В 2552 году люди на планете Мадригал боролись за независимость, но фатальное столкновение с пришельцами Ковенанта становится роковым. Мастер Чиф - Джон 117 и команда суперсолдат «Спартанцы» вступают в бой. После битвы Мастер Чиф направляется на свою родную планету Предел с выжившим из колонии и загадочным объектом, который он обнаружил на планете. Но спорный приказ заставляет Джона сомневаться в своей миссии и в себе самом.

Джон приводит Кван к старому другу и узнает больше о загадочном объекте, которым Ковенант и Маки очень хотят завладеть. В связи с ростом инопланетной угрозы у доктора Холси есть план, как справиться с непредсказуемым поведением Джона.

Джон встречает своего нового напарника и открывает секреты собственной памяти. Кван хочет вернуться на Мадригал, чтобы продолжить борьбу за независимость своего народа, но у Сорена на нее другие планы. Маки приступает к реализации своего плана по возвращению артефакта с Мадригала, что приводит к ужасным последствиям.

Джон вместе с Холси и Кортаной возвращается туда, где все началось, в поисках ответов из своего прошлого. Кван вместе с Сореном отправляется на поиски армии. Тем временем поступки Джона вдохновляют другого спартанца начать путешествие в свой внутренний мир. И Миранда обнаруживает возможную связь между артефактом и чем-то гораздо большим.

Находясь в бегах и не имея выбора, Кван и Сорен расходятся во мнениях. Когда все думают о возможности найти таинственный Хало, Джон делает ужасное открытие. И война вновь заявляет о себе.

Выжившие после битвы возвращаются на Рич. Джон сталкивается с ложью доктора Хэлси о своем прошлом. Новый пленник, кажется, знает Джона лучше, чем он сам. Чтобы узнать больше, Джон вновь обращается к загадочному артефакту, который показывает ему нечто поистине поразительное.

Путешествие Кван в поисках "истинного предназначения" своей семьи заводит ее глубоко в пустыни Мадригала. Сорен одержим незаконченными делами.

Избитый, израненный и преданный, Джон 117 ведет спартанцев на самоубийственную миссию, чтобы найти Хало и спасти человечество. Но какой ценой?