町の有力者、ダブリンが誘拐され、運転手が３発撃ち込まれ、殺されているのが発見される。折しもＣＢＩには局長バートラムが就任したばかり。パトリックはバートラムをうさん臭く思い、クリスティーナが誘拐されたショックからも立ち直れないまま、捜査協力を断る。

パトリックの死んだ妻の弟、ダニーから突然ある晩、電話がかかってくる。呼び出されたＫラム投資のビルにパトリックが行くと、そこに死体があった。落ちていた凶器にダニーの指紋があったら…と、指紋を拭いていると、ダニーの通報でそこに警官がきて、パトリックは逮捕されてしまう。

川で女性の死体が発見される。その現場に、失踪人捜索課からクリスティーナの手がかりが発見されたとパトリックに連絡が来る。ラジオ番組に電話してきたクリスティーナの声で、逆探知で住所が分かる。そこにはレッド･ジョンのマークと人形だけが残されていた。

えん罪だとして釈放されたばかりの男ヘンリー･ダールが、頭の形も残らぬほど頭部に被弾してモーテルで遺体で発見される。パトリックは徹夜でレッド･ジョンを追っていたこともあり、ヘンリーがどう考えても残忍な異常者だと見抜き、早々に部屋を出て車で寝る。その様子を「裁判ＴＶ］のカレン･クロスらが撮影し、テレビで大々的に流す。

路地で騎手ビル・サットンが撲殺されて見つかる。遺体のポケットには「許してくれ」と書いた紙ナプキンと指輪。別れた恋人のデリンダに宛てたものだった。恋人のデリンダに聞くと、契約が決まったお祝いに行こうと出かけたところ車の接触事故を起こし、高圧的な態度の相手に怒って、相手をボコボコにしてしまったのだという。

ポーリーン･フィッツジェラルド連邦判事の家で、ポーリーンの母エセルの通夜の日、娘アビーが失踪し、アビーの恋人オースティンが刺殺されているのが見つかる。ポーリーンは以前ネオナチのリーダー、タッブスに重い刑を下したことからネオナチの嫌がらせに遭っていた。

ヘリコプターの会社を持っているユーリ･バジョーランに殺人予告が入ったことで、解決のため、ある有力筋から派遣されるジェーンとリズボン。その有力筋とは去年、彼らの容疑者になることを自ら楽しんでいた大富豪、ウォルター･マッシュバーンだった。ユーリと一度、部屋に入ったウォルターはふと思いつき、リズボンに次に会う約束を取り付けようと出てきたところ、ユーリの部屋が爆発し･･････。

果物を買いに出たジェーンが誘拐され、果物屋の主人は誘拐犯に射殺される。目撃者は２人。うち１人の女性は、恐らくアリゾナプレートの車が北に逃走したと証言する。誘拐犯も肩に被弾しており、ジェーンが懐柔しようとするが･･････。

田舎町の果樹園で３人が殺される。うち二人は保安官代理、一人は地元の消防士トッドの婚約者だった。ジェーンは３人の殺し方がそれぞれ違うことと、死体の配置に美学があることに興味を持ち、捜査を担当すると言う。トッドは「犯人はこの手で殺す」と宣言し、リズボンを早速うんざりさせる。

サクラメント旧市街でサンタクロースの扮装をした男がアパートから落ちて死亡。ポケットには遺書らしきカードが入っていたが、ジェーンは男が酒臭いことから「他殺」だと言い切る。実際の死因は墜落死だが、血中には致死量のアルコールがあった。つまり放っておいても男は死んだのだった。

総合格闘技の試合で、ラウディとマニーの試合中に女性の死体が発見される。女性は２人の試合を取材中だったシャーロット･ミッチェル。物は取られておらず、乱暴もされていないのでジェーンはすぐ「試合絡み」と決めつけて両陣営に聞き込み。失礼な態度を取ってすぐに追い出される。

車のスクラップ場で女性の遺体が2体発見される。死亡推定時期は1週間違っていたが、同じ凶器で撲殺の手口も同じだった。今回、FBIから派遣されてきた意思決定科学の専門家モンタギュー博士が捜査顧問となり、10年前の連続殺人犯「ケイブマン」の仕業だと断言。彼女の説明だとケイブマンは女性2人を1週間間隔で殺し、女性同士に接点はないとのことだが、ジェーンは、女性同士は知り合いだったと言う。

