Brigadira Younga i većinu njegovog vojnog osoblja zarobili su pripadnici Lucijanskog saveza. Dannic (Ian Butcher) ih želi ubiti, ali ga Varro (Mike Dopud), njegov lucijanski suborac, nagovori da ih umjesto toga pošalje u izgnanstvo. Dannic pristane i kroza zvjezdana vrata ih pošalje na negostoljubivi, stjenoviti planet. Ondje im se ubrzo pridruže Varro i njegovi ljudi, koje su proglasili izdajnicima te ih i same izgnali. Kad se počne primicati smrtonosna električna oluja, svi moraju surađivati kako bi našli zaklon i preživjeli. Dr. Rush, Brody, Chloe i Eli zatvorili su se u hidroponijskom laboratoriju i uspjeli preuzeti kontrolu nad nekim funkcijama broda. Dr. Rush smisli rizičan plan kojim želi prisiliti Varru i Savez da se predaju. Dok ozlijeđena poručnica Johansen leži u bolnici, njezina podsvijest posjeti poznato mjesto na kojem dozna nešto uznemirujuće.

Everett and the crew continue their efforts to save Destiny while holding off the Lucian Alliance invaders.

Le colonel Young et la majeure partie des militaires sont tenus en joue par les membres de l'Alliance luxienne et sont obligés de traverser la porte des étoiles vers une planète rocailleuse et inhospitalière. Au moment où une tempête électrique mortelle commence à sévir, les ravisseurs et les otages doivent s'aider pour survivre.

Pendant ce temps, Rush, Brody et Chloe s'enferment dans le laboratoire hydroponique et réussissent à récupérer une partie du contrôle de l'alimentation du vaisseau. De plus, tandis que T.J se trouve étendue dans l'infirmerie entre la vie et la mort, son subconscient visite un lieu familier d'où elle reçoit des nouvelles surprenantes.

La Destiny è ancora sotto il controllo dell'Alleanza Lucian, Telford e TJ son feriti e Kiva è moribonda. Scott e Greer riescono a proteggersi dalle radiazioni della pulsar rifugiandosi nel lato opposto della nave e si ricongiungono con Eli, si accorgono così che Chloe sta miracolosamente guarendo dalla ferita. Rush e Brody ragguagliano Eli e Chloe sui nuovi sviluppi.

Everett i załoga kontynuują wysiłki, by ocalić Przeznaczenie, powstrzymując najeźdźców z Lucian Alliance.

Everett e a tripulação continuam seus esforços para salvar a Destiny, enquanto enfrentam os invasores da Aliança Lucian

После смерти Кивы среди люцианцев возникает раскол. Пользуясь ситуацией, Раш начинает реализовывать план, который позволит смертельное излучение пульсара сделать козырем в битве за «Судьбу». Тем временем Ти-Джей оказывается на загадочной планете в другой галактике.

Luciánská aliancie stále drží kontrolu na palube Destiny. Plukovník Young je však odhodlaný loď dobyť späť. Poverí tím, ktorý vedie poručík Scott, aby vymysleli, ako prevziať kontrolu nad palubným počítačom. Keď sa tak udeje, tak jeden z nepriateľov menom Varro presviedča plukovníka Younga, aby zvyšných členov Luciánskej aliancie ušetril. Ten súhlasí a posiela na Zem pre skúsených doktorov, aby ošetrili ranených. Čoskoro sa na lodi zapína odpočet pred skokom do hyperpriestoru. Medzitým sa Tamara preberá na neznámej planéte s narodenou dcérou.

El Coronel Young y el resto de la tripulación continúan su lucha por retomar el control de la Destiny a la Alianza Lucian. Tras la muerte de su comandante, los captores obligan a los prisioneros a descender a un planeta habitable. Mientras, Rush sabotea los escudos, dejándolos a merced de la mortal radiación que sacude la nave en un osado plan para negociar el control de la nave. T.J. es herida y su bebe corre peligro.

Luciánská aliance stále drží kontrolu na palubě Destiny. Plukovník Young je však odhodlán loď dobýt zpět. Pověří tým, který vede poručík Scott, aby vymysleli, jak převzít kontrolu nad palubním počítačem. Když se tak děje, tak jeden z nepřátel jménem Varro přesvědčuje plukovníka Younga, aby zbylé členy Luciánské aliance ušetřil. Ten souhlasí a posílá na Zemi pro zkušené doktory, aby ošetřili raněné. Brzy se na lodi zapíná odpočet před skokem do hyperprostoru. Mezitím se Tamara probírá na neznámé planetě s narozenou dcerou.

Nachdem Kiva angeschossen wurde und Dannic das Kommando übernommen hat, will der nun den militärischen Teil der Crew töten. Nur noch Rush, Brody, Eli, Chloe, Scott und Greer können versuchen, das Schiff zurückzugewinnen.

Scott hadnagy és Greer őrmester életük kockáztatása árán megjavították a Végzet pajzsát, és az eltűnt Eli és Chloé is előkerült. Észreveszik, hogy Chloé súlyos sebe érthetetlen módon, rohamosan gyógyul. A harc folytatódik a Destiny irányításáért a földiek és a Lucian-szövetség között. A győzelemre - vagy a kiegyezésre - egyik félnek sincs túl sok ideje, mivel a kvazár nagyenergiájú sugárzása vészesen emészti fel a hajó védőpajzsát. A bizalmatlanság azonban gátolja a kiegyezést. Kiwa halálával a szövetségiek vezetése egy brutális és egyezkedésre nem hajlandó parancsnok kezébe kerül, akit végül saját tudósnője, Ginn lő le, a támadók pedig megadják magukat Dr. Rushnak, akinek köszönhetően a földiek sokkal előnyösebb helyzetbe kerültek, mint ellenfeleik.