La última moda de los adolescentes es "empalmar": incorporar el ADN animal a un cuerpo humano. Mientras que algunos niños solo obtienen cambios estéticos como ojos de gato, muchos optan por transformaciones más importantes. Batman investiga al Dr. Cuvier, el fundador del empalme, y descubre su plan para matar a D.A. Joven antes de que el proceso pueda ser ilegalizado. Cree Summer hace su primera aparición como la voz del compañero de clase de Terry, Max Gibson.

La amiga de Terry, Jackie, la hija adoptiva del acaudalado industrial Bill Wallace, está siendo acechada por una criatura que puede reformarse de la tierra y controlar la tierra que la rodea. Cuando un ataque revela botes de desechos tóxicos radioactivos del subsuelo, Batman intenta encontrar la conexión entre las criaturas, Wallace y el difunto padre de Jackie, el ex compañero de Wallace.

Un warcraft militar experimental realiza un aterrizaje de emergencia en medio de la nada, donde es capturado por un grupo de Jokerz que inicia un nuevo miembro. Batman y su diseñador, el Dr. Price, corren para detener a Jokerz antes de que destruyan la ciudad, y antes de que el núcleo nuclear se vuelva crítico.

Cuando el ejecutivo Robert Vance fue diagnosticado con un trastorno cerebral degenerativo, se dispuso a digitalizar su conciencia. Ahora, 35 años después, su nieto Bobby lo ha despertado antes de que su computadora se apague. Buscando un hogar temporal antes de que pueda encontrar un huésped humano, infecta el traje de Batman. Terry va tras él, esperando responder la pregunta: ¿Batman es el traje o el hombre que está dentro?

Maxine "Max" Gibson, uno de los compañeros de clase de Terry y un genio genuino, ha creado un programa de computadora para descubrir la identidad secreta de Batman. Cuando Max es el objetivo de Jokerz, ella vuelve a escribir el código para encontrar las identidades de Jokerzs, lo que solo la pone en mayor peligro. Michael Rosenbaum y Jill Eikenberry hacen sus primeras apariciones como las voces de Carter Wilson, otra de las compañeras de clase de Terry y su madre.

El Stalker, un cazador de caza mayor mejorado cibernéticamente que combina métodos tecnológicos y primitivos para acechar a presas peligrosas, viene a Gotham para cazar a las presas más peligrosas de todas: Batman. Después de su primer encuentro, el Stalker extiende la caza persiguiendo a Terry. Desafortunadamente, Terry está cuidando a su hermano menor Matt que de noche, y debe encontrar una manera de salvarse sin poner en peligro a su hermano ni revelar su identidad. Carl Lumbly hace su primera aparición como la voz del acosador.

Cuando un atrevido robo de un juego de póquer de alto riesgo entre criminales sale mal, Batman es alertado por el sonido de los disparos. Cuando llega a la escena, descubre con consternación que el ladrón no es otro que Ten, de la Royal Flush Gang. Antes de que ella se escape, Ten intenta decirle a Batman que las cosas no son lo que parecen. Debido a sus sentimientos por Ten (también conocida como Melanie Walker), Terry está convencido de que está diciendo la verdad; Bruce Wayne no se mueve tan fácilmente.

Spellbinder vuelve. El lugar para estar es VRRoom, donde los simuladores le brindan su mayor fantasía a través de la realidad virtual. Pero hay una nueva sala de juegos de realidad virtual en la ciudad, donde la simulación es aún más realista. El único problema es que los niños se están volviendo adictos, necesitan más de un escape del mundo real con cada uso, lo que lleva a un aumento de los niveles de serotonina en el cerebro y pone en coma a los niños con sobredosis. Batman tiene otro dilema, con Max insistiendo en ser un socio más activo. Las consecuencias son desastrosas: cuando acompaña a algunos niños para obtener una ventaja sobre la nueva sala de juegos, ella misma se vuelve adicta.

Batman rescata un automóvil que se encuentra fuera de control sobre la ciudad de Gotham; Cuando la familia regresa al auto, la niña se vuelve y le lanza una mirada funesta. Al día siguiente, mientras Terry intenta escribir un examen de historia, la niña aparece delante de él, suplicando ayuda. Más tarde, en Batcave, aparece de nuevo, esta vez mentalmente mostrándole una habitación de hotel donde la retienen, y sus padres le advierten que pide ayuda.

