La storia si ambienta in un epoca imprecisata in cui l'umanità ha subito l'attacco dello "shinobi", oscuro "veleno" portato sulla Terra dalla caduta di un asteroide; ultimo rifugio sicuro del genere umano è "Kariku", un enclave situata sul fondo degli abissi marini. Una luce di speranza potrebbe però dare all'umanità una possibilità di riscatto: la "Sacra Arma Giga Road" e il leggendario guerriero maledetto Yagyuu; la principessa Ame, nobile di una nazione decaduta decisa ad affrontare la minaccia e salvare il mondo.

A história se passa em uma época em que o mundo está em desespero depois de ser devastado por um veneno chamado "shinobi" que veio à Terra através de um asteróide. As pessoas fogem para o local chamado "Kairiku", um lugar que costumava ser o fundo do oceano. Aqui, as pessoas tentam se proteger contra os efeitos do veneno. Nesse mundo, havia uma única luz de esperança. A "Estrada Sagrada da Arma Giga" e o lendário guerreiro "Yagyuu" são necessários para combater os efeitos do veneno. A fim de salvar o mundo, Ame, uma princesa de uma nação decaída, se levanta para salvar o mundo.