追っている事件記者ジェームズ・パンザーに興味を引かれ、個人的に捜査協力を求める。

クラブの外で女性が射殺された。いち早く駆けつけた刑事ヘンダーソンが「地元のクラブ通いの女が売人に撃たれたんだ」と決めつけるのにジェーンは疑念を感じる。

引退した元花形クォーターバックのドク･ドゥーガンが自分の店の前で車に乗り込んだところ、爆弾が仕掛けてあり爆発。ドクの代理人アレックスとマネージャーのスティーヴも、その場面を目にしており、２人は「現場から逃げた男がいる」と証言。ジェーンは死体の指にチャンピオンリングがないことが気になり･･････。

消防士ポール・サターフィールドが殺害された。その現場付近をジェーンが捜索していると、突然背後から何者かに襲われ、湖に沈められてしまう。救急隊の手当てで一命は取り留めるが･･････。

サマーの紹介で、殺人予告を受けた大物離婚弁護士クリークがサンフランシスコにＣＢＩを呼びつける。リズボンらが待ち合わせ場所のボートに着く直前、ボートが爆発し･･････。

国有林そばの別荘で射殺体が発見された。被害者はガブリエル・ポルチェット・ジュニア。ギャングのポルチェット・ファミリーの長男だ。娼婦を集めてパーティをしていた最中に殺された。ヴァンペルトは目撃者の娼婦ジャンペンを連行して車を運転するが、途中で殺し屋マルケットに襲われ、逃走するうちに森林の中で道に迷ってしまう。

中国系の貿易商リューがロフトを貸していたウィック･シーセンズが殺されていた。ウィックは２年前まではファッション界のトップデザイナーだったが、酔って業界人の悪口を言うさまをネットにアップされ、干されていた。ジェーンたちはウィックがおととい口論していたというデュバルに会う。

ワイン生産家のイヴ・マルベリーがダンス教師カルロス・ルイズを殺した罪で裁判にかけられ、まもなく評決が出ようとしていた。裁判所でマスコミに囲まれるイヴの姿を見てジェーンは彼女は無実だと確信。リズボンと共に調査を開始する。

サンフランシスコ駅でナタリー･ギベッキが殺された。彼女が少年更生施設のカウンセラーだったため、市長が施設の理事であるつながりでＣＢＩが呼ばれた。ジェーンはナタリーの死体を見て、不倫相手とのデートに行く途中だったと見抜く。そこへ以前逮捕したエリカ･フリンから電話がかかってくる。

ブレット･スタイルズ率いる「ビジュアライズ」を糾弾していた反カルト活動家のゲイブ･メドウズが殺された。現場からは急いでパソコンだけが取られた跡があったが、指紋は念入りに拭き取られていた。殺人犯と、現場の証拠を消した者は別だと気づいたジェーンは･･････。

ジェーンはＦＢＩのダーシーの捜査にかり出される。被害者の家族に副知事とのパイプがあり、「最高の者を捜査に当たらせろ」という命令だと言う。リズボンは心配するがパトリックは面白がってダーシーについていく。

男性の遺体が発見される。アーチャー・ブラドックという資産家で、妻と２人の子供がいたが、骨のガンで余命わずかだったことが判明。妻のヘレンは２か月前にアーチャーと結婚したばかり。彼女もまた末期ガンで寝たきりの状態で、アーチャーとはガン患者の支援団体を通して出会った仲だった。ジェーンはブラドック家のキッチンで、強烈なにおいのするお茶を見つける。それはアーチャーの遺体にも染みついていたにおいだった。

高校の野球場で、若い男性教師マクティアニーが鈍器で撲殺されているのが発見された。評判のいい教師だったが、持ち物から、生徒から届いたらしき「大嫌い」と書かれた手紙が発見される。その後、全校生徒を集めた追悼集会でジェーンが「誰が書いた？」と生徒に問いかける。１人だけ周りを見回さなかったレイチェルだと分かり、リズボンが事情を聞くと･･････。

路地裏で、車に手錠で縛られて焼かれた死体が発見される。近くには折れた赤いヒールがあり、ドラッグ･クイーンのショーを見せるキャバレーがあった。ヒールの持ち主はグレンダという黒人の大男。現場からは指紋が沢山採取されており、犯人はすぐに分かるかと思われた。

サンタマルタのビーチで２６歳のセミプロサーファー、ジェイ･バナーが行方不明だとルームメートから通報があり、その後遺体で発見される。リズボンとジェーンはジェイが務めていたサルベージ会社に聞き込みに行くが、そこの経営者はリズボンの元カレ、グレッグだった。

ジェーンの妻と娘の命日。墓参りに行くジェーンの車のワイパーに「記念日を祝って」というカードがあり、墓にはレッド･ジョンの伝言を持った少女が会いに来る。

リズボンらの元に、至近距離から顔面を撃たれた男の死体の通報。歩きで来るとは考えられない場所で、身元が分かるものは何も持っていない。リズボンは旧知の検視官に、ジェーンがベガスで逮捕されたことを聞く。