Na stanici přilétá obří flotila klingonských lodí pod velením generála Martoka. Ti chtějí provést tajnou invazi do Cardassie. Klingoni ukončili mírovou dohodu s Federací a vypadá to, že mezi nimi propukne válka. Sisko si na DS9 jako poradce zavolá nadporučíka Worfa, který je po zničení Enterprise D rozhodnut odejít z Flotily.

Když bylo Jakeu Siskovi osmnáct, jeho otec zahynul po zásahu energetickým výbojem. Jake žil dál svůj život, přesídlil na Zemi, oženil se, stárnul, napsal dvě velmi úspěšné knížky a celou dobu přemýšlel, jak svého otce dostat zpět. Je totiž přesvědčen, že stále žije.

O'Brien a Bashir ztroskotají na odlehlé planetě v Gama kvadrantu, kde je zajme jednotka Jem'Hadarů. Brzy vyjde najevo, že uprchli z Dominionu a chtějí pro sebe získat svobodu. Nejdřív se ale musí zbavit závislosti na droze jménem ketracel bílý, který jim podávali jejich vládci. Jejich jedinou nadějí je právě teď doktor Bashir - a to se O'Brienovi ani trochu nelíbí.

Kira se vydává hledat ztracenou cardassijskou loď Ravinok, která zmizela před šesti lety. Na palubě tehdy s posádkou a zajatými Bajorany byly také dva civilisté. Právě o ně se zajímá Gul Dukat, který se na výpravu vydal společně s majorem - k její obrovské nelibosti.

Na stanici přichází skupina bajorských vědců aby prokázali novou teorii, že lze vytvořit stabilní umělou červí díru. Členkou týmu je také doktorka Lenara Kahn, která byla manželkou jednoho z Daxových hostitelů. Obě ženy s překvapením zjišťují, že jejich vztah za ta léta ani trochu neochladl. Trillské zákony však zakazují opětovné navazování vztahů po změně hostitele.

Sisko vede v Gama kvadrantu tajné jednání s Karremany. Dvě jem'hadarské lodi ale tu karremanskou zaženou do atmosféry poblíž plynného obra. Sisko se s Defiantem vydává Karremanům na pomoc. V husté atmosféře není viditelnost zrovna nejlepší a právě tady by se hodila - venku čekají nelítostní nepřátelé.

Nog se chystá k odchodu na Zemi, kde má začít studovat Akademii a protože Quark zrovna dostal svou vysněnou loď, kterou mu bratranec Galia už deset let dlužil, v záchvatu šlechetnosti vezme jak Noga i Roma a sklad plný kontrabandu na výlet na Zemi. Něco se ale nepovede a Ferengové přistanou v roce 1947 v Roswellu v Novém Mexiku, ve městě jménem Rosswell.

Na stanici se vrací klingon Kor, který tentokrát pátrá po legendárním Kahlessově bat'lethu, který byl před mnoha staletími ukraden cizinci z červí díry. Worf a Jadzia mají slavného hrdinu na výpravě doprovodit. Sisko doufá, že její úspěch napraví vypjaté vztahy mezi Federací a Klingonskou říší.

Bashir si užívá každou volnou chvilku v simulátorovém programu zasazeném do světa Jamese Bonda. Zrovna v momentě, kdy se mu do programu vetře Garak, přibude do simulátorového světa skupina několika dalších nezvaných návštěvníků a v příběhu začne jít o život.

Na diplomatické konferenci v Antverpách dojde k bombovému útoku a dvacet sedm delegátů při něm přijde o život. Velmi brzy se ukáže, že za celou akcí stojí Měňavci, což znamená, že Dominion pronikl už i do srdce Federace. Sisko a Odo se na žádost admirála Leytona vydávají na Zemi, aby využili všechny své schopnosti a zkušenosti v odhalování nepřátel.

Sabotáž Měňavců ochromí energetickou síť celé Země a tak se Sisko a admirál Layton musí pokusit pacifistického prezidenta Jaresh-Inyo donutit k vyhlášení výjimečného stavu. Životy obyvatel Země zasáhne všeobecná paranoia, občanská svoboda je omezena - a Sisko začíná pochybovat o správnosti užitých postupů.

Dávný Kiřin přítel Shakaar, někdejší farmář a bojovník za svobodu, který je nyní bajorským premiérem, přichází na DS9 aby jednal o přistoupení Bajoru k Federaci. Odo, který se má postarat o jeho bezpečnost, si ale začne všímat, že mezi Kirou a Shakaarem stále víc rostou milostné city.

Kira dostane od Shakaara důležitý úkol - má navštívit cardassijskou základnu a předat jim tam materiály o Klingonech, které získala bajorská tajná služba. Kira cestuje nákladní lodí, které velí degradovaný Gul Dukat. Na místě se ukáže, že základna byla zničena Klingony a Dukat v tom vidí příležitost, jak si získat zpět své vysoké postavení a nějaké ty zásluhy.

