Leo er træt af Raphs konstante kritik, så han lader sin bror prøve at få kommandoen. Samtidig møder Leonardo en smuk, men farlig kvindelig ninja.

Snakeweed returns and begins abducting people. Tired of Raphael's constant criticism while trying to stop Snakeweed, Leonardo lets Raphael try his hand at leadership. While away from the group, Leonardo meets a female Foot Ninja named Karai, who tries to lure him to the dark side.

צבי הנינג'ה נתקלים באויב חדש, "מלך החולדות", שכשמו כן הוא שולט בכל חולדות העיר ניו-יורק. יחד הם יוצאים להילחם בו ולעזור למאסטר ספלינטר בצרה שאליה נקלע.

Leonardo, stanco delle continue critiche di Raffaello, lascia che il fratello si cimenti per un po' al comando della squadra. Nel frattempo, Leonardo incontra una bella e pericolosa ninja che cerca di attirare Leonardo verso il lato oscuro.

A cidade é invadida por um exército de ratos que estão sendo controladas mentalmente pelo Rei Rato e Mestre Spilter. Leo, Rapha, Donnie e Mikey precisam lutar contra seu próprio mestre.

Змейквьюн (мутант из первой серии) возвращается и похищает людей. Устав от постоянной критики Рафа на тему как надо быть лидером, Леонардо уходит и ставит на место себя Рафаэля. После ухода Леонардо встречает девушку-ниндзя по имени Караи, которая пытается заманить его на тёмную сторону.

Leonardo cansado de la constante crítica de Rafa, sobre la manera en el dirige, le permite tomar el líderazgo a su hermano. Mientras el equipo busca a Viboraalga, Leo conoce a una kunoichi llamada Karai que trata de llevarlo al lado oscuro.

Snakeweed återvänder, och börjar fora bort människor. Leonardo tröttnar på Raphaels kritik när sköldpaddorna försöker stoppa Snakeweed. Leonardo stöter snart på Karai, en kvinnlig ninja från Fotklanen som försöker övertala Leonardo att byta si

Želvy čelí krysímu králi, který hrozí, že převezme kontrolu nad městem.

Weil er Raphs ständige Kritik satt hat, überlässt Leo seinem Bruder die Rolle als Anführer. Kurz darauf lernt er ein wunderschönes, aber auch gefährliches Ninja-Mädchen kennen.