Cuando suceden cosas extrañas alrededor de la escuela, los estudiantes culpan rápidamente al fantasma de Garrison Jacobs, un estudiante que fue asesinado durante la construcción de la nueva ala de la escuela. Terry es sospechoso pero escéptico hasta que Nelson, uno de los deportistas, interrumpe una sesión de espiritismo que las chicas tienen para divertirse. Todo en el gimnasio cobra vida, amenazando con matar a Nelson hasta que Terry interviene como Batman. Cuando la popular animadora Blade más tarde recibe un misterioso mensaje del fantasma, Terry comienza a juntar las piezas.

Cuando todos los animales de Gotham comienzan a agitarse al mismo tiempo, Terry y Bruce Wayne descubren que las frecuencias de sonido más allá del oído humano son las culpables. Eso apunta a un hombre: Grito. Los animales demuestran ser la punta del iceberg cuando las personas pierden repentinamente la capacidad de comprender el habla de los demás. Shriek finalmente desactiva la interferencia, pero exige al Comisionado Gordon: la seguridad de la ciudad para la vida de Batman.

Howard Groote es uno de los compañeros de clase de Terry que no es terriblemente popular. Desesperado por la aceptación, planea una fiesta explosiva en su casa mientras sus padres están lejos, pero los niños populares se ríen de sus obvios intentos de frialdad. Howard anhela una novia hermosa o un coche genial para que los niños populares lo noten, y así aprovecha la oportunidad de obtener un sinteide ilegal para hacerse pasar por su novia. Sin embargo, su programación la pone demasiado protectora, poniendo en riesgo la fiesta, por no mencionar a los niños.

La ya tensa relación de Batman con la ley se pone más tensa cuando accidentalmente arruina una importante operación policial. Harta de Terry, a quien ella ve como un exaltado, el comisionado Gordon le advierte a Bruce que lo vigilará para asegurarse de que no tenga más problemas. Sus peores temores se materializan muy pronto cuando ve a Batman apaleando a Mad Stan con una de sus propias bombas.

Curaré está de vuelta y está cazando a miembros de la Sociedad de Asesinos antes de que puedan matarla por no haber asesinado al fiscal de distrito de Gotham. Mutura Bootha, el último miembro de la Sociedad que sigue en pie, solicita ayuda a Batman para detenerla, y agrega que si él cae, Batman es el siguiente en su lista. Como incentivo adicional, colocó una bomba en Gotham que explotará si no ingresa un código cada 12 horas.

Cuando el Dr. David Wheeler, un destacado psicólogo infantil, abre un nuevo rancho / hogar grupal con la promesa de ayudar a los adolescentes con problemas, los padres se suben al carro y comienzan a enviar a sus hijos lejos, incluso por las infracciones más leves. Max alienta a Terry a investigar como Batman cuando su amigo Chelsea es expulsado por escribir una carta de protesta al director.

El padrastro de Jared, Jim "Big Jim" Tate, es uno de los mejores diseñadores de armas que le gusta gastar su considerable sueldo en su familia. Cuando ha sido despedido de Wayne-Powers y se ha esforzado por trabajar, comienza a diseñar nuevas armas ilegalmente para gobiernos extranjeros. Para robar los planes y las partes que necesita, pone en uso una serie de armas no probadas y su entrenamiento de las Fuerzas Especiales y se convierte en un imparable ejército de un solo hombre: la Armería.

Ian Peek es un periodista de locos que obtiene imágenes de lugares que parecen imposibles, sin importar cuán estricta sea la seguridad. Cuando hay una perturbación en el ayuntamiento durante una reunión secreta entre un testigo del crimen organizado y el fiscal de distrito, Batman se encuentra con un hombre que puede pasar la materia sólida a voluntad. En poco tiempo, pone dos y dos juntos y se da cuenta de que este nuevo villano es Peek. Confrontar a Peek, sin embargo, lo lleva a usar su poder para descubrir el secreto de Bruce y Terry, y amenaza con exponerlos en vivo al aire.

El maestro de Estudios Familiares de Terry le da a la clase una tarea: para aprender sobre las responsabilidades de la paternidad, tienen que cuidar un huevo. Al ejercicio familiar se le da un giro de alta tecnología: cada "eggbaby" tiene sensores que registran la cantidad de atención que recibe y un sistema de retroalimentación computarizado hace que se arruine, llore y rie como un bebé real.