Na stanici přiletí Worfův bratr Kurn. Má mizernou náladu a není se čemu divit - poté, co se nedávno Worf vzepřel kancléři Gowronovi a postavil se na stranu Federace, byl jejich rod zbaven cti a Kurn byl vyloučen z Vysoké rady. Přišel tedy svého bratra požádat, aby na něm provedl Mauk-to'Vor, rituální usmrcení válečníka, který už nemá pro co žít.

Quark je vzorný ferengský zaměstnavatel, který se svými zaměstnanci zachází přesně podle ferengského obchodního práva, které říká: žádné nemocenské, žádné placené volno, žádné prémie. Rom kvůli tomu málem přijde o život a když pak jeho bratr všem sníží plat, rozhořčený Rom za vydatné pomoci Bashira a O'Briena založí odbory a vyrazí do boje proti vlastní krvi.

Z červí díry se vynoří tři sta let stará bajorská solární plachetnice, na jejíž palubě se nachází muž jménem Akorem Laan, který tvrdí, že je Vyslancem. Sisko mu tuze rád svou náboženskou úlohu přenechá. Laan však začne na Bajoru zavádět dávno překonané staré zvyklosti, které se ukážou jako překážka v přistoupení k Federaci. Sisko začíná pochybovat, jestli udělal dobře...

Worf doprovázel s Defiantem konvoj cardassijských nákladních lodí, která na jednu z jejich kolonií vezla humanitární pomoc. Konvoj byl však přepaden Klingony a Worf zničil klingonskou maskovanou dopravní loď, které měla na palubě 441 civilistů. Worf má teď být souzen...

O'Brien byl na planetě Argrartha obviněn ze špionáže a dvacet virtuálních let strávil v neexistujícím vězení. Pro jeho rodinu a přátele uplynulo jen pár dní, ale Miles už prakticky zapomněl, že kdy vedl normální život.

Siska navštíví zrcadlová Jennifer. Oznamuje mu, že vzbouřenci obsadili Terok Nor. Když se s ní setká Jake, ochotně se se svou "matkou" vydá na návštěvu zrcadlového vesmíru - a přesně o to Jennifer šlo. Prostřednictvím Jakea chce Siska přilákat do svého světa a donutit ho, aby vzbouřencům pomohl se zprovozněním jejich Defiantu.

Odo se musí postarat o těhotnou Lwaxanu Troi. Její tavnianský manžel, který se řídí heslem "ženy mají vyvolávat ženy, muže muži", jí chce zabavit ještě nenarozeného syna. A tak od něj utíká. Jake se mezitím seznámí s cizinkou jménem Onaya, která se až nezdravě začne zajímat o jeho literární tvorbu.

Federace se chystá k doručení průmyslových replikátorů Cardassianům, kteří s jejich pomocí chtějí obnovit Klingony zničené kolonie. Existuje ale možnost, že se zásilky zmocní Makisté a použijí ji proti Cardassianům. Sisko se dozvídá, že jeho přítelkyně, Kasidy Yatesová, možná s makisty spolupracuje.

Defiant zasahoval proti Breenům a teď se vrací zpátky na stanici. Sisko s hrůzou zjišťuje, že DS9 byl mezitím obsazen komandem jem'hadarských odpadlíků, kteří zničili jeden přistávací pylon a ukradli mnoho přístrojů a vybavení. Defiant se je vydává hledat a cestou narazí na poškozenou jem'hadarskou loď, která má stejný cíl jako posádka stanice.

Runabout z DS9 zachytí na misi v Gama kvadrantu nouzové volání. Na místě se ukáže, že je dvě stě let starý - a že tam, kde kdysi žila rozvinutá civilizace, je dnes jen několik tisíc jedinců, kteří trpí uměle vytvořenou chorobou a jsou už smíření se smrtí. Neuposlechli Dominion a tohle je jejich trest. Doktor Bashir však něco takového odmítá.

Quark se dozví, že trpí Dorekovým syndromem a do týdne zemře. Když ale své ostatky za neuvěřitelnou částku prodá neznámému zájemci, jeho nálada se hned o mnoho zlepší. Brzy však vyjde najevo, že diagnóza doktora Orphaxe byla chybná a Quark je v naprostém pořádku. Smlouva o prodeji ostatků ale zůstává v platnosti a kupující už se nemůže dočkat, až mu jeho zboží dorazí.

Odo onemocní děsivou chorobou a jedinou nadějí na jeho vyléčení jsou Měňavci. Defiant s Odem na palubě se tak vydává do Gama kvadrantu a nezbývá než doufat, že Zakladatelé konstáblovi pomohou. Může však Odo s jejich pomocí počítat? Poté, co porušil nejsvatější zákon své rasy a zabil jiného Měňavce?