クレインクリークという田舎町で女性の射殺事件があり、ＣＢＩが出動。リズボンはバートラムから逐一報告しろとクギを刺される。町長が今度、下院議員に立候補するというので裏で政治的な動きがあったのだ。殺された女性アンバーはドキュメンタリー作家で、町長の選挙公報ビデオを撮影中だった。リグスビーは「案外、楽に片付くかも」と言うが、リズボンにとって「楽に片付く」という言葉には必ず面倒が起こるというジンクスがあった。

証人保護プログラムを受けていたジャスティン･デジョージの護衛に、連邦保安官と共同で当たっていたヴァンペルト。ジャスティンは娘のトリーナと共に保護されていた。ヴァンペルトは夜の見回り中に誰かに殴られ気絶。その間に家の鍵は開けられ、証人は殺されていた。トリーナは家の外に隠れていたのが見つかるが、事件の記憶を失っており･･････。

金脈があると噂になった場所で射殺体が発見させる。被害者はリック･ルーミス。レイオフされて、息子ジェフと恋人シェリルと共に移住してきて、金の採掘に夢中になっていた男だった。息子が大学に入るための資金も使い込んでおり、もともとは仲の良かった親子だが、最近ぎくしゃくしていたと言う。リズボンは最初の現場検証の時に足をくじき、代わりにハイタワーが現場に出る。しかしなぜかハイタワーはみるからにピリピリしていた。

緊迫するＣＢＩ。ジェーンの部屋に容疑者が立てこもっていると言う。銃を突きつけられて出てくるジェーン。その容疑者とはハイタワーだった！　一体なぜ、そのようなことになってしまったのか？

ゴルフ場で殺されていた男性は医師のマイカ･ニュートン。ジェーンは見ただけで殺人犯は医師と断言。ハイタワーが逃亡し、リズボンらの上司にはラローシュが就任。反抗的なリズボンを降格し、チームのリーダーにチョウを指名する。

郊外で男性の死体が見つかる。検視官事務所に派遣されてきた監察医は、今まで四角四面な対応でジェーンのからかいの対象だったシュタイナー医師。しかしその後、遺体を乗せて先に殺害現場を出たシュタイナーらの車が襲われ、遺体が盗まれる。シュタイナーはジェーンに近づき、捜査に参加したいと申し出て、ジェーンは承認する。

マリーナで高級結婚相談所のＣＥＯジョン･フリンが射殺され、海に落とされているのが発見される。ジェーンは一瞥して財産絡みだと断言。その後、結婚して１年の若く美しい妻エリカを見ると「彼女が殺した」と決めつける。しかしエリカには、犯行時刻にサラという会員の面談ビデオを録画していた動かぬアリバイがあった。

電子機器の修理店で店主テッド･フィッシャーが死んでいた。店内はくまなく荒らされており、その翌日、テッドとガールフレンドのヘザーが住んでいるアパートも荒らされていた。テッドもヘザーもボランティア活動に精を出しており、テッドは店を買う前は海外協力隊でボランティアをしていたのだとヘザーは言うが、調べるとテッドが協力隊にいた記録はない。ジェーンは犯人はまだ目当てのものを見つけていないから店に戻ってくると断言する。

ハングツリーの町で、郊外のカーソン刑務所に勤める看守ウォルトン･パーセルが殺害されていた。夜遅く、女性もののネックレスを買った後に殺されており、ネックレスは現場に残っていた。また、殺し方は、刑務所内で囚人が手製の武器で殺す、何度も刺すやり方だった。ジェーンはまず、付近に住む元受刑者が怪しいと言う。その中にリグスビーの父スティーヴがいた･･････。

サクラメントで地元オーケストラのコンサートマスターを務めていたエレノアがバス停で殺される。ベンチの横にはアジサイの花びらが１枚落ちていた。ジェーンは目撃者の中から怪しい男を名指しし、男は逃走。そしてチョウはその現場で少年に車を奪われてしまう。

