2047: dopo più di trent'anni dall'arrivo di diverse razze aliene, la città di Defiance è l’ultimo baluardo di pace ed equilibrio sulla Terra. La Terra è stata devastata da una guerra tra razze aliene: Jeb Nolan giunge con la figlia adottiva a Defiance, dove la pace è compromessa dalle continue tensioni tra le etnie della città. Dopo aver individuato il traditore, responsabile della distruzione delle difese cittadine, la popolazione si prepara alla battaglia. Nolan cerca l’unica arma in grado di salvare tutti.

Nolan e Irisa scoprono la durezza delle leggi dei Castihan e si oppongono a quella che ritengono un’ingiusta condanna. Intanto un nuovo pericolo minaccia la vita degli abitanti della città.

Un uomo viene brutalmente ucciso da un hellbug, un feroce insetto gigante. Ben presto si scopre che si tratta di un omicidio: Nolan prova a risolvere il caso grazie alle visioni di Irina.

Kenya, la sorella di Amanda, viene rapita dopo aver scoperto un traffico illegale di prigionieri. Nolan si mette sulle sue tracce, ma ha bisogna necessariamente dell'aiuto di Datak.

Nolan deve condurre Rynn in prigione e proteggere Amanda in viaggio per affari, ma il loro mezzo viene preso d'assalto dai banditi. Intanto Irina si trova faccia a faccia con il suo passato.

Un vecchio compagno d'armi di Nolan, che ora fa il cacciatore di taglie, giunge a Defiance per catturare un trafficante Castithan. Il fuggitivo si rivelerà una grave minaccia per la città.

Defiance è colpita da una pioggia di detriti che costringe gli abitanti a stare in casa. Irisa, dopo aver avuto delle visioni, va da Sukar che è sotto l'influenza di una forza misteriosa.

Nolan ritrova l'astronauta Gordon McClintock in una navicella Votan precipitata appena fuori città.

A Defiance scoppia un'epidemia mortale: le tensioni salgono quando gli Irathient, considerati portatori dell'infezione, vengono isolati.

Mentre si festeggia il matrimonio tra Alak e Christie, nelle pareti del NeedWant viene ritrovato il cadavere di un uomo.

Nolan viene coinvolto in un incidente alla vigilia delle elezioni.