Splinter erlaubt seinen Söhnen, den Mutant Ninja Turtles, zum ersten mal die Stadt über ihnen zu erkunden, bei ihrem besuch entdecken sie das die Stadt komplexer ist als sie auf dem ersten Blick erscheint.

Splinter erlaubt seinen Söhnen, den Mutant Ninja Turtles, zum ersten mal die Stadt über ihnen zu erkunden, bei ihrem besuch entdecken sie das die Stadt komplexer ist als sie auf dem ersten Blick erscheint.

Raphael rastet aus als ein New Yorker namens Vic ihn beschimpft. Als Vic die Turtles mit seinem Handy filmt, müssen die vier jungen Helden ihn aufspüren, um zu verhindern, dass ihr Schatten-Dasein publik gemacht wird.

Michelangelo freundet sich über eine Social-Network-Seite mit seinem Karate-Idol Chris Bradford an. Damit will er beweisen, dass auch die Turtles mit Menschen befreundet sein können. Doch was er nicht weiß: Bradford ist Teil von Shredders Team...

Die Turtles schleichen sich heimlich aus der Abwasserwelt hinauf in die Stadt, um mit April ins Kino zu gehen. Dort treffen sie auf Baxter Stockman, ein verrückter Erfinder, der sich einen mechanischen Panzeranzug gebaut hat.

Donatello hat es satt mit einem einfachen Holzstab gegen die technologisch fortgeschrittenen Kraang zu kämpfen. Deshalb baut er ‚Metalhead‘, einen ferngesteuerten Turtle-Roboter, mit dem er sich gegen die Technologie gewappnet fühlt.

Donatello und April untersuchen den Fall eines vermissten Wissenschaftlers. Doch bei ihren Nachforschungen stoßen sie auf ein äußerst mysteriöses Experiment: Es geht um einen übersinnlichen Affen...

Leo meint einen Fehler gemacht zu haben, als Xever, ein früherer Widersacher, dem Leo die Freiheit gewährt hatte, erneut Unruhe stiftet. Xever nimmt einen Imbiss-Besitzer als Geisel.

April bekommt eine Warnung von ihrem Vater, der von den Kraang verschleppt worden ist. April bricht zusammen mit den Turtles auf, um ihn zu retten. Sie müssen unbedingt verhindern, dass die Kraang eine Mutagen-Bombe in der Stadt entzünden.

Die Turtles müssen ihr Zuhause in der New Yorker Unterwelt vor Chris Bradford beschützen als er versucht das Kanalisationssystem mit einem gefährlichen Giftstoff zu versetzen.

Jetzt ist es an der Zeit sich zu beweisen: Die Turtles müssen sich in zwei Teams aufteilen, als sie von zwei Seiten angegriffen werden. Die Purple Dragons und Stockmans mechanische Mouser setzen die Turtles unter Druck. Doch hat das „B-Team“ von Donnie und Mikey soviel drauf wie das „A-Team“ von Leo und Raph?

Michelangelo hat einen neuen Freund gefunden, der mutierte Alligator Leatherhead, der ungewöhnliche Kraang-Technologie besitzt. Die anderen wissen nicht so recht, ob sie dem neuen trauen können.

Die Turtles müssen sich einem neuen Gegner stellen: Dem Rattenkönig. Und der will nicht nur die Stadt in seine Gewalt bringen, sondern auch Splinter.

Weil er Raphs ständige Kritik satt hat, überlässt Leo seinem Bruder die Rolle als Anführer. Kurz darauf lernt er ein wunderschönes, aber auch gefährliches Ninja-Mädchen kennen.

Als Aprils Schulprojekt die Aufmerksamkeit der Kraang auf sich zieht, müssen die Turtles ihnen eine Lehrstunde verpassen.

Eine Menge Ärger bahnt sich an, als die Turtles auf einen Teenager treffen, der als Möchtergernheld namens „der Pulverizer“ das Verbrechen bekämpfen möchte.

Als sie in das Bürohochhaus der Firma TCRI eindringen, das Hauptquartier des Feindes, erfahren die Turtles die wahren Absichten der Kraang und beschließen, die Invasion der Aliens ein für alle Mal zu beenden.

Während die Turtles versuchen, einen Invasionsplan der Kraang zu vereiteln, werden sie von einer riesigen, unzerstörbaren Kakerlake verfolgt.

Weil er es leid ist, von Fischface und Dogpound erniedrigt und von den Turtles besiegt zu werden, sinnt Baxter Stockman auf Rache, indem er seine Hassobjekte in ein tödliches Labyrinth lockt...

Karai verbündet sich mit den Turtles im Kampf gegen eine neue Waffe der Kraang. Doch dieses Bündnis steht unter einem schlechten Stern...

Als Shredder den Plan ausheckt, eine furchterregende Mutantenarmee aufzustellen, lassen sich die Turtles notgedrungen von Pulverizer helfen, der als neuester Rekrut des Foot Clans Informationen liefern kann...

Michaelangelo must fight his brothers when they fall under the control of a parasitic wasp.

Donatello breaks into a secret Kraang detention center in order to rescue Kirby O'Neil, but ends up trapped inside with a deadly prisoner called the Newtralizer.

The turtles engage in a difficult battle, as they make a desperate assault on TCRI to shut down the Kraang portal.

With the world at stake, the only thing of importance is that the Turtles complete their mission. No matter what ...