בפרק סיום העונה, מולי חוזרת לחלל כדי לנסות לשנות את מסלול ההתרסקות של תחנת ה-"סראפים" ולהגן על העולם מפני זיהום קטלני. בינתיים, ג'ון מגלה איזו סכנה נשקפת לאיתן ואיתן מוצא את הייעוד שלו.

מולי פוגשת פנים מול פנים את הילד שלה ומבינה שהיא היחידה שיכולה למנוע את הסכנה הממשמשת ובאה. בינתיים, ג'ולי חושפת סודות אפלים בנוגע לאודין.

הצאצא מתחזק והולך ומולי לומדת על תוכניתו של יסומוטו ועל הרצון שלו להציל את הצאצא. בינתיים אניה משתלטת על המצב כשספרקס מתחיל לפקפק ואודין מצליח לחדור למערכת של איתן.

ספרקס נחוש בדעתו להגן על הצאצא של מולי בכל מחיר כדי שלא לאבד את בתו. בינתיים ג'ון מגלה שטובת משפחתו אינה נמצאת בראש מעייניו של יסומוטו ומולי מתקרבת למציאת התינוק שלה.

ספרקס נמלט עם התינוק של מולי למקום מבודד בעקבות הוראותיה של בתו המתה. בינתיים, יסומוטו ומולי נאלצים לסמוך זה על זה כדי לאתר את הצאצא.

מולי מגלה שהתינוק שלה חי ויוצאת עם גורדון ועם קרייגר לחטוף אותו לפני שספרקס ויסומוטו מעבירים אותו למקום אחר. בינתיים, ג'ון נאבק לעמוד בקצב התפתחותו המהיר של איתן.

מולי ממשיכה לחפש את התינוק שלה ומשוכנעת שסוכנות החלל מחזיקה בו. ג'ון מגלה שינויים מדאיגים בהתפתחותו של איתן, וגורדון מחזיק בקרייגר כבן ערובה.

מולי מגלה סרט חשאי שחושף את הסיבה האמיתית לכך שסוכנות החלל בחרה בה למשימת היחיד. בינתיים, איתן חווה חלום בפעם הראשונה, אף שמעולם לא תוכנת לכך.

ג'ון מתחיל לפקפק באמתות ההיריון של מולי. בינתיים, איתן נפגע קשה וג'ון וג'ולי חלוקי דעות בנוגע לטיפול המתאים.

ספרקס מנסה להכניס את מולי להסגר אבל היא מצליחה לברוח עם משפחתה לביתו של אביה. כשאנשי הסוכנות מאתרים אותם, איתן נמצא בסכנה גדולה. בינתיים, יסומוטו עורך ניסויים בחומר מסתורי וקטלני.

מולי שוקלת לספר לג'ון על ההיריון אחרי שהוא מתעמת איתה בגלל ההתנהגות המרוחקת שלה. בינתיים, כמה מהורי ילדי ביה"ס חוששים מאיתן כשהוא מגיע למפגש ההיכרות.

מולי מנסה להבין מה קרה במשימה שלה בחלל ונפגשת עם הרמון. סאם מספרת לה שנמצאו חריגות בסריקות המוח שלה. מולי מתעמתת עם אלן ספרקס בנוגע לממצאים.

ד"ר מולי וודס חוזרת הביתה אחרי 13 חודשים בהן בילתה בתחנת החלל "סראפים". ראשי סוכנות החלל מחליטים לעקוב אחריה כדי לנסות ולהבין חריגה ביומן המסע של תחנת החלל.