Terry comienza a sospechar cuando su profesor de biología comienza a actuar de manera extraña. El extraño comportamiento culmina en una persecución maníaca y un tiroteo con agentes federales después de la escuela, lo que lo lleva a involucrarse como Batman. Cuando la comisionada Gordon y sus hombres encuentran a la maestra amordazada y atada en su casa, la verdad sale a la luz: un sintetizado inteligente llamado Zeta anda suelto. Diseñado para el sigilo y el asesinato, tiene la capacidad de disfrazarse como cualquier persona que usa un generador holográfico.

El atleta de secundaria del instituto Nelson, sin saberlo, contrabandea un frasco de vidrio con un fluido verde desconocido en Gotham, que se incauta en la aduana. En el estacionamiento, es atacado por el acosador, quien exige saber el paradero del frasco. Batman interfiere con el vuelo de Stalker, pero a su vez es detenido por el agente Bennet, quien le dice que Stalker los está ayudando a rastrear a Falseface, un mercenario que cambia de identidad y que trabaja para Cobra, una organización secreta que mantiene a Gotham como rehén con un arma química horrible. A pesar de sus dudas, Batman se une a Stalker para encontrar Falseface y detener los planes de Cobra.

Cuando Batman consigue un atraco en el banco por la noche, se sorprende al ver que los cuatro punks de apariencia ordinaria tienen mejoras cibernéticas caras, y peligrosas. Cuando uno de los criminales deja un servomotor dañado, Bruce Wayne lo reconoce como la obra del hombre que creó algunas de las piezas para el traje de Batman, el Dr. Corso, quien se especializa en prótesis. Después de enfrentarse al médico, Batman descubre que el Dr. Corso se ve obligado a ayudar a los ladrones porque han secuestrado a su esposa, amenazando con matarla si no los mejora como piden.

Uno de los mejores juegos de arcade de realidad virtual es Sentries of the Last Cosmos. El compañero de clase de Max y Terry, Corey Cavaleri, ama el juego, a veces mejor que la vida real. Cuando supera el récord histórico de la arcada, Corey es convocado a la propiedad aislada Sentrycroft por el creador del juego, Simon Harper. Allí, él y otros dos niños se convierten en Centinelas de la vida real, completos con espadas de fuego y discos voladores.

Un vigilante encapuchado que se hace llamar Payback, armado con un láser parecido a un látigo, ha estado aterrorizando a la gente con el pretexto de ayudar a los niños de la ciudad. Bruce Wayne descubre un vínculo entre dos de los niños y el Centro de Consejería Juvenil de Gotham. Cuando la computadora del Centro se muestra inaccesible, Terry tiene que ingresar al Centro con el pretexto de estar insatisfecho con su tratamiento por parte de Bruce. Sin embargo, cuando su impulsividad posterior como Batman lo mete en el agua caliente con Bruce, él se desahoga en su próxima sesión en el centro, y sin quererlo, establece a Bruce como un objetivo para el reembolso.

Después de una noche rara con sus amigos, Terry sigue una figura sospechosa en el metro. Todos están preocupados cuando no reaparece a la mañana siguiente, y Bruce Wayne se encarga de encontrarlo. Cuando él le pregunta a Max sobre el último paradero de Terry, ella insiste en venir, a pesar de sus protestas. Mientras tanto, Batman se despierta en un túnel subterráneo bajo la mirada hostil de un niño, un fugitivo que vive en los túneles. El chico quiere a Batman fuera de su territorio tan pronto como sea posible, y trata de ayudarlo a salir.

Mientras Terry anda por ahí caminando con Ace, el perro de Bruce Wayne, Ace ataca salvajemente a un hombre de aspecto sospechoso en la calle y luego huye. Cuando Bruce encuentra el número de serie en la pistola del hombre, descubre que no es otro que Ronny Boxer, un antiguo proveedor de deportes ilegales, incluidos los deportes con perros. Boxer también es el antiguo dueño de Ace; Bruce lo recibió cuando la policía arrestó a la cuadrilla de peleas de perros de Boxer. Mientras Terry se encubre para acercarse a Boxer, Bruce busca a Ace, mientras se pregunta exactamente qué le hizo Boxer a Ace en el pasado.