サクラメントのガススタンドで、消費者金融「キャッシュ･イン･モーション」で５万ドル奪って逃げた、体に爆弾を巻いたディンクラーが発見される。警官が銃を向けると男はその場で爆発。「キャッシュ･イン･モーション」からディンクラーが盗んだのは５万ドルと、会社の顧客データを入れたＣＤ２枚だった。ジェーンが店に行ってみると、金庫の中には残っている金の方が多いくらいだった。

逃亡していたハイタワーが出頭して無実を法廷で争う、とジェーンに告げに来た。ジェーンはチームの皆に今までの経緯を話し、ハイタワーの護衛を頼む。そしてハイタワー以外の容疑者４人の名前を入手、容疑者全員に「パシフィック･パームズ･ホテルにハイタワーがいる」と情報を漏らすが、それぞれ違う階の部屋番号を伝える。そのどこに殺し屋が来るかで、誰がレッド･ジョンの手先かが判明する仕組みだった。

事件から２日後、モールで「レッド･ジョン」と名乗る男を射殺したジェーンの裁判が始まる。ジェーンは弁護士をつけず、検察側が提示した保釈金百万ドルをそのまま承諾し、刑務所にとどまっていた･･･。

ジェーンはコンサルタントとしてＣＢＩへの復帰を許され、バートラム局長からレイ・ハフナーという捜査官が率いるチームに参加するよう言われる。一方、停職処分中のリズボンは自宅でリハビリに励み、リグスビーは一時的に警備の仕事に配属され、ヴァンペルトは効果に疑問を抱きながらもカウンセリングを受けていた。

９歳の少年コナーの誘拐事件が起きる。ジェーンらは被害者の母親ベスに指名されたのだが、ベスはジェーンの昔の顧客だった。今もジェーンをサイキックと信じるベスは霊視でコナーを捜させようとする。リズボンは捜査の混乱を避けるためにジェーンを捜査から外そうとするが･･････。

移民政策の改革を訴える市長が率いるデモのさなか、路地で身元不明の男性が殺されているのが発見される。連絡を受けて現場に向かう途中で、ジェーンは不穏な目つきで市長を見つめる男に気づく。

サンフェリックス島のビーチに若い女性の遺体が流れ着く。女性にはレイプされた痕があり、ＣＢＩが出動。島の住民らは当初、知らない女性だし、本土か海で落ちて流れ着いた遺体だろうと言うが、ジェーンは自らの実験から、女性の遺体はこの島で捨てられ、犯人は島にいると断言する。

カリフォルニア州フェアモントでグリーン署長の遺体が発見される。リズボン達はグリーン署長の自宅を調べに行く。すると、何者かが家の中を探っていた。なんとそれは、リズボンの弟トミーだった。

フレズノ近郊で連続殺人犯「サンホアキン・キラー」による新たな犠牲者が出る。ジェーンは、サンホアキン・キラーを最初の事件から追っている事件記者ジェームズ・パンザーに興味を引かれ、個人的に捜査協力を求める。

クラブの外で女性が射殺された。いち早く駆けつけた刑事ヘンダーソンが「地元のクラブ通いの女が売人に撃たれたんだ」と決めつけるのにジェーンは疑念を感じる。

引退した元花形クォーターバックのドク･ドゥーガンが自分の店の前で車に乗り込んだところ、爆弾が仕掛けてあり爆発。ドクの代理人アレックスとマネージャーのスティーヴも、その場面を目にしており、２人は「現場から逃げた男がいる」と証言。ジェーンは死体の指にチャンピオンリングがないことが気になり･･････。

消防士ポール・サターフィールドが殺害された。その現場付近をジェーンが捜索していると、突然背後から何者かに襲われ、湖に沈められてしまう。救急隊の手当てで一命は取り留めるが･･････。

サマーの紹介で、殺人予告を受けた大物離婚弁護士クリークがサンフランシスコにＣＢＩを呼びつける。リズボンらが待ち合わせ場所のボートに着く直前、ボートが爆発し･･････。

