Po dvou letech cestování s Rose a jednom nečekaném dobrodružství s nevěstou Donnou nachází Doktor novou stálou společnici. Studentka medicíny Martha Jonesová narazí cestou do práce na výstředního muže. V nemocnici zjistí, že je to jeden z pacientů – jistý John Smith. Když se pak celá nemocnice přemístí na Měsíc, Martha už je schopná uvěřit i tomu, že pan Smith se ve skutečnosti jmenuje Doktor.

První cesta Doktora a jeho nové společnice Marthy vede do roku 1599. Mají v úmyslu se setkat s největší celebritou alžbětinského Londýna – Williamem Shakespearem. Plány jim ale naruší mimozemské čarodějnice. Zapomněly ovšem, že Shakespeare je génius slova.

Původně chtěl Doktor vzít Marthu jen na jeden výlet, ale nějak se mu s ní ještě nechce loučit. Zavítají tedy do Nového New Yorku v daleké budoucnosti. Futuristické město však zdaleka není takové, jaké si ho pamatoval. V nastalém chaosu a ohrožení však i zde nalezne jednoho starého přítele.

Posádka TARDIS opět navštíví New York. Tentokrát ne Nový New York, ale ten starý New York z roku 1930, zmítaný velkou hospodářskou krizí. Majestátní mrakodrap Empire State Building je už téměř dokončený a ostře kontrastuje s chudinskou čtvrtí Hooverville, kam Doktor a Martha zamíří a kde zjistí, že poslední dobou záhadně mizí místní obyvatelé.

Dalekové, jejichž zastavení Doktor obětoval vše, co v životě kdy měl, se znovu vrátili. Zrodila se nová forma Daleka. Lidský Dalek, hybrid mezi člověkem a Dalekem. Budování nové civilizace může začít. Ale dokáže vůbec Dalek zvládnout lidské emoce? Doktorovi se nabízí jedinečná příležitost. Podaří se mu po nekonečných bojích uzavřít s novou rasou Daleků mír?

Doktor a Martha se ocitají na vesmírné lodi, která má přesně za čtyřicet dva minut narazit do Slunce. Někdo vyřadil motory a jeden z členů posádky se mění v cosi úplně jiného. Podaří se Doktorovi ve vymezeném čase nahodit motory, zachránit Marthu a ještě to všechno přežít?

Píše se rok 1913 a John Smith pracuje jako učitel na internátní škole. Vede se mu dobře a dokonce se začíná sbližovat s místní zdravotní sestrou Joan. Občas se mu ale zdají podivuhodné sny, v nichž je dobrodruhem z jiné planety, kterému říkají Doktor, jeho služebná Martha mu dělá při cestách časem a prostorem společnost a v jeho hodinkách je ukrytá jeho duše. Jsou to samozřejmě nesmysly, John Smith je přece obyčejný člověk.

Škola je napadena mimozemšťany a Martha musí Johnovi říci pravdu. Pravdu o tom, že on je Doktor, a že musí najít hodinky, které ukradl student Tim, aby se opět mohl stát Pánem času. Co když se ale John nechce stát Pánem času? Copak by se někdo jen tak dokázal zbavit své lidskosti?

Setkání s andělem může být pěkně hororový zážitek, při němž člověku tuhne krev v žilách. Mladá žena Sally Sparrowová se vypraví do opuštěného chátrajícího domu kvůli fotografování. Místo podnětů k umělecké tvorbě zde nalezne sochy plačících andělů a varovnou zprávu od tajemného Doktora.

TARDIS opouští Cardiff, kde doplňovala palivo, když doslova narazí na starého známého, kapitána Jacka Harknesse. Poté neočekávaně zamíří na samý konec vesmíru. Doktor, Martha a Jack se ocitají v nehostinné krajině, kde pohasly i hvězdy. Ale i zde žijí lidé. A upínají své naděje k bájné Utopii.

Tvář z Boa měl pravdu, Doktor není ve vesmíru sám. Jeho starý (ne)přítel Vládce mu ukradl TARDIS, a tak si musí společně s Marthou a Jackem vystačit s ovladačem časového víru, který je z konce vesmíru přenese zpět na Zemi 21. století. Británii vládne nový premiér Harold Saxon, což není nikdo jiný než Vládce. A to nevěstí nic dobrého, protože je úplně šílený.

Už je to rok, co Vládce ovládl Zemi. Zestárlého Doktora, Jacka i rodinu Marthy stále drží jako vězně na své lodi. Martha strávila celý ten strašný rok na Zemi, procestovala ji křížem krážem, dodávala lidstvu naději a vyprávěla příběhy o Doktorovi. Stala se z ní živoucí legenda. Martha Jonesová – jediná žena, která dokáže Vládce zničit.