בלונדון הויקטוריאנית אליס הצעירה מספרת על חוויותיה בארץ הפלאות ומאושפזת עקב כך בבי"ח לחולי נפש. אליס בטוחה שהעולם בו ביקרה קיים ותעשה הכל כדי לשוב אליו.

כדי לגלות מי מנסה להתנכל לה, אליס משתמשת בבקבוק השד של סיירוס כדי לפתות את היריב שלה החוצה. בעבר, סיירוס עושה את דרכו לארץ הפלאות ומתאהב באליס וג'אפר נלחם במלכה האדומה.

בארץ הפלאות, סיירוס מערים על המלכה האדומה וג'אפר, ושולח אותם למרדף שווא אחרי אליס. בעבר, אנשיו של רובין הוד מצטרפים אל נסיך הלבבות, ומשתכנעים לפרוץ לטירה של מאליפיסנט כדי לגנוב את מראת הקסמים.

אליס והלטאה חייבים להציל את הנסיך, אך כדי לעשות זאת אליס תאלץ להשתמש באחת משלוש המשאלות שלה. המלכה האדומה נקרעת בין אהבה וכוח כאשר גאפר מאיים על חייו של הנסיך, ובעבר, ג'אפר הצעיר פוגש בסיירוס לראשונה.

סיירוס מצליח לברוח מהמרתף והמלכה האדומה מציעה את המידע הזה לאליס, בתמורה לאבקת קסמים. בעבר, הנסיך ואנסטסיה מגיעים לארץ הפלאות במטרה לגנוב את יהלומי הכתר. הם נתפסים ע"י המלכה האדומה ובפניהם עומדת הבחירה בין נישואים ומוות.

אליס יוצאת למסע במטרה למצוא סיירוס, שמנסה להימלט מג'אפר כדי להתאחד עימה. עם זאת, שניהם שניהם נאלצים לסטות ממסעם בגלל נסיבות לא צפויות... בעבר, אליס חוזרת הביתה ומגלה שאביה נישא מחדש.

אליס מגלה כי אביה אדווין חי בארץ הפלאות וניצבת בפניה החלטה קשה. בעבר, אימו של ג'אפר הצעיר הולכת לעולמה, וכך מתחיל מסעו בהפיכה לנבל.

אליס יוצא לחיפוש אחר הארנב הלבן כדי להבין מדוע בגד בה לטובת המלכה האדומה. בינתיים, המלכה האדומה וג'אפר מתחרים ביניהם כדי לקבוע מי מהם יהיה בעל השליטה על סיירוס.

הלטאה ליזארד משחררת את הנסיך מהבקבוק וזוכה לשלוש משאלות. בינתיים, סיירוס, אליס והמלכה האדומה מחפשים אחר הנסיך, וג'אפר רוקם תכנית להתיידד עם ג'אפרווקי אימתני.

פלאשבק על סיירוס ואחיו חושף את המחיר הגבוה שהיו צריכים לשלם כדי לעזור לאמא שלהם. בינתיים, האביר והמלכה האדומה נתקלים בג'אפרווקי.

בעבר, קורה כופה על הנסיך לצוד את אליס. בינתיים, בהווה ג'אפר מבקש מהנסיך לגנוב מאליס, והג'אפרווקי מנסה לברוח מג'אפר, שנקלע לעימות עם שותפו הוותיק...

בפרק האחרון, אליס והארנב הלבן מגייסים צבא בכדי לעצור את ג'אפר ששינה את חוקי הקסם וגרם לאביו ולמלכה האדומה לאהוב אותו. ג'אפר אוסר את הג'אפרווקי, מגייס את צבא המתים ויוצא אל באר הפלאות בכדי לעצור את המרד ולהתמודד מול אליס בפעם האחרונה.