国有林そばの別荘で射殺体が発見された。被害者はガブリエル・ポルチェット・ジュニア。ギャングのポルチェット・ファミリーの長男だ。娼婦を集めてパーティをしていた最中に殺された。ヴァンペルトは目撃者の娼婦ジャンペンを連行して車を運転するが、途中で殺し屋マルケットに襲われ、逃走するうちに森林の中で道に迷ってしまう。

中国系の貿易商リューがロフトを貸していたウィック･シーセンズが殺されていた。ウィックは２年前まではファッション界のトップデザイナーだったが、酔って業界人の悪口を言うさまをネットにアップされ、干されていた。ジェーンたちはウィックがおととい口論していたというデュバルに会う。

ワイン生産家のイヴ・マルベリーがダンス教師カルロス・ルイズを殺した罪で裁判にかけられ、まもなく評決が出ようとしていた。裁判所でマスコミに囲まれるイヴの姿を見てジェーンは彼女は無実だと確信。リズボンと共に調査を開始する。

サンフランシスコ駅でナタリー･ギベッキが殺された。彼女が少年更生施設のカウンセラーだったため、市長が施設の理事であるつながりでＣＢＩが呼ばれた。ジェーンはナタリーの死体を見て、不倫相手とのデートに行く途中だったと見抜く。そこへ以前逮捕したエリカ･フリンから電話がかかってくる。

ブレット･スタイルズ率いる「ビジュアライズ」を糾弾していた反カルト活動家のゲイブ･メドウズが殺された。現場からは急いでパソコンだけが取られた跡があったが、指紋は念入りに拭き取られていた。殺人犯と、現場の証拠を消した者は別だと気づいたジェーンは･･････。

ジェーンはＦＢＩのダーシーの捜査にかり出される。被害者の家族に副知事とのパイプがあり、「最高の者を捜査に当たらせろ」という命令だと言う。リズボンは心配するがパトリックは面白がってダーシーについていく。

男性の遺体が発見される。アーチャー・ブラドックという資産家で、妻と２人の子供がいたが、骨のガンで余命わずかだったことが判明。妻のヘレンは２か月前にアーチャーと結婚したばかり。彼女もまた末期ガンで寝たきりの状態で、アーチャーとはガン患者の支援団体を通して出会った仲だった。ジェーンはブラドック家のキッチンで、強烈なにおいのするお茶を見つける。それはアーチャーの遺体にも染みついていたにおいだった。

ハイウェイでライアン･デステファノという男の射殺体が発見される。ジェーンはそのカジノで旧友のマジシャン、ジャック･ヘリオンがショーをしているのに気付いて見に行くが、ヘリオンは全然実力が出せておらず、ジェーンのヤジに容易にぐらついていた。さらにジェーンが「デステファノを知っているか」と聞くと明らかにウソをついた。

高校の野球場で、若い男性教師マクティアニーが鈍器で撲殺されているのが発見された。評判のいい教師だったが、持ち物から、生徒から届いたらしき「大嫌い」と書かれた手紙が発見される。その後、全校生徒を集めた追悼集会でジェーンが「誰が書いた？」と生徒に問いかける。１人だけ周りを見回さなかったレイチェルだと分かり、リズボンが事情を聞くと･･････。

路地裏で、車に手錠で縛られて焼かれた死体が発見される。近くには折れた赤いヒールがあり、ドラッグ･クイーンのショーを見せるキャバレーがあった。ヒールの持ち主はグレンダという黒人の大男。現場からは指紋が沢山採取されており、犯人はすぐに分かるかと思われた。

サンタマルタのビーチで２６歳のセミプロサーファー、ジェイ･バナーが行方不明だとルームメートから通報があり、その後遺体で発見される。リズボンとジェーンはジェイが務めていたサルベージ会社に聞き込みに行くが、そこの経営者はリズボンの元カレ、グレッグだった。

ジェーンの妻と娘の命日。墓参りに行くジェーンの車のワイパーに「記念日を祝って」というカードがあり、墓にはレッド･ジョンの伝言を持った少女が会いに来る。

リズボンらの元に、至近距離から顔面を撃たれた男の死体の通報。歩きで来るとは考えられない場所で、身元が分かるものは何も持っていない。リズボンは旧知の検視官に、ジェーンがベガスで逮捕されたことを聞く。